生物信息学课程Bioinformatics第5章序列比对与分析
生物信息学 课程 Bioinformatics 第5章 序列比对与分析
生物信息学课程本章内容Bioinformatics章节结构·第一节：序列特征解析·第二节：序列比对和分析·第三节：分子演化树构建·第四节：讨论与展望·本章作者（以拼音序）：陈士超、高歌、胡德华、田卫东、王明钰·本章统稿/协调：高歌2
2 生物信息学 课程 Bioinformatics 本章内容 章节结构 • 第一节：序列特征解析 • 第二节：序列比对和分析 • 第三节：分子演化树构建 • 第四节：讨论与展望 • 本章作者(以拼音序)： 陈士超、高歌、胡德华、田 卫东、王明钰 • 本章统稿/协调：高歌
生物信息学课程本章内容Bioinformatics本章定位：围绕主流生物学数据（序列），·承上：体现生物信息学“面向数据、方法驱动”的特点·启下：为后续章引入关键概念编写原则：突出基本观念与方法，桥接经典问题与最新进展·丛“小（规模）入手：主要针对生物信息学经典方法，以一个/几个蛋白/核酸序列为主·以“小”见“大”：承上启下，为后续组学章节引入3
生物信息学 课程 Bioinformatics 本章内容 本章定位：围绕主流生物学数据(序列) ， • 承上：体现生物信息学“面向数据、方法驱动”的特点 • 启下：为后续章引入关键概念 3 编写原则：突出基本观念与方法，桥接经典问题与最新进展 • 从“小(规模)”入手：主要针对生物信息学经典方法，以一个/几个蛋白/核酸序 列为主 • 以“小”见“大”：承上启下，为后续组学章节引入
生物信息学课程本章导语Bioinformatics包括DNA、RNA和氨基酸在内的生物序列是生物信息学的主要研究对象之一。序列分析的基本思路可以划分为两天类：一类是着眼于序列自身，通过多种方法提取并解析其中的结构与功能信息，从而揭示DNA、RNA或蛋白质的生物学特性。例如，分析基因组序列的组成可以帮助我们理解基因的结构，预测潜在的编码区域，并探索基因调控机制；同样，通过分析蛋白质序列，可以预测蛋白质的理化性质及其结构特征，并进一步推测其功能和与其他分子的相互作用。另一类则是从序列之间的关系出发，通过定量刻画不同的生物分子序列之间的相似性和差异性，来推测它们的功能关联与演化关系。例如，通过寻找与目标序列相似的已知序列，可用于识别未知目标序列的功能和特性；再如通过比较不同物种或不同个体间的序列差异，可以构建演化树并进而解析其间的演化联系。通过将这些不同的分析方法结合，生物信息学家能够在大量的序列数据中发现潜在的生物学模式与规律，并进而为后续的基因功能研究、药物研发和疾病诊断等领域提供关键基础。4
4 生物信息学 课程 Bioinformatics 本章导语 包括DNA、RNA和氨基酸在内的生物序列是生物信息学的主要研究对象之一。序列分析的基本思路可以 划 分为两大类： 一类是着眼于序列自身，通过多种方法提取并解析其中的结构与功能信息，从而揭示DNA、RNA或蛋白质 的生物学特性。例如，分析基因组序列的组成可以帮助我们理解基因的结构，预测潜在的编码区域，并探索基 因调控机制；同样，通过分析蛋白质序列，可以预测蛋白质的理化性质及其结构特征，并进一步推测其功能和 与其他分子的相互作用。 另一类则是从序列之间的关系出发，通过定量刻画不同的生物分子序列之间的相似性和差异性，来推测 它 们的功能关联与演化关系。例如，通过寻找与目标序列相似的已知序列，可用于识别未知目标序列的功能 和特 性；再如通过比较不同物种或不同个体间的序列差异，可以构建演化树并进而解析其间的演化联系。 通过将这些不同的分析方法结合，生物信息学家能够在大量的序列数据中发现潜在的生物学模式与规律 ， 并进而为后续的基因功能研究、药物研发和疾病诊断等领域提供关键基础
生物信息学课程101计划Bioinformatics第1节序列特征解析
生物信息学 课程 Bioinformatics 第1节 序列特征解析