武汉大学wunan UniversityRFLP标记的主要特点是1遍布于整个基因组,低拷贝序列无表型效应,不受发育阶段及器官特异性限制:(3)共显性,可区分纯合子和杂合子,(4)结果稳定、可靠;(5)DNA需要量大,检测技术繁杂,难以用于大规模的育种实践中。用途:RFLP主要用于群体水平和系统发育研究上进行:个体识别:绘制遗传图谱;目的基因定位;检测群体内或群体间序列差异程度:辅助育种等
RFLP标记的主要特点是: (1)遍布于整个基因组,低拷贝序列; (2)无表型效应,不受发育阶段及器官特异性限制; (3)共显性,可区分纯合子和杂合子; (4)结果稳定、可靠; (5)DNA需要量大,检测技术繁杂,难以用于大规模 的育种实践中。 用途:RFLP主要用于群体水平和系统发育研究上 进行:个体识别;绘制遗传图谱;目的基因定位; 检测群体内或群体间序列差异程度;辅助育种等
武汉大学wunanUniversity(2)SsR(simple sequence repeats)标记简单重复序列多态性,又称微卫星DNA多态性,即由二核苷酸,三核苷酸或四核苷酸串联重复的拷贝数目不等而出现的多态现象
⑵ SSR(simple sequence repeats)标记: 简单重复序列多态性,又称微卫星DNA多态性,即 由二核苷酸,三核苷酸或四核苷酸串联重复的拷贝 数目不等而出现的多态现象
武生DirectionofcurrentPositionsofcleavagesitesSmallerDNALargerDNAfragmentsfragmentsSSRDuplexDNAmoleculesPositionofbandinDNAgelTandemrepeatsofaDNAsequenceFigure 2.28 In a simple tandem repeat polymorphism (STRP),the alleles in a population differ in thenumberof copiesofashortsequence(typically2-6obp)thatis repeated intandem alongtheDNAmolecule.This example shows alleles in which the repeat number varies fromI to 1o.Cleavage at
SSR
Minisatellitenumberdiffers betweenindividualgenomes武汉大学ParentsBvirtualtextwww.ergito.comwunanUniversityRepeatnoGGGCAGGAXGCCCGTCCTXCCleavageCleavageParent 1同源染色体等位基因典型的孟德尔9Parent2式遗传:共显5同源染色体等位基因性(两个亲本子代Progeny的性状在一个同源染色体等位基因个体中同时出现,没有显隐同源染色体等位基因关系)287同源染色体等位基因Figure 4.27 Alleles may differin the number of repeats at a minisatellite locus,sothacleavage on either side generates restriction fragments that differ in length.By usingaminisatellite with alleles that differbetweenparents, thepattern of inheritance can befollowed
典型的孟德尔 式遗传;共显 性(两个亲本 的性状在一个 个体中同时出 现,没有显隐 关系)。 同源染色体等位基因 同源染色体等位基因 同源染色体等位基因 同源染色体等位基因 同源染色体等位基因 子代
武汉大学wunan UniversitySSR技术的优点是:1在基因组中随机分布,检测的多态性频率高;2PCR特异引物,重复性好;(3)共显性,操作相对简单。问题是在没有进行基因组DNA测序的生物中:(1)SSR需要测序和设计引物,因而需要大量的人力物力和时间;2)另外其种属特异性强,开发所需的费用高昂,因此一些实验室进行了合作,共同开发微卫星引物
SSR技术的优点是: (1)在基因组中随机分布,检测的多态性频率高; (2)PCR特异引物,重复性好; (3)共显性,操作相对简单。 问题是在没有进行基因组DNA测序的生物中: (1)SSR需要测序和设计引物,因而需要大量的人力、 物力和时间; (2)另外其种属特异性强,开发所需的费用高昂,因 此一些实验室进行了合作,共同开发微卫星引物