让学生在了解刘院士的事迹和研究过程中 体会海洋研究的不易,激发爱国爱海洋的精神 培养民族自豪感 人类在不断地探寻对海洋的认知,同时其河 第讲 动也对海洋生物带来极大的影响,随着人类对海 洋生物的肆意捕捞,以往常见的或是主要的海洋 章小组 生物遭通了灭顶之灾.本章主要结合典型案例和 第讨 授课教师个人经历,向学生讲述海洋生物保护日 工作的艰辛,教育学生更好地保护我们赖以生 节 观 的家园以及我们的伙伴,更加热爱属于我们共问 视频 的海洋世界。 实例:中华白海豚的保护 从曾经终年可见到仅存4000余头,作为过 学河口生态系统食物链金字塔尖的生物,白海 这一生态系统指示物种的落寞”,也给围填海 涉海工程敲响了警钟。 白海豚属于鲸类的海豚科,是与大能猫、华 南虎属同级别的珍稀濒危物种。在厦门湾,白消 那曾终年可见。但上世纪90年代,在涛洋 科研人员对厦门海域白海豚的数量进行大规粉 摸底调查。数据显示,该海域白海豚的数量缩减 为仅60头左右。为深入了解我国白海豚分布情 况。海洋三所相关人员银转浙江、福建、广东 海南、广西等地沿海,通过咨询渔民、目视观买 拍照、声学方法等手段,开展了我国首次比较全 面的白海豚分布调查,基本勾勒出白海豚分布 图。但即使在种群最多的珠江口海域,白海豚的 数量也仅为2500头左右。 从2009年开始,海洋三所联合厦门市海弹 与海业局等单位,通过调查踪,建立起了厦 湾中华白海豚个体识别数据库。要保护白海豚 关键是加强对悟息地保护,特别是要加强涉海士 程对白海豚及其栖息地的影响评价。目前正在开 展的工作,是以现有的海洋资源和生态环境条: 为基础,根据厦门湾现有的渔业资源及空间 布,开展厦门湾白海豚承载力调查,并通过微 料、重金属、有机污染物等监测,全面评估白海 豚及其柄息地环境的健康状况,为保护白海豚提 供基础数据资料。 六、参考敕材和阅读书目 参考散材: 自编教材,《海洋生物地理学》 阅读书目: 23
23 让学生在了解刘院士的事迹和研究过程中, 体会海洋研究的不易,激发爱国爱海洋的精神, 培养民族自豪感。 2 人类在不断地探寻对海洋的认知,同时其活 动也对海洋生物带来极大的影响。随着人类对海 洋生物的肆意捕捞,以往常见的或是主要的海洋 生物遭遇了灭顶之灾。本章主要结合典型案例和 授课教师个人经历,向学生讲述海洋生物保护的 工作的艰辛,教育学生更好地保护我们赖以生存 的家园以及我们的伙伴,更加热爱属于我们共同 的海洋世界。 实例:中华白海豚的保护 从曾经终年可见到仅存 4000 余头,作为近 岸河口生态系统食物链金字塔尖的生物,白海豚 这一生态系统指示物种的“落寞”,也给围填海等 涉海工程敲响了警钟。 白海豚属于鲸类的海豚科,是与大熊猫、华 南虎属同级别的珍稀濒危物种。在厦门湾,白海 豚曾终年可见。但上世纪 90 年代,在海洋三所 科研人员对厦门海域白海豚的数量进行大规模 摸底调查。数据显示,该海域白海豚的数量缩减 为仅 60 头左右。为深入了解我国白海豚分布情 况,海洋三所相关人员辗转浙江、福建、广东、 海南、广西等地沿海,通过咨询渔民、目视观测、 拍照、声学方法等手段,开展了我国首次比较全 面的白海豚分布调查,基本勾勒出白海豚分布 图。但即使在种群最多的珠江口海域,白海豚的 数量也仅为 2500 头左右。 从 2009 年开始,海洋三所联合厦门市海洋 与渔业局等单位,通过调查跟踪,建立起了厦门 湾中华白海豚个体识别数据库。要保护白海豚, 关键是加强对栖息地保护,特别是要加强涉海工 程对白海豚及其栖息地的影响评价。目前正在开 展的工作,是以现有的海洋资源和生态环境条件 为基础,根据厦门湾现有的渔业资源及空间分 布,开展厦门湾白海豚承载力调查,并通过微塑 料、重金属、有机污染物等监测,全面评估白海 豚及其栖息地环境的健康状况,为保护白海豚提 供基础数据资料。 第 7 章 第 4 节 讲 授 、 小 组 讨 论 、 观 看 视频 √ √ √ √ 六、参考教材和阅读书目 参考教材: 自编教材,《海洋生物地理学》 阅读书目:
