分子中分支用()表示;用/和\表示双键顺反异 构;对映异构:手性原子用[表示,@表示反时 针,@a表示顺时针 异丁酸(CH3)2CHCO2HCC(C)C(=OO 反式二溴乙烯 Br/C=C/Br或BrC=CBr 顺式二溴乙烯 BrC=C/Br或Br/(C=CBr L-丙氨酸 NC@OHICCEO)O D丙氨酸 NICOHICCCOO
11 • 分子中分支用()表示;用 / 和 \ 表示双键顺反异 构; 对映异构:手性原子用[ ]表示, @表示反时 针,@@表示顺时针 异丁酸(CH3)2CHCO2H CC(C)C(=O)O 反式二溴乙烯 Br/C=C/Br 或 Br\C=C\Br 顺式二溴乙烯 Br\C=C/Br 或 Br/C=C\Br L-丙氨酸 N[C@@H](C)C(=O)O D-丙氨酸 N[C@H](C)C(=O)O
二)以二维形式表示 用图表示
12 (二)以二维形式表示 • 用图表示 C C C C C C C C C N H H O H O
用矩阵和连接表表示 1234567 原子列表 毯列表 10101110 21010001 原子原子 键级 30100000 HH 1000000 61000000 237456 70100000
13 • 用矩阵和连接表表示
(三)以三维形式表示 1、直接坐标法 用笛卡尔坐标( Cartesian coordinates)直 接存储每个原子的三维坐标(x,yz H1-0.059-0.0420.000 C1-0.118-0.681-0.909 H20.9050.5150.000 H3-0.9050.6810.000 H4-0.118-0.6810.909
14 1、直接坐标法 • 用笛卡尔坐标(Cartesian coordinates)直 接存储每个原子的三维坐标(x, y, z) (三)以三维形式表示
2、内坐标法 每个原子位置以与其他原子间的3个相对位 置关系表示—距离、夹角、二面角 1,2-二氯乙烷 8 8 r1和r2为键长,α为键角,τ为扭转角
15 2、内坐标法 • 每个原子位置以与其他原子间的3个相对位 置关系表示——距离、夹角、二面角 r1和r2为键长,α为键角,为扭转角 1,2-二氯乙烷