生物信息学课程网络的分类Bioinformatics无向网络有向网络BASet1Set2U加权网络V二分网络9C11
生物信息学 课程 Bioinformatics 网络的分类 无向网络 有向网络 加权网络 二分网络 11
生物信息学课程网络相关的常见概念Bioinformatics口网络中的路径是指一系列节点，其中每个节点都有一条边连接到紧随其后的节点。口对包含节点数自有限的路径来说，第一个节点称为起点，最后一个节点称为终点，二者均可称为路径的端点口路径中经过边的权重之和称为路径的权重，也称为路径的长度口在连接两个节点的所有路径中，长度最短的路径称为最短路径，最短路径的长度称为从起点到终点的距离12
生物信息学 课程 Bioinformatics 网络相关的常见概念 网络中的路径是指一系列节点，其中每个节点都有一条边连接到紧随其 后的节点。 对包含节点数目有限的路径来说，第一个节点称为起点，最后一个节点 称为终点，二者均可称为路径的端点 路径中经过边的权重之和称为路径的权重，也称为路径的长度 在连接两个节点的所有路径中，长度最短的路径称为最短路径，最短路 径的长度称为从起点到终点的距离 12
生物信息学课程网络相关的常见概念Bioinformatics网络中节点G到节点C的路径有：li=(G, A, B, C)12=(G, A, D, C)/3={G, F, A, B, C)14={G, F,A, D, C)从节点G到节点C的路径中，11和/2的长度为3，13和/4的长度为4从节点G到节点C的距离为313
生物信息学 课程 Bioinformatics 网络相关的常见概念 网络中节点G到节点C的路径有： l1={G, A, B, C} l2={G, A, D, C} l3={G, F, A, B, C} l4={G, F, A, D, C} 从节点G到节点C的路径中，l1和l2的长度为3，l3和l4的长度为4 从节点G到节点C的距离为3 13
生物信息学课程常见生物网络及数据库Bioinformatics口基因调控网络VTRANSFAC、TRRD、RegulonDB和AnimalTFDBVJASPAR、DBD口蛋白质互作网络√蛋白质互作网络是研究最充分的生物分子网络往往也是规模最大的生物分子网络，常常包含数于甚至上万个节点以及为数更多的边VBIND、DIP、MIPS、BioGRID和String等口代谢网络和信号传导网络口细胞间通讯网络14
生物信息学 课程 Bioinformatics 常见生物网络及数据库 基因调控网络 ✓TRANSFAC、TRRD、RegulonDB和AnimalTFDB ✓JASPAR、DBD 蛋白质互作网络 ✓蛋白质互作网络是研究最充分的生物分子网络，往往也是规模最大的生物分 子网络，常常包含数千甚至上万个节点以及为数更多的边 ✓BIND、DIP、MIPS、BioGRID和String等 代谢网络和信号传导网络 细胞间通讯网络 14
生物信息学课程常见生物网络及数据库Bioinformatics口代谢通路指细胞中代谢物在酶的作用下转化为新的代谢物过程中所发生的一系列生物化学反应口代谢网络指由代谢反应以及调节这些反应的调控机制所组成的描述细胞内代谢和生理过程的网络口信号传导指细胞将一种类型的生物信号或刺激转换为其他生物信号最终激活细胞反应的过程口信号传导网络指参与信号传导通路的分子和酶以及其间所发生的生化反应所构成的网络15
生物信息学 课程 Bioinformatics 常见生物网络及数据库 代谢通路 指细胞中代谢物在酶的作用下转化为新的代谢物过程中所发生的一系 列生物化学反应 代谢网络 指由代谢反应以及调节这些反应的调控机制所组成的描述细胞内代谢 和生理过程的网络 信号传导 指细胞将一种类型的生物信号或刺激转换为其他生物信号最终激活细 胞反应的过程 信号传导网络 指参与信号传导通路的分子和酶以及其间所发生的生化反应所构 成的网络 15