第五节:代谢网络 0似一、酵母中控制半乳糖利用的代谢网络 糖元合成 半乳糖代谢模型 GAL10 PCL10 UDP UDP- HXTs Glucose Galactose 糖酵解 Galactose Galactose (out) (in) Galactose-1-P Glucose-.l-p、」 Glucose-6-P GAL2 GALI GALT GALS 蛋白质代谢 RPA49 GALA YPS3 GAL80 GAL6 酶促反应 功能未知 GAL3 膜转运 MLF3 转录,激活 YMR318C 蛋白激活 核心调控机制 YELO57C 蛋白抑制 1 7
第五节:代谢网络 1 7 一、酵母中控制半乳糖利用的代谢网络
第五节:代谢网络 000以(-一) 网络的遗传和环境扰动 (二)网络模型的构建和可视化显示 (a) (b) RAD52 SER3 GAL2 GAL7 SER33 GCYI RF砂 GALIO TRP NL311 RFAI TRP2 GAL3 MET14 R) GAL4 ADE4 GALII HIS4 FCY MIGI ARGI GAL8O BASI SRPI PHO13 ADES GCN4 MELI GALI 相互作用 蛋白质-DNA HIS3 蛋白质蛋白质 HIS7 ILV2 表达变化lg) TRP4 -3-2-1012 3 6
第五节:代谢网络 1 8 (一)网络的遗传和环境扰动 (二)网络模型的构建和可视化显示
第五节:代谢网络 0似(三)观察与预测的比较 wi+gal Vs. +gal:△s.wn -gal;△ys.wr OBSERVED PREDICTED 易 d d d (logratio) [E8+IM ◆increase 105 晨量 8105 decrease -3 0 3 GALI 半乳糖激酶 GAL2 半乳糖透性酶 GAL3 ●●● 诱导:释放GAL80抑制 GAL4 转录激活因子 GAL5 (PGM2)葡萄糖磷酸变位酶 GAL6 (LAP3)GAL的调节因子? GAL7 半乳糖转移酶 GAL1O UDP半乳糖差向异构酶 GAL80 GAL4激活的抑制子 (四)通过附加扰动修正模型 9
第五节:代谢网络 1 9 (三)观察与预测的比较 (四)通过附加扰动修正模型