生物信息学课程Bioinformatics第九章蛋白质与代谢组学(第2&4节)
生物信息学 课程 Bioinformatics 第九章 蛋白质与代谢组学(第2&4节)
生物信息学课程讲课提纲(第2节和第4节)Bioinformatics蛋白质结构简介蛋白质结构预测与分析蛋白质功能预测与分析总结
生物信息学 课程 Bioinformatics 讲课提纲(第2节和第4节) 蛋白质结构简介 蛋白质结构预测与分析 蛋白质功能预测与分析 总结 1
生物信息学课程蛋白质结构的组织形式Bioinformatics分为四个层次(一级,二级三级和四级结构)SecondaryTertiaryQuaternaryPrimaryA1999GARLANDPUBLISHINGINCAmemberoftheTaulor&FrucisGrouy2
生物信息学 课程 Bioinformatics 蛋白质结构的组织形式 分为四个层次(一级,二级,三级和四级结构) 2
生物信息学课程蛋白质二级结构α-螺旋与β-折叠Bioinformaticsβ-折叠主链每隔4个残基形成一个氢键最常见的二级结构一个蛋白的平均α-螺旋含量为30%平均长度变化为5-40个残基V分为平行和反平行两种形式一个蛋白的平均β-折叠含量为20%√平均长度变化为5-10个残基形成氢键的两个片段序列距离可以α-螺旋很远3
生物信息学 课程 Bioinformatics 蛋白质二级结构α-螺旋与β-折叠 ✓ 主链每隔4个残基形成一个氢键 ✓ 最常见的二级结构 ✓ 一个蛋白的平均α-螺旋含量为30% ✓ 平均长度变化为5-40个残基 3 α-螺旋 β-折叠 ✓ 分为平行和反平行两种形式 ✓ 一个蛋白的平均β-折叠含量为20% ✓ 平均长度变化为5-10个残基 ✓ 形成氢键的两个片段序列距离可以 很远
生物信息学课程其它二级结构统称为loop或coilBioinformatics连接α-螺旋和β-折叠片的区域通常位于蛋白结构的表面对突变有高容忍度构象具有多样性及更大柔性带电荷和极性氨基酸居多频繁构成活性区域可以划分为一些不同的结构类型,例如转角结构4
4 生物信息学 课程 Bioinformatics 其它二级结构统称为loop或coil • 连接α-螺旋和β-折叠片的区域 • 通常位于蛋白结构的表面 • 对突变有高容忍度 • 构象具有多样性及更大柔性 • 带电荷和极性氨基酸居多 • 频繁构成活性区域 • 可以划分为一些不同的结构类型,例如转角结构