1.Timothy,R.Parsons,Masayuki Takahashi,Barry Hargrave,Biological Oceanographic Processes,Pergamon Press,1984. 2殷秀琴编,生物地理学,高等教有出版社,2014. 3 PeterCastro,.Michael E.Huber,.茅云翔译,海洋生物学(第六版),北京大学出版社, 2011. 4.Charles B.Miller,Patricia A.Wheeler,Biological Oceanography,Second Edition,Wiley Blackwell.2012 5.Keith A.Hobson,Leonard I.Wassenaar,Tracking Animal Migration with Stable Isotopes Second Edition,Academic Press.2018. 七、本课程与其他课程的联系与分工 先修课程为 每洋生物学 海洋环境生态学或生物海洋学。让同学们了解了海洋生物的组 成,海洋生态系统的概念以及海洋生物与环境之间的关系。本门课程就海洋生物的分布及 人类活动对海洋环境的影响进行深入探讨。 主撰人:方舟 审核人:李纲叶旭昌 教学院长:胡松 日期:2018年11月28日 2406033《海洋生物化学》教学大纲 裸程名称(中文/英文):海洋生物化学(Marine Biochemistry) 课程编号:2406033 学分.4 时:总学时75 学时分配:讲授学时48实验学时27 裸程负责人:王丛丛 一、课程简介 1.课程概况 海洋生物化学是为海洋、水产与生物类相关专业的本科生开设的必修课程之一。海洋生 物化学是研究海洋生物的化学组成、代谢以及生物体与海水环境间的生物化学过程的学科。 本课程主要内容包括:各类生物分子特别是生物大分子(蛋白质、酶、核酸等)的结构、性 质和功能:物质代谢过程与能量的释放、转移和储存,物质代谢和能量流动的相互联系和调 节培制:信息分子的代谢和遗传信息的传递、表达和调节:以及相关基木知识和最新知识成 果。海洋生物化学的研究有助于阐明生命起源和进化、海洋生物生产力的化学基础和生物的 活动规律,并与海洋生物资源的开发利用等有密切的联系。通过对本课程的学习,使学生等 握海洋生物化学的基本理论和基本技能,为进一步学习有关专业课程奠定生物化学知识基 础
24 1.Timothy, R. Parsons, Masayuki Takahashi, Barry Hargrave, Biological Oceanographic Processes, Pergamon Press, 1984. 2.殷秀琴编,生物地理学,高等教育出版社,2014. 3.Peter Castro, Michael E. Huber, 茅云翔译,海洋生物学(第六版),北京大学出版社, 2011。 4.Charles B. Miller, Patricia A. Wheeler, Biological Oceanography, Second Edition, WileyBlackwell. 2012. 5.Keith A. Hobson, Leonard I. Wassenaar, Tracking Animal Migration with Stable Isotopes, Second Edition, Academic Press, 2018. 七、本课程与其他课程的联系与分工 先修课程为海洋生物学、海洋环境生态学或生物海洋学。让同学们了解了海洋生物的组 成,海洋生态系统的概念以及海洋生物与环境之间的关系。本门课程就海洋生物的分布及 人类活动对海洋环境的影响进行深入探讨。 主撰人:方舟 审核人:李纲 叶旭昌 教学院长:胡松 日期:2018 年 11 月 28 日 2406033《海洋生物化学》教学大纲 课程名称(中文/英文):海洋生物化学(Marine Biochemistry) 课程编号:2406033 学 分:4 学 时:总学时 75 学时分配:讲授学时 48 实验学时 27 课程负责人:王丛丛 一、课程简介 1.课程概况 海洋生物化学是为海洋、水产与生物类相关专业的本科生开设的必修课程之一。海洋生 物化学是研究海洋生物的化学组成、代谢以及生物体与海水环境间的生物化学过程的学科。 本课程主要内容包括:各类生物分子特别是生物大分子(蛋白质、酶、核酸等)的结构、性 质和功能;物质代谢过程与能量的释放、转移和储存,物质代谢和能量流动的相互联系和调 节控制;信息分子的代谢和遗传信息的传递、表达和调节;以及相关基本知识和最新知识成 果。海洋生物化学的研究有助于阐明生命起源和进化、海洋生物生产力的化学基础和生物的 活动规律,并与海洋生物资源的开发利用等有密切的联系。通过对本课程的学习,使学生掌 握海洋生物化学的基本理论和基本技能,为进一步学习有关专业课程奠定生物化学知识基 础
