生物信息学 普通高等教育 “十二五”规划教材 生物信息学 Bioinformatics 。年年 第四章:蛋白质结构分析
第四章:蛋白质结构分析 普通高等教育 “十二五”规划教材 生物信息学 Bioinformatics
第一节蛋白质结构组织层次 一、蛋白质的结构特征 (一)一级结构 蛋白质的一级结构(primary structure)是指多肽链 的氨基酸残基的排列顺序。 A链 S S Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Ala-Ser-Val-Cys-Ser-Leu-Tyr-GIn-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn S S B链 S Phe-Val-Asn-GIn-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Try-Leu-Val-Cys-Gly Glu Ala-Lys-Pro-Thr-Tyr-Phe-Phe-Gly-Arg 图4-1人胰岛素的一级结构
第一节 蛋白质结构组织层次 一、蛋白质的结构特征 (一)一级结构 蛋白质的一级结构(primary structure)是指多肽链 的氨基酸残基的排列顺序
(二)二级结构 蛋白质二级结构(secondary structure)是指多肽链 主链原子借助于氢键沿一维方向排列成具有周期性 的结构构象,是多肽链局部的空间结构(构象)主 要有0螺旋、B折叠、B转角、无规卷曲等形式。 1、0螺旋 o螺旋(o-heliⅸ)是蛋白质中最常见、最典型、含 量最丰富的结构元件,是一种重复性结构。 0螺旋的结构特征
(二)二级结构 蛋白质二级结构(secondary structure)是指多肽链 主链原子借助于氢键沿一维方向排列成具有周期性 的结构构象,是多肽链局部的空间结构(构象)主 要有α螺旋、β折叠、β转角、无规卷曲等形式。 1、α螺旋 α螺旋( α -helix)是蛋白质中最常见、最典型、含 量最丰富的结构元件,是一种重复性结构。 α螺旋的结构特征
0-碳 图4-2a螺旋结构示意图(Garrett and Grisham,l999)
2、B折叠 平行式(parallel)、反平行式(antiparallel) 图4-3两种不同的3折叠结构
2、β折叠 平行式(parallel)、反平行式(antiparallel)