深圳华大基因股份有限公司2019年年度报告全文 序号 产品名称 产品内容 要应用 人肿瘤单基因突变用于检测癌症患者肿瘤组织中单个肿瘤驱动基因的「主要用于肺癌及结直肠癌患者进 14检测试剂盒(PCR 多种常见突变,提供突变状态的定性评估。 行基因检测,为医生制定治疗方 荧光探针法) 案提供肿瘤个体化用药依据 15定试剂盒(微阵列来集受检者外周血,可一次检测AFP、CEA、PS 酶联免疫法) CA125、CA199和CA15-3六个肿瘤标志物指标 主要用于相关肿瘤标志物指标的 肿瘤标志物测定来集受检者外周血,根据检测内容进行常见肿瘤的测定,为医生提供检测结果以便 16(化学发光免疫分/早期筛查,包括肺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳|判断肿瘤良恶情况和为患者选择 析法) 腺癌、卵巢癌、胰腺癌、食管癌、前列腺癌、胆囊最佳治疗方案 为医疗机构、第三方检验公司制定实验室建设方案, 17肿瘤精准防控综合/提供实验室设计及其所需的仪器设备、试剂、分析主要应用于实现多组学技术为基 解决方案 软件、技术转移、人员培训、数据库建设及使用、础的肿瘤精准防控相关业务的本 信息分析及报告解读等综合支撑其提供肿瘤精准防|地化检测 控相关检测服务的一体化解决方案 3、感染防控基础研究和临床应用服务 (1)业务概述 近几十年来,由于抗微生物药物的应用,以及卫生状况、医疗条件的改善,感染性疾病负担呈下降趋势,但其发病率和 死亡率仍居高不下,仍然是造成全球人口发病和死亡的主要原因之一。在全球气候变化、人口快速流动等多因素的影响下, 新发感染性疾病也已成为全球重要的公共卫生威胁。而且,近年来新发病原的出现、耐药病原微生物的增多以及免疫抑制宿 主的增加,均在一定程度上加大了感染性疾病的诊断及治疗难度,尤其是重症感染,其起病急、进展快、病原体复杂,短时 间内能否明确致病病原至关重要。华大基因感染防控基础研究和临床应用业务,致力于跟踪和硏究感染的传播方式和流行病 学现状,以期可以快速、准确地检测病原体,并依据这些硏究结果,帮助临床进行针对性治疗,最大程度降低患者死亡率。 华大基因利用宏基因组学等多个技术平台对疑难危重感染进行检测和分析,建立了多种病原检测的技术与产品体系,成为临 床诊断的重要辅助手段。基于宏基因组的检测产品,结合生物信息学,对复杂感染进行精准的分析。基于宏基因组的 PMseqo 病原微生物高通量基因检测作为公司的主力产品,可对感染标本直接进行高通量测序,通过微生物专用数据库比对和智能化 算法分析,获得疑似致病微生物的种属信息,并提供全面深λ的报告分析解读,为疑难危重感染提供快速精准诊断依据,促 进抗生素的合理应用。基于免疫学方法和生化方法的产品,实验周期短,对特定病原体检测具有显著优势:基于核酸扩增技 术的病原体核酸检测产品可对形态和生化反应不典型微生物、生长缓慢或难以培养微生物进行鉴定,易操作,不易受混合标 本影响,适用于单种或多种病原体检测 报告期内,公司感染防控业务新增 PMseq病原微生物高通量基因检测plus+系列产品,与基于宏基因组学技术的 PMseq 检测产品联合使用,包括特定耐药基因多重检测产品、结核分枝杆菌鉴定及利福平/异烟肼耐药基因检测产品以及特定RNA 病原体检测产品。报告期内,公司新推出了 PMseqo脓毒症病原微生物基因检测,主要应用于脓毒血症相关病原体的检测。 针对脓毒血症病原学检岀率较低的问题,该产品的高数据量覆盖的特点提高了检测敏感性,进而显著提高病原诊断阳性率, 指导临床靶向使用抗生素,实现感染的精准诊断 公司感染防控产品体系覆盖了不同客户人群多层次的检测需求,有助于深化普惠医疗与精准健康。为推动本地化病原检 测平台建设,提升病原检测效率,公司推岀实验室综合解决方案应用于病原检测相关服务,提供仪器、试剂及分析软件等平 台建设的综合服务,同时对平台技术人员提供培训服务,并按照有关规定提供相应的售后支持服务 (2)具体产品介 序号 产品名称 产品内容 主要应用 1原生物高通量却足柔纸人际仔液、外属客本提取核画医学和呼吸科感染科,、神 因检测 采用高通量测序技术,并结合生物信息分析,给内科、血液科、儿科、骨科、心外和 出可能性高的病原体列表。 等科室疑似感染患者。例如血流感 chin乡 www.cninfocom.cn