Marine Biochemistry isone of the compulsory courses for the undergraduate students who major in ocean.aquaculture and biology.Marine Biochemistry is the study of the chemical composition,metabolism and biochemical processes between organisms and the marine environment The course mainly includes the structure.properties and functions of all kinds of biomolecules.especially biological macromolecules (proteins,enzymes,nucleic acids,etc.) material metabolic process and the release,transfer and storage of energy,the interrelationship and regulation of metabolism and energy flow,the metabolism of information molecule and the flow of genetics information.covering replication.transcription and translation.The study of marine biochemistry is helpful the origin offe,the chemical basis of marine biological productivity and the activity rule of biology,and is closely related to exploit and utilize the marine biological resources.Therefore,the students will master the basic theories and skills of marine biochemistry,and use the basic knowledge in future papers and research. 2.课程目标 2.1通过本课程的学习,引导学生深刻理解与认识到生物化学对阐明生命起源和进化 海洋生物生产力的化学基础和生物的活动规律的重要意义,使学生在学习过程中逐渐树 专业荣誉感: 22通衬对本门课程的学习,伸学生了解到学习海洋生物化学与海洋生物资源的开发利 用等之间密切的联系,使学生对今后即将从事专业工作内容与意义有所了解,逐渐树立职 业使命感与责任感,为其今后从事相关专业工作打下正确的思想基础: 2.3掌握组成海洋生物体基本物质的性质、结构、功能以及结构与功能之间的关系和验 证这些性质所需要的实验方法和技能 24掌握海洋生物体内各种基本物质在生命活动中进行的各种合成、分解代谢以及各种 物质在代谢过程中相互联系、相互转换的规律,并掌握研究这些内容的实验方法和技能: 25而村理论要程与实哈部分的互补,理论联系实际地培养学生的独立里考、综合分析 能力、科学思维能力和创新意识,全面提高学生的综合素质,并培养学生科学、严谨、实事 求是的学风,为今后进一步的学习与工作打下坚实的基础。 二、教学内容 理论教学安排 散学内容 学时备注 对课程目标的支排度 21222.3242.5 第意结论 2 作业:什久是V 主要内容:生物化学的概今、分类,什么是海洋 海洋生物化 学,生物化 与海洋生 化学的贡献,生物化学与海洋生产和海洋生物健 和海洋生物 康的关系。 健康的关系 敦学目标:了解生物化学的发展历史以及海洋生 物化学在海洋生产与海洋生物健康中的地位和作 25
