数值模拟导论-第十七、十八讲 分子动态学 Nicolas Hadjiconstantinou
数值模拟导论 -第十七、十八讲 分子动态学
分子动态学 分子动态学是计算经典的多体系统的平衡性和非平 衡性的一种技术 连续粒子的原子运动遵循经典的机械定律(牛顿定 律) 参考资料: 1.液体计算机模拟,MP.Aen&D. J. Tildesley, Clarendon. Oxford, 1987 2.了解分子模拟:从计算到应用,D. Frenkel and B Smit. academic Press, 1997. 3 Moldy手册
分子动态学 分子动态学是计算经典的多体系统的平衡性和非平 衡性的一种技术 *连续粒子的原子运动遵循经典的机械定律（牛顿定 律） 参考资料： 1.液体计算机模拟，M.P. Allen & D.J. Tildesley, Clarendon, Oxford, 1987. 2.了解分子模拟：从计算到应用，D. Frenkel and B. Smit, Academic Press, 1997. 3.Moldy手册
Moldy ●免费的分子动态学模拟资料压缩包可以在 CCP5程序库 (http://www.ccp5.ac.uk/librar.shtm1)e Moldy中下载,该网页中还有各种非常有用的 信息和分子模拟工具。 ● Moldy简单易用,并附有一个很好的手册可 参考帮助,我希望布置的家庭作业可以借助 Moldy来完成
Moldy z免费的分子动态学模拟资料压缩包可以在 CCP5程序库 （http://www.ccp5.ac.uk/librar.shtml）的 Moldy中下载，该网页中还有各种非常有用的 信息和分子模拟工具。 zMoldy 简单易用，并附有一个很好的手册可 参考帮助，我希望布置的家庭作业可以借助 Moldy来完成
我们为什么要研究分子动态学? 类似真实实验 1.让我们去研究和理解材料性能以便我们建立模型 2.告诉我们答案是什么,什么时候模型不存在 实例:不收敛方程 F x+dx d1 r+d1 质量守恒: (nadrdyd-)=(F1 -+ d )ard dt n=数字密度,F=流量
我们为什么要研究分子动态学？ n F = 数字密度， 流量 = 类似真实实验 1.让我们去研究和理解材料性能以便我们建立模型 2.告诉我们答案是什么，什么时候模型不存在 质量守恒： 实例：不收敛方程
af dravd-222 d Fdr dF 极限:x→0.→-+= ●该方程只有给定n和F的关系才能求解 ●实验或分子性能表明在不同条件下 an d2 方程不收敛!
极限： z该方程只有给定n和F的关系才能求解 z实验或分子性能表明在不同条件下 方程不收敛！