深圳华大基因股份有限公司 2019 年年度报告全文 21 序号 产品名称 产品内容 主要应用 14 人肿瘤单基因突变 检测试剂盒(PCR- 荧光探针法) 用于检测癌症患者肿瘤组织中单个肿瘤驱动基因的 多种常见突变,提供突变状态的定性评估。 主要用于肺癌及结直肠癌患者进 行基因检测,为医生制定治疗方 案提供肿瘤个体化用药依据。 15 六项肿瘤标志物测 定试剂盒(微阵列 酶联免疫法) 采集受检者外周血,可一次检测 AFP、CEA 、PSA、 CA125、CA19-9 和 CA15-3 六个肿瘤标志物指标。 主要用于相关肿瘤标志物指标的 测定,为医生提供检测结果以便 判断肿瘤良恶情况和为患者选择 最佳治疗方案。 16 肿瘤标志物测定 (化学发光免疫分 析法) 采集受检者外周血,根据检测内容进行常见肿瘤的 早期筛查,包括肺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳 腺癌、卵巢癌、胰腺癌、食管癌、前列腺癌、胆囊 癌等。 17 肿瘤精准防控综合 解决方案 为医疗机构、第三方检验公司制定实验室建设方案, 提供实验室设计及其所需的仪器设备、试剂、分析 软件、技术转移、人员培训、数据库建设及使用、 信息分析及报告解读等综合支撑其提供肿瘤精准防 控相关检测服务的一体化解决方案。 主要应用于实现多组学技术为基 础的肿瘤精准防控相关业务的本 地化检测。 3、感染防控基础研究和临床应用服务 (1)业务概述 近几十年来,由于抗微生物药物的应用,以及卫生状况、医疗条件的改善,感染性疾病负担呈下降趋势,但其发病率和 死亡率仍居高不下,仍然是造成全球人口发病和死亡的主要原因之一。在全球气候变化、人口快速流动等多因素的影响下, 新发感染性疾病也已成为全球重要的公共卫生威胁。而且,近年来新发病原的出现、耐药病原微生物的增多以及免疫抑制宿 主的增加,均在一定程度上加大了感染性疾病的诊断及治疗难度,尤其是重症感染,其起病急、进展快、病原体复杂,短时 间内能否明确致病病原至关重要。华大基因感染防控基础研究和临床应用业务,致力于跟踪和研究感染的传播方式和流行病 学现状,以期可以快速、准确地检测病原体,并依据这些研究结果,帮助临床进行针对性治疗,最大程度降低患者死亡率。 华大基因利用宏基因组学等多个技术平台对疑难危重感染进行检测和分析,建立了多种病原检测的技术与产品体系,成为临 床诊断的重要辅助手段。基于宏基因组的检测产品,结合生物信息学,对复杂感染进行精准的分析。基于宏基因组的PMseq® 病原微生物高通量基因检测作为公司的主力产品,可对感染标本直接进行高通量测序,通过微生物专用数据库比对和智能化 算法分析,获得疑似致病微生物的种属信息,并提供全面深入的报告分析解读,为疑难危重感染提供快速精准诊断依据,促 进抗生素的合理应用。基于免疫学方法和生化方法的产品,实验周期短,对特定病原体检测具有显著优势;基于核酸扩增技 术的病原体核酸检测产品可对形态和生化反应不典型微生物、生长缓慢或难以培养微生物进行鉴定,易操作,不易受混合标 本影响,适用于单种或多种病原体检测。 报告期内,公司感染防控业务新增PMseq®病原微生物高通量基因检测plus+系列产品,与基于宏基因组学技术的PMseq® 检测产品联合使用,包括特定耐药基因多重检测产品、结核分枝杆菌鉴定及利福平/异烟肼耐药基因检测产品以及特定RNA 病原体检测产品。报告期内,公司新推出了PMseq®脓毒症病原微生物基因检测,主要应用于脓毒血症相关病原体的检测。 针对脓毒血症病原学检出率较低的问题,该产品的高数据量覆盖的特点提高了检测敏感性,进而显著提高病原诊断阳性率, 指导临床靶向使用抗生素,实现感染的精准诊断。 公司感染防控产品体系覆盖了不同客户人群多层次的检测需求,有助于深化普惠医疗与精准健康。为推动本地化病原检 测平台建设,提升病原检测效率,公司推出实验室综合解决方案应用于病原检测相关服务,提供仪器、试剂及分析软件等平 台建设的综合服务,同时对平台技术人员提供培训服务,并按照有关规定提供相应的售后支持服务。 (2)具体产品介绍 序号 产品名称 产品内容 主要应用 1 PMseq®病原微生物高通量基 因检测 通过采集病人脑脊液、外周血等样本,提取核酸, 采用高通量测序技术,并结合生物信息分析,给 出可能性高的病原体列表。 重症医学科、呼吸科、感染科、神经 内科、血液科、儿科、骨科、心外科 等科室疑似感染患者。例如血流感
深圳华大基因股份有限公司2019年年度报告全文 产品名称 产品内容 主要应用 染、脑炎脑膜炎症候群、呼吸道感 症候群 本系列产品包括 )PMeq8病原微生物高通量基因检测+结核分 枝杆菌鉴定及利福平异烟肼耐药基因检测 2Mg病原微生物高通量2)PMeq8病原微生物高通量基因检测+细菌 适用于病原筛查及特定耐药基因鉴 因检测plus+系列产品 药基因多重检测 3) PMseq病原微生物高通量基因检测+特定 NA病原体检测 型冠状病毒2019nCoV核采用高通量测序技术,结合生物信息分析方法 酸检测试剂盒(联合探针锚定检测疑似患者肺泡灌洗液、咽拭子样本中的适用于2019新型冠状病毒肺炎疑似 聚合测序法 2019新型冠状病毒的核酸序列 患者的辅助诊断。 PMseq脓毒症病原微生物 通过基于宏基因组学的高通量测序技术对血液应用于疑似脓毒症患者的病原体鉴 因检测 样本中的病原体进行鉴定,高数据量覆盖提高检定,提高病原诊断阳性率,辅助脓 测敏感性 症的病原学诊断。 本系列产品包括 1)基于酶联免疫法的乙型肝炎病毒五项检测 剂盒(乙型肝炎病毒表面抗原、表面抗体、e抗 原、ε抗体、核心抗体)、甲型肝炎病毒lM抗)用于献血员筛查、血液制品检测 体检测试剂盒、丙型肝炎病毒抗体检测试剂盒、和肝炎病毒感染高危人群中血清学 师炎病毒检测系列产品型炎病毒1M抗体检测试盒及以望肝险斯 免疫法及PCR荧光探针法)病毒gG抗体检测试剂盒。