第十章 微生物的分类和鉴定 ◼ 目前所知道的微生物种数已超过了十万种，这还是一 个正在急剧扩大着的数字。微生物分类学(microbial taxonomy)是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成 条理清楚的各种分类单元或分类群(taxon)的科学。它 的具体任务有三 ， 即分类 (classification) 、 鉴 定 (identification)和命名(nomenclature)
第十章 微生物的分类和鉴定 ◼ 目前所知道的微生物种数已超过了十万种，这还是一 个正在急剧扩大着的数字。微生物分类学(microbial taxonomy)是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成 条理清楚的各种分类单元或分类群(taxon)的科学。它 的具体任务有三 ， 即分类 (classification) 、 鉴 定 (identification)和命名(nomenclature)
第一节 通用分类单元 ◼ 一、种以上的系统分类单元 ◼ （一）七级分类单元 ◼ 种以上的系统分类单元（taxon或category，也称分类 阶元或分类群）自上而下依次可分七级，即； ◼ 界Kingdom（拉：Regnum） ◼ 门Phylum（拉：Phylum）或Division（拉：Divisio） ◼ 纲Class（拉：Clsssis） ◼ 目Order（拉：Ordo） ◼ 科Family（拉：Familia） ◼ 属Genus（拉：Genus） ◼ 种Species（拉：Species）
第一节 通用分类单元 ◼ 一、种以上的系统分类单元 ◼ （一）七级分类单元 ◼ 种以上的系统分类单元（taxon或category，也称分类 阶元或分类群）自上而下依次可分七级，即； ◼ 界Kingdom（拉：Regnum） ◼ 门Phylum（拉：Phylum）或Division（拉：Divisio） ◼ 纲Class（拉：Clsssis） ◼ 目Order（拉：Ordo） ◼ 科Family（拉：Familia） ◼ 属Genus（拉：Genus） ◼ 种Species（拉：Species）
◼ 科级以上分类单元的名称是拉丁或希腊词源的名词、 用作名词的形容词或一个拉丁化的外来词，应是阴性、 复数并且首字母用大写。实际上，在现代细菌命名中， 科以上各分类单元都采用阴性和复数的形容词形式作 名词使用，例如Pseudomonadaceae（假单胞菌科） 等。 ◼ （二）种的概念 ◼ 在微生物尤其在原核类微生物中，种的定义是极其难 定的，至今还找不到一个公认的、明确的种的定义。 可以认为，种是一个基本分类单元，它是一大群表型 特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其它种 有着明显差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只 能用该种内的一个典型菌株（type strain）来作具体 标本，故这一典型菌株就是该种的模式种（type species）。 第一节 通用分类单元
◼ 科级以上分类单元的名称是拉丁或希腊词源的名词、 用作名词的形容词或一个拉丁化的外来词，应是阴性、 复数并且首字母用大写。实际上，在现代细菌命名中， 科以上各分类单元都采用阴性和复数的形容词形式作 名词使用，例如Pseudomonadaceae（假单胞菌科） 等。 ◼ （二）种的概念 ◼ 在微生物尤其在原核类微生物中，种的定义是极其难 定的，至今还找不到一个公认的、明确的种的定义。 可以认为，种是一个基本分类单元，它是一大群表型 特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其它种 有着明显差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只 能用该种内的一个典型菌株（type strain）来作具体 标本，故这一典型菌株就是该种的模式种（type species）。 第一节 通用分类单元
第一节 通用分类单元 ◼ 在微生物学中，至今种的范围还无法确定。由 于在微生物中，尤其在原核生物中的种只是一 大群性状极其相同的菌株的总称，所以在微生 物学中的“种”至今还只是一个抽象的概念。 在这里，具体的种是指能代表这个种的各典型 性状的一个被指定的菌株亦即模式菌株。 ◼ 随着微生物分类学的发展，人们越来越清楚地 看到种的定义应建立在遗传物质即DNA鉴定的 基础上，把DNA同源性的大小作为划分种的标 准
第一节 通用分类单元 ◼ 在微生物学中，至今种的范围还无法确定。由 于在微生物中，尤其在原核生物中的种只是一 大群性状极其相同的菌株的总称，所以在微生 物学中的“种”至今还只是一个抽象的概念。 在这里，具体的种是指能代表这个种的各典型 性状的一个被指定的菌株亦即模式菌株。 ◼ 随着微生物分类学的发展，人们越来越清楚地 看到种的定义应建立在遗传物质即DNA鉴定的 基础上，把DNA同源性的大小作为划分种的标 准
第一节 通用分类单元 ◼ 在讨论种的问题时，还要介绍一个“新种” （sp.nov.或nov.sp.，是species nova的缩 写）的概念。如果某分类工作者在实际工作中 获得并鉴定了一个新种，当他按命名规则进行 命名并发表时，应在其学名后附上“sp.nov.” 符号。例如，由我国学者筛选到的谷氨酸发酵 新 菌 种 Corynebacterium pekinense sp.nov.AS1.299（北京棒杆菌AS1.299，新 种）和C.crenatum sp.nov.AS1.542（钝齿棒 杆菌AS1.542，新种），等等
第一节 通用分类单元 ◼ 在讨论种的问题时，还要介绍一个“新种” （sp.nov.或nov.sp.，是species nova的缩 写）的概念。如果某分类工作者在实际工作中 获得并鉴定了一个新种，当他按命名规则进行 命名并发表时，应在其学名后附上“sp.nov.” 符号。例如，由我国学者筛选到的谷氨酸发酵 新 菌 种 Corynebacterium pekinense sp.nov.AS1.299（北京棒杆菌AS1.299，新 种）和C.crenatum sp.nov.AS1.542（钝齿棒 杆菌AS1.542，新种），等等