生物信息学课程系统生物学的研究内容BioinformaticsHumanshaveonlyaboutthreetimes asmanygenes asthi口大量实验数据收集与整合口建立刻画该数据集的数学模型口数学方程的精确计算及数值预测口基于数值模拟与实验数据的模型质量评估temsSoSynthesisAnalyDataSystemsypothesbasesLifeBiologySeneti兼具生物学和信息科学的特点!ModelingCCdificatiotooantitativeVisualizationAeasureme6
生物信息学 课程 Bioinformatics 系统生物学的研究内容 大量实验数据收集与整合 建立刻画该数据集的数学模型 数学方程的精确计算及数值预测 基于数值模拟与实验数据的模型质量 评估 兼具生物学和信息科学的特点! 6
生物信息学课程网络基本概念Bioinformatics口生物分子网络通常由参与生物过程的众多分子元件组成√其中基因和蛋白质等分子是关键的构成要素口从系统的角度来看,关键在于元件之间的相互关系,而非元件本身√在生物分子网络中,关系可以体现为分子与分子之间的相互作用,或某种化学反应TranscriptionaltranslationproteinRegulationRNAPmRNAregulationbinding+/transcriptionDNApromotercoding regionterminatorregulatoryregionnon-coding7
生物信息学 课程 Bioinformatics 网络基本概念 生物分子网络通常由参与生物过程的众多分子元件组成 ✓ 其中基因和蛋白质等分子是关键的构成要素 从系统的角度来看,关键在于元件之间的相互关系,而非元件本身 ✓ 在生物分子网络中,关系可以体现为分子与分子之间的相互作用,或某种化学反 应 7
生物信息学课程网络基本概念BioinformaticsCERPathwayoperatesSubstrateErt onEnzyme1AllostericEndproductSubstrate1indstoenzymeEnzyme2FeedbackinhibitionSubstrate2Enzyme3Endproduct转录调控网络蛋白互作网络代谢网络8
生物信息学 课程 Bioinformatics 网络基本概念 转录调控网络 8 蛋白互作网络 代谢网络
生物信息学课程网络基本概念BioinformaticsConventionalSingleomicsTrans-omicsGenomeMeasurementmolecularbiologySystembiologyNGSIntegrative physiologyTranscriptomeSystem medicineRNA-seq (NGS)SystempharmacologyMicroarrayProteomeRegenerativemedicineMass spectrometryIntegrated biomarkersMetabolomeHumandiseasePredictionMassspectrometryDiagnosticsTreatment efficacyNMR9
生物信息学 课程 Bioinformatics 网络基本概念 9
生物信息学课程网络的定义Bioinformatics口通常用图G=(V,E)表示网络(network)√其中V是网络中节点的集合,每个节点代表一个生物分子:E是边的集合口当V中的两个节点v1与v2之间存在一条属于E的边e1时,称边e1连接v1与v2,或者称v1连接于v2,也称作v2是v1的邻居10
生物信息学 课程 Bioinformatics 网络的定义 通常用图G=(V,E)表示网络(network) ✓其中V是网络中节点的集合,每个节点代表一个生物分子;E是边的集合 当V中的两个节点v1与v2之间存在一条属于E的边e1时,称边e1 连接v1与v2,或者称v1连接于v2,也称作v2是v1的邻居 10