体外定性检测人血p)临床诊断乙型肝炎病毒、丙型肝 清或血浆中的肝炎病毒抗原抗体 炎病毒感染、选择治疗方案及判断 2)基于PCR荧光探针法的乙型肝炎病毒核酸定后 量检测试剂盒、丙型肝炎病毒核酸定量检测试剂 盒。分别用于体外定量检测人血清或血浆样本中 的乙型肝炎病毒核酸及丙型肝炎病毒核酸 6血筛四项系列产品(酶联你出本系列产品体外定性检测人血清或血浆中的乙 型肝炎病毒表面抗原、丙型肝炎病毒抗体、梅毒何用于献血员筛查、血液制品检测 螺旋体抗体、人类免疫缺陷病毒的抗原航体。临床辅助诊断 本系列产品体外定性检测人血清或血浆中弓形 孕前病原筛查系列产品(酶联虫、巨细胞病毒、风疹病毒、单纯疱疹病毒(I孕前妇女筛查;疑似症状感染者指 免疫法及微阵列酶联免疫法)型)、单纯疱疹病毒(Ⅱ型)的lgM抗体及1g生育 抗体 本系列产品包括 )基于酶联免疫法的乙型脑炎病毒IgM抗体 测试剂盒、登革热病毒IgG抗体检测试剂盒 汉坦病毒1gG抗体检测试剂盒,体外定性检测 8脑炎出血热类检测产品人血清中乙型脑炎病毒的特异性1AM抗体、登何用于乙型脑炎病毒、登革热病毒、 性1gG抗体 布尼亚病毒感染的辅助诊断 )基于PCR荧光探针法的发热伴血小板减少 合征布尼亚病毒核酸检测试剂盒用于体外定性 检测人血清样本中发热伴血小板减少综合征布 尼亚病毒RNA 本系列产品包括: )甲型流感病毒通用型核酸检测试剂盒以及甲 型HlN1流感病毒(2009)RNA核酸检测试剂 盒,对甲型流感病毒疑似患者的鼻咽拭子样本的 9/吸道病原体检测系列产品核酸进行定性检测 甲型流感病毒、结核分枝杆菌感染 (PCR荧光探针法) 2)结核分枝杆菌核酸检测试剂盒,体外定性检p019新型冠状病毒肺炎疑似患者的 测人痰液样本中的结核分枝杆菌核酸 辅助诊断 3)新型冠状病毒2019nCoV核酸检测试剂盒( 光PCR法),对2019新型冠状病毒肺炎疑似患 者的肺泡灌洗液及咽拭子样本的核酸进行检测 10性病病原体检测系列产品本系列产品包括: 男女不孕不育原因筛查:疑似症状 chin乡 www.cninfocom.cn
深圳华大基因股份有限公司 2019 年年度报告全文 22 序号 产品名称 产品内容 主要应用 染、脑炎脑膜炎症候群、呼吸道感染 症候群等。 2 PMseq®病原微生物高通量基 因检测 plus+系列产品 本系列产品包括: 1)PMseq®病原微生物高通量基因检测+结核分 枝杆菌鉴定及利福平/异烟肼耐药基因检测; 2)PMseq®病原微生物高通量基因检测+细菌耐 药基因多重检测; 3)PMseq®病原微生物高通量基因检测+特定 RNA 病原体检测。 适用于病原筛查及特定耐药基因鉴 定。 3 新型冠状病毒 2019-nCoV 核 酸检测试剂盒(联合探针锚定 聚合测序法) 采用高通量测序技术,结合生物信息分析方法, 检测疑似患者肺泡灌洗液、咽拭子样本中的 2019 新型冠状病毒的核酸序列。 适用于 2019 新型冠状病毒肺炎疑似 患者的辅助诊断。 4 PMseq®脓毒症病原微生物基 因检测 通过基于宏基因组学的高通量测序技术对血液 样本中的病原体进行鉴定,高数据量覆盖提高检 测敏感性。 应用于疑似脓毒症患者的病原体鉴 定,提高病原诊断阳性率,辅助脓毒 症的病原学诊断。 5 肝炎病毒检测系列产品(酶联 免疫法及 PCR-荧光探针法) 本系列产品包括: 1)基于酶联免疫法的乙型肝炎病毒五项检测试 剂盒(乙型肝炎病毒表面抗原、表面抗体、e 抗 原、e 抗体、核心抗体)、甲型肝炎病毒 IgM 抗 体检测试剂盒、丙型肝炎病毒抗体检测试剂盒、 戊型肝炎病毒 IgM 抗体检测试剂盒及戊型肝炎 病毒 IgG 抗体检测试剂盒。体外定性检测人血 清或血浆中的肝炎病毒抗原/抗体。 2)基于 PCR-荧光探针法的乙型肝炎病毒核酸定 量检测试剂盒、丙型肝炎病毒核酸定量检测试剂 盒。分别用于体外定量检测人血清或血浆样本中 的乙型肝炎病毒核酸及丙型肝炎病毒核酸。 1)用于献血员筛查、血液制品检测 和肝炎病毒感染高危人群中血清学 诊断。 2) 临床诊断乙型肝炎病毒、丙型肝 炎病毒感染、选择治疗方案及判断预 后。 6 血筛四项系列产品(酶联免疫 法) 本系列产品体外定性检测人血清或血浆中的乙 型肝炎病毒表面抗原、丙型肝炎病毒抗体、梅毒 螺旋体抗体、人类免疫缺陷病毒的抗原/抗体。 可用于献血员筛查、血液制品检测、 临床辅助诊断。 7 孕前病原筛查系列产品(酶联 免疫法及微阵列酶联免疫法) 本系列产品体外定性检测人血清或血浆中弓形 虫、巨细胞病毒、风疹病毒、单纯疱疹病毒(Ⅰ 型)、单纯疱疹病毒(Ⅱ型)的 IgM 抗体及 IgG 抗体。 孕前妇女筛查;疑似症状感染者指导 生育。 8 脑炎出血热类检测产品 本系列产品包括: 1)基于酶联免疫法的乙型脑炎病毒 IgM 抗体检 测试剂盒、登革热病毒 IgG 抗体检测试剂盒、 汉坦病毒 IgG 抗体检测试剂盒,体外定性检测 人血清中乙型脑炎病毒的特异性 IgM 抗体、登 革热病毒的特异性 IgG 抗体、汉坦病毒的特异 性 IgG 抗体; 2)基于 PCR-荧光探针法的发热伴血小板减少综 合征布尼亚病毒核酸检测试剂盒,用于体外定性 检测人血清样本中发热伴血小板减少综合征布 尼亚病毒 RNA。 