如果在DNA的合成反应中,除了加入4种正常的脱氧核 苷三磷酸(dNTP)外,再加入一种少量的2',3'dNTP,那 么多核苷酸链的延伸将与偶然发生但却十分特异的链终止展 开竞争,所以反应产物是一系列的长短不一的核苷酸链。 在4组独立的DNA合成反应中,分别加入4种不同的 dNTP,结果将生成4组核苷酸链,它们将分别(随机)终 止于每一个A,每一个G,每一个C,每一个T的位置上。对 这4组核苷酸链进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,就可读出序列
如果在DNA的合成反应中,除了加入4种正常的脱氧核 苷三磷酸(dNTP)外,再加入一种少量的2ˊ,3ˊ ddNTP,那 么多核苷酸链的延伸将与偶然发生但却十分特异的链终止展 开竞争,所以反应产物是一系列的长短不一的核苷酸链。 在4组独立的DNA合成反应中,分别加入4种不同的 ddNTP,结果将生成4组核苷酸链,它们将分别(随机)终 止于每一个A,每一个G,每一个C,每一个T的位置上。对 这4组核苷酸链进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,就可读出序列
在测序反应中通常设置4个反应,各反应管中同时加入一种 DNA模板和引物、DNA聚合酶I(失去5'3'外切核酸酶活 性)、其中一管中分别加入一种ddNTP(如ddTTP、dTTP) 以及其它三种dNTP(dATP、dCTP、dGTP),引物末端 用放射性核素标记,ddTTP的比例很小(1:10),因此掺入 的位点是随机的,经过适当的条件下温育,将会有不同长度 的DNA片段合成。它们都具有相同的5'末端,3'末端都因掺 入了ddTTP而以T结尾。在其它三管中同理加入相应的 ddNTP
在测序反应中通常设置4个反应,各反应管中同时加入一种 DNA模板和引物、DNA聚合酶I(失去5′ 3′外切核酸酶活 性)、其中一管中分别加入一种 ddNTP ( 如ddTTP、dTTP) 以及其它三种dNTP( dATP 、dCTP 、dGTP ),引物末端 用放射性核素标记, ddTTP的比例很小(1:10),因此掺入 的位点是随机的,经过适当的条件下温育,将会有不同长度 的DNA片段合成。它们都具有相同的5′末端,3′末端都因掺 入了ddTTP而以T结尾。在其它三管中同理加入相应的 ddNTP
引物 OH CTAAGCTCGACT 模板 dCTP,dGTP,dATP,dTTP Sanger 双脱氧测 +ddATP +ddCTP ddGTP ddTTP 序方法示 GATTCGAGCTGddA -gattcgagddc GATTCGAGCTddG GATTCGAGCddT ■-GATTCGddA -GATTddC GATTCGAddG GATddT GddA GATTCddG GAddT 意图 ddG 1 9876 40HOO 5432 4OO HH A 凝胶放射自显影图 互补链序列
Sanger 双脱氧测 序方法示 意图
5'.CACTGATGAGTCOGTGAACGAAACGG.-3 双脱氧法测序原理示意图 G T G MUHOCOH OHOOOOOHHOOHHHOOO =三
双脱氧法测序原理示意图
(二)DNA序列测定的策略 1、测序载体和引物 双脱氧链终止法测定DNA序列时,通常是将待测片段先克 隆到M13载体(如M13mp18和M13mp19)或质粒载体 (如pUC18和pUC19)。克隆于M13载体,可获得单链模 板。克隆于pUC载体,则是直接采用双链DNA作为测序模 板,待测DNA克隆到质粒载体后,通过碱变性处理重组载 体,使测序引物便于结合模板DNA
(二)DNA序列测定的策略 1、测序载体和引物 双脱氧链终止法测定DNA序列时,通常是将待测片段先克 隆到M13载体(如M13mp18和M13mp19)或质粒载体 (如pUC18和pUC19)。克隆于M13载体,可获得单链模 板。克隆于pUC载体,则是直接采用双链DNA作为测序模 板,待测DNA克隆到质粒载体后,通过碱变性处理重组载 体,使测序引物便于结合模板DNA