第一节：转录组学概述 000以 前言 replication (DNA->DNA) DNA Polymerase 基因组学 Dy①d DNA transcription (DNA->RNA) RNA Polymerase RNA 转录组学 translation (RNA->Protein) Ribosome 00Protein 蛋白质组学 from en.wikipedia 中心法则：遗传信息传递 2
第一节：转录组学概述 2 前言 from en.wikipedia 基因组学 转录组学 蛋白质组学 中心法则：遗传信息传递
第一节：转录组学概述 0例0M以 转录本测定研究 日 Experiment- Hybridization- Sequencing- Advanced Single- based based based seq molecule seq ·Northern ·Microarray SAGE ·NGS ·Pacbio blot ·CAGE ·3GS ·ONT RT-PCR ·MPSS ·Single cell 转录组学研究技术革新 3
第一节：转录组学概述 3 转录本测定研究 Experimentbased • Northern blot • RT-PCR Hybridizationbased • Microarray Sequencingbased • SAGE • CAGE • MPSS Advanced seq • NGS • 3GS • Single cell Singlemolecule seq • Pacbio • ONT 转录组学研究技术革新
第一节：转录组学概述 00八应用和最新进展 0.5 Cp 0.4 盖 0.3 Neurons 0.2 RGs 0.1 差异表达 可变剪切 共表达网络 转录调控网络 4
第一节：转录组学概述 4 应用和最新进展 差异表达 可变剪切 共表达网络 转录调控网络
第二节：试验设计和测序流程 OOM\RNA测序(RNA-sequencing) AARAAAA西 TTTI TGATAGATC Reverse transcriptase GGCGATCG TAGCTGTAC AAAAAAA四 TTTT RNA CDNA Library Sequencing Data isolation amplification preparation analysis from GATC Biotech DNA 1.试验设计 2.测序流程 3.数据分析 4.验证实验 5
第二节：试验设计和测序流程 5 RNA测序（RNA-sequencing） 1.试验设计 2.测序流程 3.数据分析 4.验证实验 from GATC Biotech
第二节：试验设计和测序流程 000八 试验设计 问题导向型 数据导向型 生物学重复(3-5个) 数据异质性（平台、个体差异） 样本提取（分类和保存） 确定分析流程 测序深度（简单基因表达分析需5M以 上reads,小RNA至少30M) 分析工具选用 文库构建（链特异性非特异性） 测序策略（单端和双末端） 测序平台（读长、通量和准确率等） 6
第二节：试验设计和测序流程 6 问题导向型 生物学重复（3-5个） 样本提取（分类和保存） 测序深度（简单基因表达分析需5M以 上reads，小RNA至少30M） 文库构建（链特异性非特异性） 测序策略（单端和双末端） 测序平台（读长、通量和准确率等） 数据导向型 数据异质性（平台、个体差异） 确定分析流程 分析工具选用 试验设计