可用于乙型脑炎病毒、登革热病毒、 汉坦病毒、发热伴血小板减少综合征 布尼亚病毒感染的辅助诊断。 9 呼吸道病原体检测系列产品 (PCR-荧光探针法) 本系列产品包括: 1)甲型流感病毒通用型核酸检测试剂盒以及甲 型 H1N1 流感病毒(2009)RNA 核酸检测试剂 盒,对甲型流感病毒疑似患者的鼻咽拭子样本的 核酸进行定性检测; 2)结核分枝杆菌核酸检测试剂盒,体外定性检 测人痰液样本中的结核分枝杆菌核酸。 3)新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒(荧 光 PCR 法),对 2019 新型冠状病毒肺炎疑似患 者的肺泡灌洗液及咽拭子样本的核酸进行检测。 甲型流感病毒、结核分枝杆菌感染及 2019 新型冠状病毒肺炎疑似患者的 辅助诊断。 10 性病病原体检测系列产品 本系列产品包括: 男女不孕不育原因筛查;疑似症状人
深圳华大基因股份有限公司2019年年度报告全文 产品名称 产 品内容 主要应用 1)基于PCR-荧光探针法的奈瑟淋球菌核酸检测员进行性病病原体检测:;淋病辅助 试剂盒、沙眼衣原体解脲脲原体核酸检测试剂断 盒,用于体外定性检测女性宫颈拭子和男性尿道 拭子样本中提取的奈瑟淋球菌、沙眼衣原体、斛 脲脲原体DNA 2)基于胶体金法的梅毒螺旋体抗体检测试剂盒, 用于体外定性检测全血/血清/血浆中是否含有 特异性梅毒螺旋体抗体 本系列产品包括肠道病毒通用型核酸检测试剂 盒、肠道病毒71型核酸检测试剂盒、柯萨奇病 1/手足口病原检测系列产品|毒Al6型核酸检测试剂盒,分别用于体外定 (PCR荧光探针法) 检测人的咽拭子疱疹液和粪便样本中的肠道多手足口病患者的诊断提供辅助手 毒、肠道病毒71型及柯萨奇病毒Al6型核酸。 1)EB病毒 VCAIgA抗体诊断试剂盒(酶联免 疫法),体外定性检测人血清或血浆中EB病毒 VCA-IgA抗体 12其他检测产品 2)结核分枝杆菌1G抗体谱检测试剂盒(微用于产品所涉及的相关病原体感 列酶联免疫法),用于体外定性检测人血清中抗染的辅助诊断。 多种结核抗原(16KDa、38KDa、Ag85B和 MPI64)的抗体 医疗机构、第三方检验公司制定实验室建设方 案,提供实验室设计及其所需的仪器设备、试剂 13感染防控综合解决方案分析软件、技术转移、人员培训、数据库建设及主要应用于实现多组学技术为基础 使用信息分析及报告解读等综合支撑其提供感的感染防控相关业务的本地化检测 防控相关检测服务的一体化解决方案 4、多组学大数据服务与合成业务 (1)业务概述 公司率先面向合作伙伴提供多组学大数据服务,致力于成为全球生命科学研究机构的卓越合作伙伴,为从事生命科学研 究的机构和企业提供高质量、行业领先的基因测序、质谱、生物数据库、云计算等标准化技术服务和全流程系统解决方案。 该服务面向的主要客户为以高校、研究性医院等为代表的科研机构,以及以药企、育种公司等为代表的工业客户。截至报告 期末,华大基因多组学大数据业务已经覆盖了全球100多个国家和地区,拥有5000多家合作单位,为20,000多位合作伙 伴提供了杰出技术服务,更通过深度合作完成了一系列大型基因组科研计划和国际多边合作项目 公司的合成类业务主要包含基因合成、Oigo合成和全基因组/染色体片段系统设计改造与合成服务。其中,基因合成业 务包括合成密码子优化过的cDNA、特殊位点突变的基因、人工设计的DNA序列,公司可提供包含目的基因的质粒;Oigo 合成则是利用化学方法合成特定的已知序列的寡核苷酸片段,主要应用于反义寡聚核苷酸、测序与扩增的引物、DNA杂交、 探针、点突变以及全基因合成等实验中;全基因组/染色体片段系统设计与合成服务主要为科硏客户提供全基因组或者部分 染色体的从头设计与大规模的合成服务,大规模的基因组功能区设计与人工合成服务,为工业客户提供代谢菌株或者生物底 盘的全局设计与高通量合成服务,助力新一代生物制造产业的发展 报告期内,公司对基因合成类业务进行升级,推出迅BEST难度基因合成技术,该技术可以实现多种复杂序列的合成,在 难度基因合成方面达到领先水平。 IBEST难度基因合成技术配合其他技术平台的使用,可实现多种载体克隆及基因组定制化 设计,使公司在基因合成业务领域具有更强的竞争力。未来公司将在超长片段的体外合成方面进行自主研发,利用辅助酶切 技术,实现兆级别的DNA体外拼接,为基因组合成拼装提供更优的解决方案 (2)具体产品介绍 ①多组学大数据服务类产品介绍 chin乡 www.cninfocom.cn
