生物信息学课程Bioinformatics第六章基因组学及宏基因组学
生物信息学 课程 Bioinformatics 第六章 基因组学及宏基因组学
生物信息学课程本章内容Bioinformatics：首先，定义了基因组学，并讨论了获得和解读基因组序列的方法，并介绍了高通量测序技术在动植物和微生物DNA测序中的应用。·其次，详细介绍了基因组组装的算法、基因预测技术和基因组注释的方法。·第三，深入探讨了序列变异检测的基本原理和技术·第四，宏基因组学部分概述了微生物组学的概念、数据分析方法，以及在健康和环境领域的应用·最后，对基因组和宏基因组的未来发展方向进行了展望。2
2 生物信息学 课程 Bioinformatics 本章内容 • 首先，定义了基因组学，并讨论了获得和解读基因组序列的方法，并介绍了高通量测序技术在动 植物和微生物DNA测序中的应用。 • 其次，详细介绍了基因组组装的算法、基因预测技术和基因组注释的方法。 • 第三，深入探讨了序列变异检测的基本原理和技术。 • 第四，宏基因组学部分概述了微生物组学的概念、数据分析方法，以及在健康和环境领域的应用。 • 最后，对基因组和宏基因组的未来发展方向进行了展望
生物信息学课程目录大纲Bioinformatics基因组学概述01研究基因组序列、结构和功能的科学。基因组组装与注释02基因组组装算法、基因预测技术和基因组注释方法。序列变异检测03单碱基替换、短插入缺失和结构变异的检测技术宏基因组学04微生物组学概念、数据分析方法，以及在健康和环境领域的应用。3
生物信息学 课程 Bioinformatics 基因组学概述 研究基因组序列、结构和功能的科学。 01 基因组组装与注释 基因组组装算法、基因预测技术和基因组注释方法。 02 03 序列变异检测 单碱基替换、短插入缺失和结构变异的检测技术。 宏基因组学 微生物组学概念、数据分析方法，以及在健康和环境领域的应用。 04 3 目录大纲
生物信息学课程基因组学概述Bioinformatics：基因组学（Genomics），简单来说就是研究基因组（Genome）的科学·在基因组学中所研究的问题主要分为三类：·如何获得基因组序列·如何解读/解码基因组·如何重写/编写新的基因组4
4 生物信息学 课程 Bioinformatics 基因组学概述 • 基因组学（Genomics），简单来说就是研究基因组（Genome）的科学 • 在基因组学中所研究的问题主要分为三类： • 如何获得基因组序列 • 如何解读/解码基因组 • 如何重写/编写新的基因组
生物信息学课程基因组学概述Bioinformatics测序原理及方法BA Sanger测序法/双脱氧链终止法二代测序法/边合成边测序荧光标记 (可切除)魅终止（可逆）QdGTPGCO一个测序：4个反应，4条泳道英光标记OdCTPCGCG.CGddGTPATATBa#adATP.复应A模板引物[P标记】ATedaCTP.dTTP3'ca86ddATPycle/PA福EHTT+ddATP+ddTTP+ddGTP+ddCTPddTTPteoCyclei+fTTDNATTccA+GG3GACKRUOUHUOKEUREPAROANOOAUUOAT加一个减基，1切除爱复基团，加下个减基+1AAA终止，漳灭荧光基团，oUuO0读取荧光进入下一轮循坏c3C0自动化A83883AN个智环，N个破基延伸2终止于肉毛细管电泳.+.TAE1+2cyclel/+1分子嵌1(custer)50004直读N眼毛细管dATPddATP=10:1爱胶放射自显影图..ATA五补链芯片N个测序N个分子链，N个读膜（read）(A)Sanger测序法基本原理及其毛细管电泳自动化。(B)二代高通量并行测序原理。5
生物信息学 课程 Bioinformatics 基因组学概述 测序原理及方法 (A)Sanger测序法基本原理及其毛细管电泳自动化。(B)二代高通量并行测序原理。 5