生物技术与人基因组计划的研究策略21
21 生物技术与人基因组 计划的研究策略
鸟枪法测序策略：Chromosome100MbRFLP10Mb1-5MbRestrictionmapClone0.5Mbmap40-300kbDNA sequenceCTAAGTCG.....TAGC22
22 测序策略：鸟枪法
(a)SequencereadsRead1CACATACACATGG测序组装Read2TCAATGGGGCTAA过程Fead3AGCACGGACTTGTCACATACACATGFead4ACACATGGAAATA8个随机测读片Fead5GGGCTAATGATTGTCAC段（10-20bp）Pead6TGATTGTCACATAPead7ATTCATGAAGCACGGARead8GTCACATACACATGATCAATGGGGUsecomputertoassembleseqJencereads计算机进行组装(b)7ATTCATGAACCACGGA3AGCACGGACTTGTCACATACACATG8GTCACATACACATGATCAATGGGG2TCAATGGGGCTAA5GGGCTAATGATTGTCAC6TGATTGTCACATACACATACACATGG4ACACATGGAAATA最后得到长72bp长片段Assembledsequence(c)ATTCATGAAGCACGGAOTTGTCAGATACACATGATCAATGGGGCTAATGATTGTCACATACACATGGAAATA23FICURE10-2
23 测序组装 过程 8个随机测读片 段（10-20bp） 计算机进行组装 最后得到长 72bp长片段
测序构建重叠群与组装GenomicDNAConstruct10xlarge-insertclonelibraryOOOOOOOBuldcontigmapSelectminimum tilingpath4121024HigeminimrmtilinawtoesrFIGURE10-3
24 Sequencing a genomic by using an overlapping clone map 测序构建重叠群与组装
构建亚克隆库(b)iaPurify3-kbfragmentsGenomicDNApreparation(c)3-kb insertPlasmidGenomicDNAvector25
25 构建亚克隆库