深圳华大基因股份有限公司 2019 年年度报告全文 23 序号 产品名称 产品内容 主要应用 1)基于 PCR-荧光探针法的奈瑟淋球菌核酸检测 试剂盒、沙眼衣原体/解脲脲原体核酸检测试剂 盒,用于体外定性检测女性宫颈拭子和男性尿道 拭子样本中提取的奈瑟淋球菌、沙眼衣原体、解 脲脲原体 DNA; 2)基于胶体金法的梅毒螺旋体抗体检测试剂盒, 用于体外定性检测全血/血清/血浆中是否含有 特异性梅毒螺旋体抗体。 员进行性病病原体检测;淋病辅助诊 断。 11 手足口病原检测系列产品 (PCR-荧光探针法) 本系列产品包括肠道病毒通用型核酸检测试剂 盒、肠道病毒 71 型核酸检测试剂盒、柯萨奇病 毒 A16 型核酸检测试剂盒,分别用于体外定性 检测人的咽拭子、疱疹液和粪便样本中的肠道病 毒、肠道病毒 71 型及柯萨奇病毒 A16 型核酸。 为手足口病患者的诊断提供辅助手 段。 12 其他检测产品 1)EB 病毒 VCA IgA 抗体诊断试剂盒(酶联免 疫法),体外定性检测人血清或血浆中 EB 病毒 VCA-IgA 抗体; 2)结核分枝杆菌 IgG 抗体谱检测试剂盒(微阵 列酶联免疫法),用于体外定性检测人血清中抗 多种结核抗原(16KDa、38KDa、Ag85B 和 MPT64)的抗体。 应用于产品所涉及的相关病原体感 染的辅助诊断。 13 感染防控综合解决方案 为医疗机构、第三方检验公司制定实验室建设方 案,提供实验室设计及其所需的仪器设备、试剂、 分析软件、技术转移、人员培训、数据库建设及 使用、信息分析及报告解读等综合支撑其提供感 染防控相关检测服务的一体化解决方案。 主要应用于实现多组学技术为基础 的感染防控相关业务的本地化检测。 4、多组学大数据服务与合成业务 (1)业务概述 公司率先面向合作伙伴提供多组学大数据服务,致力于成为全球生命科学研究机构的卓越合作伙伴,为从事生命科学研 究的机构和企业提供高质量、行业领先的基因测序、质谱、生物数据库、云计算等标准化技术服务和全流程系统解决方案。 该服务面向的主要客户为以高校、研究性医院等为代表的科研机构,以及以药企、育种公司等为代表的工业客户。截至报告 期末,华大基因多组学大数据业务已经覆盖了全球 100 多个国家和地区,拥有 5,000 多家合作单位,为20,000 多位合作伙 伴提供了杰出技术服务,更通过深度合作完成了一系列大型基因组科研计划和国际多边合作项目。 公司的合成类业务主要包含基因合成、Oligo合成和全基因组/染色体片段系统设计改造与合成服务。其中,基因合成业 务包括合成密码子优化过的cDNA、特殊位点突变的基因、人工设计的DNA序列,公司可提供包含目的基因的质粒;Oligo 合成则是利用化学方法合成特定的已知序列的寡核苷酸片段,主要应用于反义寡聚核苷酸、测序与扩增的引物、DNA杂交、 探针、点突变以及全基因合成等实验中;全基因组/染色体片段系统设计与合成服务主要为科研客户提供全基因组或者部分 染色体的从头设计与大规模的合成服务,大规模的基因组功能区设计与人工合成服务,为工业客户提供代谢菌株或者生物底 盘的全局设计与高通量合成服务,助力新一代生物制造产业的发展。 报告期内,公司对基因合成类业务进行升级,推出iBEST难度基因合成技术,该技术可以实现多种复杂序列的合成,在 难度基因合成方面达到领先水平。iBEST难度基因合成技术配合其他技术平台的使用,可实现多种载体克隆及基因组定制化 设计,使公司在基因合成业务领域具有更强的竞争力。未来公司将在超长片段的体外合成方面进行自主研发,利用辅助酶切 技术,实现兆级别的DNA体外拼接,为基因组合成拼装提供更优的解决方案。 (2)具体产品介绍 ① 多组学大数据服务类产品介绍
深圳华大基因股份有限公司2019年年度报告全文 序号主要产品名称 产品内容 主要应用 全基因组测序(WGS, whole genome sequencing)是对人类核 酸样品进行全基因组范围的测序,并在个体或群体水平进行差异 性分析的方法。相比芯片检测,全基因组测序可以全面的挖掘基 因序列差异和结构变异。华大基因利用自主 DNBSEQ技术测 序仪产生高质量的基因组数据:利用自主 BGI Online云计算平 主要用于遗传疾病检测 药物基因组学研究、群体 1|人全基因组测序台,为海量的基因数据提供了高效的存储、计算、管理和传输力进化分析、肿瘤研究、复 案。在此基础上,推出了利用自主(单管)长片段(sLFR)建 库技术的 tFR WGS产品和利用无扩增错误的 PCR-free疾病研究 技术的“0 PCR WGS产品。前者可以实现极低起始量的DNA就 可高效地完成单倍型基因组测序:后者可以有效避免PCR扩增 l入的碱基错配和偏向性,提高变异检测能力 外显子仅占全基因组序列的1~2%左右,却包括大多数与疾病相 主要用于遗传疾病检测、 全外显子测序关的变异。外显子测序不仅经济高效,数据阐释也更简单。在临物基因组学研究、群体 床领域和肿瘤研究方面,外显子有很多优势 化分析、肿瘤研究 杂疾病研究 De novo测序即从头测序,不需要任何参考序列信息即可对某个 该物种的基因组序列图谱,华大基因基于自主D从而获 物种进行测序。