25 Marine Biochemistry is one of the compulsory courses for the undergraduate students who major in ocean, aquaculture and biology. Marine Biochemistry is the study of the chemical composition, metabolism and biochemical processes between organisms and the marine environment. The course mainly includes the structure, properties and functions of all kinds of biomolecules, especially biological macromolecules (proteins, enzymes, nucleic acids, etc.); material metabolic process and the release, transfer and storage of energy, the interrelationship and regulation of metabolism and energy flow; the metabolism of information molecule and the flow of genetics information, covering replication, transcription and translation. The study of marine biochemistry is helpful to elucidate the origin and evolution of life, the chemical basis of marine biological productivity and the activity rule of biology, and is closely related to exploit and utilize the marine biological resources. Therefore, the students will master the basic theories and skills of marine biochemistry, and use the basic knowledge in future papers and research. 2.课程目标 2.1 通过本课程的学习,引导学生深刻理解与认识到生物化学对阐明生命起源和进化、 海洋生物生产力的化学基础和生物的活动规律的重要意义,使学生在学习过程中逐渐树立 专业荣誉感; 2.2 通过对本门课程的学习,使学生了解到学习海洋生物化学与海洋生物资源的开发利 用等之间密切的联系,使学生对今后即将从事专业工作内容与意义有所了解,逐渐树立职 业使命感与责任感,为其今后从事相关专业工作打下正确的思想基础; 2.3 掌握组成海洋生物体基本物质的性质、结构、功能以及结构与功能之间的关系和验 证这些性质所需要的实验方法和技能; 2.4 掌握海洋生物体内各种基本物质在生命活动中进行的各种合成、分解代谢以及各种 物质在代谢过程中相互联系、相互转换的规律,并掌握研究这些内容的实验方法和技能; 2.5 通过理论课程与实验部分的互补,理论联系实际地培养学生的独立思考、综合分析 能力、科学思维能力和创新意识,全面提高学生的综合素质,并培养学生科学、严谨、实事 求是的学风,为今后进一步的学习与工作打下坚实的基础。 二、 教学内容 理论教学安排 教学内容 学时 备注 对课程目标的支撑度 2.1 2.2 2.3 2.4 2.5 第1章 绪论 主要内容:生物化学的概念、分类,什么是海洋生 物化学,生物化学的研究内容及学习方法,海洋生 物化学的发展简史、成就及发展前景,中国对生物 化学的贡献,生物化学与海洋生产和海洋生物健 康的关系。 教学目标:了解生物化学的发展历史以及海洋生 物化学在海洋生产与海洋生物健康中的地位和作 2 作业:什么是 海洋生物化 学,生物化学 与海洋生产 和海洋生物 健康的关系。 √ √ √
