目 第四节:基因表达调控网络 00M0队 表9-1表达矩阵M o 5 wt 3.750 3.750 8.939 0.078 4 3.750 8.769 0.011 a 3.750 8.769 0.086 3.750 3.750 5.476 3.750 3.750 8.939 表9-2基因间相互作用的交互矩阵 Co 41 42 43 + + + 2
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第四节:基因表达调控网络 00八 (二)网络模型 基因表达的方程表示: dv" dr =Re(∑wf+ir)ia 式中,°为基因a的表达水平;R,为从基因a合成的最大速率;g(u)为一个Sigmoidal函数 8()=(1/2)(u/、√+1方w为一个描述基因调控系数的连接权重矩阵;∑w描述整体 的激活与抑制关系;h总结了普遍的转录因子a上的效果;2。为基因a的产物RNA降解速率。 2.0 dv1dt-1.5g(0)-0.2v° 0.8 1.3 dv'/dt=1.5g(0)-0.2v dv21d1=1.8g(0.8v+0.8v)-0.2v2 dv3/d1=1.1g(2.0v°-1.32-0.2v 0.8 3
第四节:基因表达调控网络 1 3 (二)网络模型 基因表达的方程表示:
第四节:基因表达调控网络 个以二、海胆cis-基因调控网络 反式逻辑定义蛋白质相互作用因子与它们控制的基因 (或网络中其他转录因子)的相互作用。相反,顺式 逻辑定义通过其状态(束缚或无束缚因子)产生特殊 基因表达时空模式的启动子序列之间的精确关系。 1 4
第四节:基因表达调控网络 1 4 二、海胆cis-基因调控网络 反式逻辑定义蛋白质相互作用因子与它们控制的基因 (或网络中其他转录因子)的相互作用。相反,顺式 逻辑定义通过其状态(束缚或无束缚因子)产生特殊 基因表达时空模式的启动子序列之间的精确关系
第四节:基因表达调控网络 000 -100bp E DC B A Bp (-2300) SpGCFI CY CBCB CG G 正调节器 B 促进胚胎晚期中肠区域表达 调控表达的后期增长 激活开关从而独占输入 在相邻外胚层中抑制表达 E A 促进早期胚胎植物板区域表达 DC 在骨骼形成间充质细胞中抑制表达 与基础转录装置沟通的唯一调节子 协作帮助调节子B的输入扩增 整合FE,DC的抑制信号转导 1 5
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屋 第四节:基因表达调控网络 00M0 调节子B 调节子A BP CY CBI UI R CB2 CGI P OTX Z CG2 SPGCFI CG3 CG4 il i4 i3 5 i7 9 ←-F,EDC 2 i8 i0 i12 6
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