用生物信息学分析方法进行拼接 术的测序平台,结合其它先进技术和平台(如:sFR长片段建 主要用于获得物种的参考 件进行组装,从而获得高质量的全基因组序列图请,基因组建物种能产 3 De novo测序于HC的辅助基因组组装技术、 Bionano光学图谱技术等),再序列、研究物种起源与 利用自主研发的 SOAPdenovo、 SOAPdenoy2等生物信息分析轨儿历史、挖掘 完成后,可以对基因组进行注释、研究物种起源进化历史,还可 以搭建该物种的基因组数据库,为后续的基因挖掘、功能验证等 提供DNA序列信息 动植物全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行基因组 测序,并在此基础上完成个体或群体分析。全基因组重测序通过 序列比对,可以检测到大量变异信息,包括单核苷酸多态性位主要用于群体遗传学研 (SNP)、插入缺失位点(hDel, Insertion/Deletion)、结构变异 究、目标性状基因挖掘 4动植物全基因组重测卜m0m等,获得同一物种不同个体的遗传变异图语,基于检动植物核心资源普含物 测到的变异能进一步的阐述该物种特有的生物学信息。随着测序品种鉴定、分子标记开 成本降低和已知基因组序列物种的增多,全基因组重测序已经 发及辅助选择育种、变异 为动植物分子育种、群体进化研究中最为迅速有效的方法之一图谱构建 佺基因组重测序技术有助于快速发现与动植物重要性状相关的 遗传变异,应用于分子育种中,缩短育种周期 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录 出来的所有RNA的总和,目前该测序技术主要针对具有编码基主要用于疾病发生机制研 因功能的mRNA。转录组测序技术可以检测基因表达水平的变究、免疫应答干细胞研究 转录组测序化,检测出低频转录本,精确地识别可变剪切位点、基因融合,性命调节机理研究、疾病 提供全面的转录组信息。利用基于自主 DNBSEQ技术的测序标志物的寻找、药物靶点 怦台、D.Tom多组学数据挖掘系统,华大基因可以提供快速、研究 简便、高效、经济的转录组测序产品。 RNA-Seq是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生 的mRNA进行高通量测序,用来研究基因的表达差异情况,已主要用于系统进化种 经广泛应用于基础研究、临床研究和药物研发等领域。相比转录源、生长发育、抗逆及 NA-S 组,更加侧重基因定量研究。相比表达谱芯片, RNA-Seq的优势病机理研究、生物标记( 是使用数字化信号,无背景噪音,无交叉杂交,没有物种限制,子育种)等研究 能检测出低丰度基因。 双链环化全基因组甲全基因组甲基化测序(wGBs, whole genome bisulfite sequencing-泛应用于细胞分化、组 基化测序是将重亚硫酸盐处理与高通量测序技术相结合,能够高效准确地织发育等基础机制研究 chin乡 www.cninfocom.cn
深圳华大基因股份有限公司 2019 年年度报告全文 24 序号 主要产品名称 产品内容 主要应用 1 人全基因组测序 人全基因组测序(WGS,whole genome sequencing)是对人类核 酸样品进行全基因组范围的测序,并在个体或群体水平进行差异 性分析的方法。相比芯片检测,全基因组测序可以全面的挖掘基 因序列差异和结构变异。华大基因利用自主 DNBSEQTM技术测 序仪产生高质量的基因组数据;利用自主 BGI Online 云计算平 台,为海量的基因数据提供了高效的存储、计算、管理和传输方 案。在此基础上,推出了利用自主(单管)长片段(stLFR)建 库技术的“stLFR WGS”产品和利用无扩增错误的 PCR-free 建库 技术的“0 PCR WGS”产品。前者可以实现极低起始量的 DNA 就 可高效地完成单倍型基因组测序;后者可以有效避免 PCR 扩增 引入的碱基错配和偏向性,提高变异检测能力。 主要用于遗传疾病检测、 药物基因组学研究、群体 进化分析、肿瘤研究、复 杂疾病研究。 2 全外显子测序 外显子仅占全基因组序列的 1~2%左右,却包括大多数与疾病相 关的变异。外显子测序不仅经济高效,数据阐释也更简单。在临 床领域和肿瘤研究方面,外显子有很多优势。 主要用于遗传疾病检测、 药物基因组学研究、群体 进化分析、肿瘤研究、复 杂疾病研究。 3 De novo 测序 De novo 测序即从头测序,不需要任何参考序列信息即可对某个 物种进行测序。用生物信息学分析方法进行拼接、组装,从而获 得该物种的基因组序列图谱。华大基因基于自主 DNBSEQTM技 术的测序平台,结合其它先进技术和平台(如:stLFR 长片段建 库技术、PacBio SequelⅡ和 Nanopore PromethION 测序平台、基 于 Hi-C 的辅助基因组组装技术、Bionano 光学图谱技术等),再 利用自主研发的 SOAPdenovo、SOAPdenovo2 等生物信息分析软 件进行组装,从而获得高质量的全基因组序列图谱。基因组图谱 完成后,可以对基因组进行注释、研究物种起源进化历史,还可 以搭建该物种的基因组数据库,为后续的基因挖掘、功能验证等 提供 DNA 序列信息。 