武汉大学wunan University（一）、植物基因组遗传图谱构建的基本步骤、选择DNA分子标记2、亲本的选配3、分离群体类型的选择与构建作图群体4、群体大小的确定5、连锁图谱制作的统计学原理6、DNA标记分离数据的处理与构建标记的遗传图谱
（一）、植物基因组遗传图谱构建的基本步骤 1、选择DNA分子标记 2、亲本的选配 3、分离群体类型的选择与构建作图群体 4、群体大小的确定 5、连锁图谱制作的统计学原理 6、DNA标记分离数据的处理与构建标记的遗传图谱
武汉大学wunan University1、选择DNA分子标记DNA分子标记：也称DNA多态性标记，是DDNA水平上遗传多态性的直接反映，有多种DNA分子标记：RFLP（Restriction fragment length polymorphism）RAPD（RandomamplifiedpolymorphicDNA）SCAR(Sequencecharacterizedamplified region）STS(Sequence tagged site)SSCP(Single strand confirmationalpolymorphism）SSR(Simplesequencerepeat)ISSR(Inter simple sequence repeat)AFLP（Amplifiedfragmentlengthpolymorphism）CAPS(Cleaved amplified polymorphic sequence）SNP(Singlenucleotidepolymorphism)InDel(insertion-deletion)
1、选择DNA分子标记 DNA分子标记:也称DNA多态性标记，是 DNA水平上遗传多 态性的直接反映，有多种DNA分子标记： √ RFLP （Restriction fragment length polymorphism ） RAPD （Random amplified polymorphic DNA ） SCAR （Sequence characterized amplified region） STS （Sequence tagged site ） SSCP （Single strand confirmational polymorphism ） √ SSR （Simple sequence repeat） ISSR （Inter simple sequence repeat ） AFLP （Amplified fragment length polymorphism） CAPS （Cleaved amplified polymorphic sequence） √ SNP （Single nucleotide polymorphism ） √ InDel (insertion-deletion)
武汉大学wunan University共显性的DNA分子标记通常我们选择具有共显性的DNA分子标记用于遗传图谱的制作。用做双亲的、它们间的DNA序列的多态性是发展分子标记的基础，基于PCR的共显性标记是常用的标记类型通常共显性标记有四种类型RFLP(RestrictionfragmentlengthpolymorphismSSR(Simple sequencerepeat)SNP(SinglenucleotidepolymorphismInDel(insertion-deletion)
共显性的DNA分子标记 通常我们选择具有共显性的DNA分子标记用于遗传图谱 的制作。 用做双亲的、它们间的DNA序列的多态性是发展分子标 记的基础，基于PCR的共显性标记是常用的标记类型 通常共显性标记有四种类型： RFLP （Restriction fragment length polymorphism ） SSR （Simple sequence repeat） SNP （Single nucleotide polymorphism ） InDel (insertion-deletion)
武漢大学wunanUniversity(1)RFLP标记(restrictionfragmentlengthpolymorphism：同一物种的亚种、品系或个体间基因组DNA受到同一种限制性内切酶作用而形成不同的酶切图谱的现象，称为限制性片段长度多态性（RFLP）这是由于基因组DNA某一位点上的变异有可能引起该位点特异性的限制性内切酶识别位点的改变，包括原有位点的消失或出现新的酶切位点，致使酶切片段长度随之发生变化而产生
⑴ RFLP标记 (restriction fragment length polymorphism)： 同一物种的亚种、品系或个体间基因组DNA 受到同一种 限制性内切酶作用而形成不同的酶切图谱的现象，称为 限制性片段长度多态性（RFLP) 这是由于基因组DNA某一位点上的变异有可能引起该位点 特异性的限制性内切酶识别位点的改变，包括原有位点的消失 或出现新的酶切位点，致使酶切片段长度随之发生变化而产生
武溪大学wunan University对RFLP的检测主要是用Southern杂交的方法进行基本流程：组织或细胞一基因组DNA一→限制性内切酶消化→琼脂糖凝胶电泳一→印迹转移至滤膜一→预杂交一→加入探针一杂交一洗膜一放射自显影
对RFLP的检测主要是用Southern杂交的方法进行 基本流程： 组织或细胞→基因组DNA→限制性内切酶消化 →琼脂糖凝胶电泳→印迹转移至滤膜→预杂交 →加入探针→杂交→洗膜→放射自显影