第5章药物发现的虚拟筛选方法 Virtual screening in drug discovery VIRTUAL SCREEN Target protein SCREEN HIGH-THROUGHPUT SCREEN molecule library Test high-scoring Test all nolecules olecules
1 第 5章 药物发现的虚拟筛选方法 Virtual screening in drug discovery
第一节概述 化合物库 匹配 计算 搜寻标准 命中结构Hits (提问结构) 搜寻标准 搜寻的基本要素化合物库 计算方法
2 匹配 计算 命中结构 Hits 第一节 概述 搜寻标准 (提问结构) 搜寻的基本要素 搜寻标准 化合物库 计算方法
根据搜寻标准和计算方法,分为二类基本方法: 直接法 =基于靶点结构 基于分子对接( docking-based) 间接法 =基于配体相似性( ligand similarity- based) =基于药效团( pharmacophore- based)
3 根据搜寻标准和计算方法,分为二类基本方法: 直接法 = 基于靶点结构 = 基于分子对接(docking-based) 间接法 = 基于配体相似性(ligand similarity-based ) = 基于药效团(pharmacophore-based)
合成化合物库 天然化合物库 化合物 数据库 组合化合物库 药物分子库 类药性化合物库 生物大分子{核酸分子库 数据库 蛋白质分子库
4 化合物 数据库 合成化合物库 天然化合物库 组合化合物库 药物分子库 类药性化合物库 生物大分子 数据库 核酸分子库 蛋白质分子库
化学信息和生物信息计算机系统 利用计算机信息处理系统对分子 小分子及生物大分子)(2D及3D) 及相关信息(性质、来源、用途)进行 分析、储存、检索和传递等处理 小分子化合物匹配计第 生物大分子 化学信息学 生物信息学 命中结构
5 化学信息和生物信息计算机系统 —— 利用计算机信息处理系统对分子 (小分子及生物大分子)(2D 及3D ) 及相关信息(性质、来源、用途)进行 分析、储存、检索和传递等处理 小分子化合物 生物大分子 命中结构 化学信息学 生物信息学 匹配计算