主要用于获得物种的参考 序列、研究物种起源与进 化历史、挖掘功能基因、 搭建物种数据库。 4 动植物全基因组重测 序 动植物全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行基因组 测序,并在此基础上完成个体或群体分析。全基因组重测序通过 序列比对,可以检测到大量变异信息,包括单核苷酸多态性位点 (SNP)、插入缺失位点(InDel,Insertion/Deletion)、结构变异 位点(SV,Structure Variation)、拷贝数变异位(CNV,Copy Number Variation)等,获得同一物种不同个体的遗传变异图谱。基于检 测到的变异能进一步的阐述该物种特有的生物学信息。随着测序 成本降低和已知基因组序列物种的增多,全基因组重测序已经成 为动植物分子育种、群体进化研究中最为迅速有效的方法之一。 全基因组重测序技术有助于快速发现与动植物重要性状相关的 遗传变异,应用于分子育种中,缩短育种周期。 主要用于群体遗传学研 究、目标性状基因挖掘、 动植物核心资源普查、物 种/品种鉴定、分子标记开 发及辅助选择育种、变异 图谱构建。 5 转录组测序 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录 出来的所有 RNA 的总和,目前该测序技术主要针对具有编码基 因功能的 mRNA。转录组测序技术可以检测基因表达水平的变 化,检测出低频转录本,精确地识别可变剪切位点、基因融合, 提供全面的转录组信息。利用基于自主 DNBSEQTM技术的测序 平台、Dr. Tom 多组学数据挖掘系统,华大基因可以提供快速、 简便、高效、经济的转录组测序产品。 主要用于疾病发生机制研 究、免疫应答干细胞研究、 生命调节机理研究、疾病 标志物的寻找、药物靶点 研究。 6 RNA-Seq RNA-Seq 是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生 的 mRNA 进行高通量测序,用来研究基因的表达差异情况,已 经广泛应用于基础研究、临床研究和药物研发等领域。相比转录 组,更加侧重基因定量研究。相比表达谱芯片,RNA-Seq 的优势 是使用数字化信号,无背景噪音,无交叉杂交,没有物种限制, 能检测出低丰度基因。 主要用于系统进化/物种起 源、生长发育、抗逆及致 病机理研究、生物标记(分 子育种)等研究。 7 双链环化全基因组甲 基化测序 全基因组甲基化测序(WGBS,whole genome bisulfite sequencing) 是将重亚硫酸盐处理与高通量测序技术相结合,能够高效准确地 广泛应用于细胞分化、组 织发育等基础机制研究
深圳华大基因股份有限公司2019年年度报告全文 序号主要产品名称 产品内容 主要应用 制全基因组DNA甲基化图谱,是研究表观基因组学的重要手以及动植物育种、人类健 段。公司在利用自主 DNBSEQ测序技术的基础上,自主开发康与疾病等应用性研究。 了双链环化的文库制备新方法,可以有效解决传统甲基化测序中 碱基偏向性问题,可快速高效获取真实的甲基化水平数据 用于蛋白质组学定量研 过数据非依赖性采集技术(DA),对蛋白质组进行定量研究,寻找候选蛋白标志物 公司利用高精度质谱平台,结合相关的分析软件,大规模并行处尤适合多样本个体化蛋 白质组定量DA理多样本,进行精确蛋白质组学定量研究,可进行蛋白表达差异质组学研究,为揭示生命 和功能分析,高效寻找候选标志物。该产品可达到通量高、速度调控机理研究提供强有力 快、结果准的分析效果。 的蛋白质组技术挖掘工 可用于代谢物组学定量研 利用质谱技术,对整个代谢物组进行定量研究。基于高精度的质究,寻找如胆汁酸、氨基 谱平台,采用全扫描数据采集模式,结合自主分析软件,分析大酸等新型代谢标志物,揭 代谢全谱分析规模样本中的代谢物组表达情况,从大规模样本中发现候选代谢示疾病发生发展机理,在 标志物 脑肠轴等研究领域应用广 用于大分子药物的整体表 征,可以对其分子量,药 lo|大分子生物药的肽质过液相色谱一级质谱联用,分析大分子药物,如蛋白,双特异物分子负载量,非共价复 性多特异性抗体、抗体药物偶联物、Fc融合蛋白的表征。该产合物,电荷变体,分子量 谱指纹谱的深度分析 品可达到通量高、速度快、结果准的分析效果。 变体,二硫键变体进行全 面表征,满足大分子药物 研发的相关需求 用于大分子药物的氨基酸 大分子生物药的变性通过液相色谱,紫外检测,一级和二级质谱分析的联用,对大分层次的深度表征,可以对 和非变性质谱的整体子药物的每个氨基酸进行高精度的深度分析提供药物分子微不和免疫源性进行分析考 分子量分析两一性的数据,以及所有相关的修饰的定性定量分析 量,满足大分子药物研发 的相关需求 BGIOnline是公司自主研发的生物信息云计算平台,依托于海 高效的云资源提供基因数据的存储、计算、管理和传输服务大规模生物信息分析生 BGIOnline为大规模生物信息分析提供丰富的生物信息分析方支撑的多组学大数据业 BGI Online案和海量的计算资源、存储资源,为生物信息分析用户提供“一务、个性化生物信息分析 站式服务。