用,海洋生物化学与其他学科的关系,了解我因科 学家对生物化学的贡献:明确生物化学的学习 法:家握海洋生物化学的定义、主要内容 第2瓷生命的化学特征 2 作业。牛物 主要内容:生物体的化学组成如何?生命物质中 体的小分子 的元素,元素组成及其特征:生物体系中的非共价 和大分子物 作用力(4种非共价键)·生物体主要由30多 质。 元素组成,分为常量元素和微量元素:生物小分 子:水,无机盐,维生素等:生物大分子:糖类 影类、蛋白质、核酸,AP、机体能量的来源和制 移。水在生金中的作用」 教学目标:了解生命有机体的构成,生命有机体的 与无机界的区别,认识其基本化学特征,了解水 生命活动过程中的作用:理解生物大分子和生物 能量学的概念:掌握生物小分子和生物大分子的 类型、基本组成方式及丰要生物学功能,堂程生物 体系中的非共价作用力及其作用, 第3章蛋白质的结构与功能 作业:蛋白 主要内容:蛋白质在生命活动中的重要作用:蛋白 质的化学结 质分类:蛋白质的化学组成元素组成,基本结构 灿、高级结 单位氨基酸(分类、两性性和等申点等性质) 构以及结构 蛋白质的化学结构:肽的概念、 肽键的形成与性 与功能的关 质,肽链与肤单位 一级结构及其测定:蛋白质的 系 高级结构:高级结构构象(二面角,非共价健) 二级结构及其种类(@-螺旋,B折叠,B和r转角 无规卷曲),超二级结构和结构域, 三级、四级 结构和超级结构:多肽、蛋白质结构与功能的关 一级结构与功能的关系,蛋白质结构的种疾 异和分子进化,蛋白质变性与复性,蛋白质的变构 作用与血红蛋白的输氧功能:蛋白质的理化性质 教学目标:了解蛋白质对于生命活动的重要性和 分类,掌光蛋白质的化学组成(氨基龄的重典性 质)、基本结构单位和结构层次:蛋白质的理化料 质:蛋白质分离纯化和含量测定的基本原理:蛋白 质的结构与生物学功能的关系。 第4音核酸的化学结均 作业:DNA 主要内容,基因的楷令:无德尔定律,核酸的化学 的双蝶旋 组成:DNA分子的结构:核酸的 ·级结构及其 型和高级结 示方法,DNA的双螺旋模型和高级结构:RNA 构,RNA分 子的结构:RNA的二、三级结构:核酸的理化 子的结构
26 用,海洋生物化学与其他学科的关系,了解我国科 学家对生物化学的贡献;明确生物化学的学习方 法;掌握海洋生物化学的定义、主要内容。 第2章 生命的化学特征 主要内容:生物体的化学组成如何?生命物质中 的元素,元素组成及其特征;生物体系中的非共价 作用力(4 种非共价键);生物体主要由 30 多种 元素组成,分为常量元素和微量元素;生物小分 子:水、无机盐、维生素等;生物大分子:糖类、 脂类、蛋白质、核酸;ATP、机体能量的来源和转 移;水在生命中的作用。 教学目标:了解生命有机体的构成,生命有机体的 与无机界的区别,认识其基本化学特征,了解水在 生命活动过程中的作用;理解生物大分子和生物 能量学的概念;掌握生物小分子和生物大分子的 类型、基本组成方式及主要生物学功能,掌握生物 体系中的非共价作用力及其作用。 2 作业:生物 体的小分子 和大分子物 质。 √ √ √ 第3章 蛋白质的结构与功能 主要内容:蛋白质在生命活动中的重要作用;蛋白 质分类;蛋白质的化学组成 元素组成,基本结构 单位---氨基酸( 分类、两性性和等电点等性质); 蛋白质的化学结构:肽的概念、肽键的形成与性 质,肽链与肽单位,一级结构及其测定;蛋白质的 高级结构:高级结构---构象(二面角,非共价键), 二级结构及其种类(α-螺旋,β-折叠,β 和 γ-转角, 无规卷曲), 超二级结构和结构域, 三级、四级 结构和超级结构;多肽、蛋白质结构与功能的关 系:一级结构与功能的关系,蛋白质结构的种族差 异和分子进化,蛋白质变性与复性,蛋白质的变构 作用与血红蛋白的输氧功能;蛋白质的理化性质。 教学目标:了解蛋白质对于生命活动的重要性和 分类;掌握蛋白质的化学组成(氨基酸的重要性 质)、基本结构单位和结构层次;蛋白质的理化性 质;蛋白质分离纯化和含量测定的基本原理;蛋白 质的结构与生物学功能的关系。 4 作业:蛋白 质的化学结 构、高级结 构以及结构 与功能的关 系。 √ √ √ √ 第4章 核酸的化学结构 主要内容:基因的概念;孟德尔定律;核酸的化学 组成;DNA 分子的结构:核酸的一级结构及其表 示方法,DNA 的双螺旋模型和高级结构;RNA 分 子的结构:tRNA 的二、三级结构; 核酸的理化 2 作业:DNA 的双螺旋模 型和高级结 构,RNA 分 子的结构。 √ √ √ √
