生物信息学课程基因组学概述Bioinformatics基因组学数据可视化https://genome.ucsc.edulNBLJUcScGenomeBrowser数据界面示例11
11 生物信息学 课程 Bioinformatics 基因组学概述 基因组学数据可视化 UCSC Genome Browser数据界面示例 https://genome.ucsc.edu/
生物信息学课程目录大纲Bioinformatics基因组学概述01研究基因组序列、结构和功能的科学。基因组组装与注释02基因组组装算法、基因预测技术和基因组注释方法。序列变异检测03单碱基替换、短插入缺失和结构变异的检测技术宏基因组学04微生物组学概念、数据分析方法，以及在健康和环境领域的应用。12
生物信息学 课程 Bioinformatics 基因组学概述 研究基因组序列、结构和功能的科学。 01 基因组组装与注释 基因组组装算法、基因预测技术和基因组注释方法。 02 03 序列变异检测 单碱基替换、短插入缺失和结构变异的检测技术。 宏基因组学 微生物组学概念、数据分析方法，以及在健康和环境领域的应用。 04 12 目录大纲
生物信息学课程基因组的组装、预测和注释Bioinformatics1.基因组的组装基因组组装是将测序得到的读长拼接成叠连群，再通过未端配对测序的方法进行组装2. 基因的预测形成支架。基因预测软件使用fasta格式的基因组序列文件作为输入，输出包括基因组索引文件、预测得到的基因序列文件和蛋白质序列文件MOML3.基因组的注释和分析基因组分析的最后一步是对基因组进行注释和分析，包括GO、KEGG、NR等注释方法。13
生物信息学 课程 Bioinformatics 基因组的组装、预测和注释 2. 基因的预测 基因预测软件使用fasta格式的基因组序列文件 作为输入，输出包括基因组索引文件、预测得 到的基因序列文件和蛋白质序列文件。 1. 基因组的组装 基因组组装是将测序得到的读长拼接成叠连 群，再通过末端配对测序的方法进行组装， 形成支架。 3. 基因组的注释和分析 基因组分析的最后一步是对基因组进行注释 和分析，包括GO、KEGG、NR等注释方法。 13
生物信息学课程基因组的组装、预测和注释Bioinformatics基因组的组装序列重叠部分读长组装组装组装叠连群1叠连群2登连群3基于双端测序技术拼接基于双端测序技术拼接支架读长（read）、叠连群（contig）和支架（scaffold）的关系示意图14
生物信息学 课程 Bioinformatics 基因组的组装、预测和注释 基因组的组装 读长（read）、叠连群（contig）和支架（scaffold）的关系示意图 14
生物信息学课程基因组的组装、预测和注释Bioinformatics基因组的组装读长1:TCCATAGGT读长2：ATAGGTTAGTCCATk-merk-merCCATATCCATATAGGCATAGCCATATAGGTATAGGCATAGAGGTTTAGGTATAGGGGTTAAGGTTTAGGTGTTAG合并GGTTAGTTAG构建DBG图TAGGTAGGTTGGTTAGTTAGTCCATCCATACATAGATAGGDeBruijngraph（DBG）图构建示例15
生物信息学 课程 Bioinformatics 基因组的组装、预测和注释 基因组的组装 De Bruijn graph（DBG）图构建示例 15