对于研究生物信息分析的用户, BGI Online也提供项目、个人基因数据分析 在线开发服务,便于用户开发生物信息分析流程,用户可参与并管理等 管理整个开发使用过程 速、深度地挖掘基因、蛋白和代谢数据的系统,能够在复杂的刻 13/ Dr Tom多组学数据阻学数据中快速找到目标基因和相关基因调控通路。该系统整合对所有具有表达特征的纠 挖掘系统 了多个国际常用的基因数据库和生物信息分析工具,并优化了数组学数据都可以进行深 据挖掘的方式和展现形式,还结合了云计算、人工智能和机器学挖掘,找到目标基因 技术。通过该系统,科研用户可以方便的进行自助式多组学数 据挖掘 除列表中产品外,通过先进的平台,公司多组学大数据服务还可提供非编码RNA、目标区域测序、表观基因组、基因 分型、宏基因组、蛋白类产品、代谢类产品、单细胞类产品、免疫组库测序、基因组学数据库等产品。通过上述技术手段的 集合,多组学大数据服务形成了一整套可贯穿的“组学”研究方法,可以为生物学研究提供全面系统的研究方案 ②合成业务类产品介绍 chin乡 www.cninfocom.cn
深圳华大基因股份有限公司 2019 年年度报告全文 25 序号 主要产品名称 产品内容 主要应用 绘制全基因组 DNA 甲基化图谱,是研究表观基因组学的重要手 段。公司在利用自主 DNBSEQTM测序技术的基础上,自主开发 了双链环化的文库制备新方法,可以有效解决传统甲基化测序中 碱基偏向性问题,可快速高效获取真实的甲基化水平数据。 以及动植物育种、人类健 康与疾病等应用性研究。 8 蛋白质组定量 DIA 通过数据非依赖性采集技术(DIA),对蛋白质组进行定量研究。 公司利用高精度质谱平台,结合相关的分析软件,大规模并行处 理多样本,进行精确蛋白质组学定量研究,可进行蛋白表达差异 和功能分析,高效寻找候选标志物。该产品可达到通量高、速度 快、结果准的分析效果。 用于蛋白质组学定量研 究,寻找候选蛋白标志物, 尤适合多样本个体化蛋白 质组学研究,为揭示生命 调控机理研究提供强有力 的蛋白质组技术挖掘工 具。 9 代谢全谱分析 利用质谱技术,对整个代谢物组进行定量研究。基于高精度的质 谱平台,采用全扫描数据采集模式,结合自主分析软件,分析大 规模样本中的代谢物组表达情况,从大规模样本中发现候选代谢 标志物。 可用于代谢物组学定量研 究,寻找如胆汁酸、氨基 酸等新型代谢标志物,揭 示疾病发生发展机理,在 脑肠轴等研究领域应用广 泛。 10 大分子生物药的肽质 谱指纹谱的深度分析 通过液相色谱一级质谱联用,分析大分子药物,如蛋白,双特异 性/多特异性抗体、抗体-药物偶联物、Fc 融合蛋白的表征。该产 品可达到通量高、速度快、结果准的分析效果。 用于大分子药物的整体表 征,可以对其分子量,药 物分子负载量,非共价复 合物,电荷变体,分子量 变体,二硫键变体进行全 面表征,满足大分子药物 研发的相关需求。 11 大分子生物药的变性 和非变性质谱的整体 分子量分析 通过液相色谱,紫外检测,一级和二级质谱分析的联用,对大分 子药物的每个氨基酸进行高精度的深度分析,提供药物分子微不 均一性的数据,以及所有相关的修饰的定性定量分析。 用于大分子药物的氨基酸 层次的深度表征,可以对 药物的有效性,安全性, 和免疫源性进行分析考 量,满足大分子药物研发 的相关需求。 12 BGI Online BGI Online 是公司自主研发的生物信息云计算平台,依托于海 量、高效的云资源提供基因数据的存储、计算、管理和传输服务。 BGI Online 为大规模生物信息分析提供丰富的生物信息分析方 案和海量的计算资源、存储资源,为生物信息分析用户提供“一 站式”服务。对于研究生物信息分析的用户,BGI Online 也提供 在线开发服务,便于用户开发生物信息分析流程,用户可参与并 管理整个开发使用过程。 大规模生物信息分析生产 支撑的多组学大数据业 务、个性化生物信息分析 项目、个人基因数据分析 管理等。 13 Dr. Tom 多组学数据 挖掘系统 公司自主开发的“Dr. Tom 多组学数据挖掘系统”是一款可以快 速、深度地挖掘基因、蛋白和代谢数据的系统,能够在复杂的多 组学数据中快速找到目标基因和相关基因调控通路。该系统整合 了多个国际常用的基因数据库和生物信息分析工具,并优化了数 据挖掘的方式和展现形式,还结合了云计算、人工智能和机器学 习技术。通过该系统,科研用户可以方便的进行自助式多组学数 据挖掘。 对所有具有表达特征的多 组学数据都可以进行深度 挖掘,找到目标基因。 除列表中产品外,通过先进的平台,公司多组学大数据服务还可提供非编码RNA、目标区域测序、表观基因组、基因 分型、宏基因组、蛋白类产品、代谢类产品、单细胞类产品、免疫组库测序、基因组学数据库等产品。通过上述技术手段的 集合,多组学大数据服务形成了一整套可贯穿的“组学”研究方法,可以为生物学研究提供全面系统的研究方案。 ② 合成业务类产品介绍