性质及其应用:分子大小、紫外吸收、核酸的变性 与复性、分子杂交。 教学日标:了解核酸在生命活动中的重要意义、 些理化性质及其应用:理解DNA的化学组成 RNA的种类、化学组成:掌握核DNA的结构与 生物学功能,RNA的结构与生物学功能。 第5意生物催化剂酶 作业:酶的 主要内容:酶的概念、命名、分类、酶活性和比活 特点,酶的 力的念:重点介绍酶的特点:酶的化学组成 化学组成 酵的化学本质(单体酶、寡聚酶与多酶复合体等) 酶的化学本 结合陈及其铺因子的作用维生素与铺酶:陈的 质,的结 结构与功能的关系:酶的活性中心与必需集团 构与功能的 原的激活等概念:酶的作用机理:反应活化 关系 能,过渡态与中 产物学说(锁钥学说、诱导切 学说等),酶催化机理简介:酶反应的动力学,温 度、H、酶浓度、底物浓度以及激活剂和抑制剂, 重点是米氏动力学、竞争性和非竞争性抑制作用 对酸反应速度的影响:酸活力的测定,酸活性调 反馈控制、同工,重点介绍变构调节和睛 的共价修饰调节:酶的分类与命名:酶的实际应 用。 教学目标:了解酶作为生物能化剂在生命活动中 的意义,酶的命名、分类、活性测定及在生产中的 作用:然悉酶的组成与辅酶,几种重要的酶,酶的 活力测定和分离纯化:掌握酶的特点、南的化学 质和分子结构,酶的作用机理以及酶反应的动力 学因素,酶活性的调控机理。 第6章核酸的生物学功能 作业:DNA 主要内容:DNA的生物合成:DNA的复制,DN 和RNA的生 的损伤和修复,RNA指导下的DNA合成(反向 物合 转录),多聚酶链式反应(PCR),DNA核苷南 心法则,基 的顺序测定:RNA的生物合成:转录,RNA转求 因表达的调 后加工成熟,直核生物中的转录:RNA的翻译 控。 一蛋自历的生物合成:遗传来码。核糖体,蛋白压 合成的过程:中心法则:基因表达的调控 原核 物的基因表达调控,真核生物的基因表达调控:分 子生物学技术:DNA重组技术,转基因技术,体 胞古降技术,DNA指纹技术,蛋白质工程。 教学目标:了解直核生物基因的表达调控管担 DNA重组技术的基本概念和基本过程:了解转基 因技术,体细胞克隆技术,DNA指纹技术和蛋白 质工程的基本原理。掌程DNA复制的基本过程: 反转录过程:PCR技术原理:紫握原核生物RNA 的转录过程:核酶的基本概念:三种RNA在蛋白 27
27 性质及其应用:分子大小、紫外吸收、核酸的变性 与复性、分子杂交。 教学目标:了解核酸在生命活动中的重要意义、一 些理化性质及其应用;理解 DNA 的化学组成, RNA 的种类、化学组成;掌握核 DNA 的结构与 生物学功能,RNA 的结构与生物学功能。 第5章 生物催化剂--酶 主要内容:酶的概念、命名、分类、酶活性和比活 力的概念;重点介绍酶的特点 ;酶的化学组成: 酶的化学本质(单体酶、寡聚酶与多酶复合体等), 结合酶及其辅因子的作用 维生素与辅酶; 酶的 结构与功能的关系: 酶的活性中心与必需集团, 酶原的激活等概念 ;酶的作用机理 :反应活化 能,过渡态与中间产物学说(锁钥学说、诱导切合 学说等),酶催化机理简介:酶反应的动力学,温 度、pH、酶浓度、底物浓度以及激活剂和抑制剂, 重点是米氏动力学、竞争性和非竞争性抑制作用 对酶反应速度的影响;酶活力的测定;酶活性调 节: 反馈控制、同工酶,重点介绍变构调节和酶 的共价修饰调节;酶的分类与命名;酶的实际应 用。 教学目标:了解酶作为生物催化剂在生命活动中 的意义、酶的命名、分类、活性测定及在生产中的 作用;熟悉酶的组成与辅酶,几种重要的酶,酶的 活力测定和分离纯化;掌握酶的特点、酶的化学本 质和分子结构,酶的作用机理以及酶反应的动力 学因素,酶活性的调控机理。 4 作业:酶的 特点,酶的 化学组成, 酶的化学本 质,酶的结 构与功能的 关系。 √ √ √ √ 第6章 核酸的生物学功能 主要内容:DNA 的生物合成:DNA 的复制,DNA 的损伤和修复,RNA 指导下的 DNA 合成(反向 转录),多聚酶链式反应(PCR),DNA 核苷酸 的顺序测定;RNA 的生物合成:转录,RNA 转录 后加工成熟,真核生物中的转录;RNA 的翻译— —蛋白质的生物合成:遗传密码,核糖体,蛋白质 合成的过程;中心法则;基因表达的调控:原核生 物的基因表达调控,真核生物的基因表达调控;分 子生物学技术:DNA 重组技术,转基因技术,体 细胞克隆技术,DNA 指纹技术,蛋白质工程。 教学目标:了解真核生物基因的表达调控掌握 DNA 重组技术的基本概念和基本过程;了解转基 因技术、体细胞克隆技术、DNA 指纹技术和蛋白 质工程的基本原理。掌握 DNA 复制的基本过程; 反转录过程;PCR 技术原理;掌握原核生物 RNA 的转录过程;核酶的基本概念;三种 RNA 在蛋白 2 作业:DNA 和 RNA 的生 物合成,中 心法则,基 因表达的调 控。 √ √ √ √