二、转录因子原核生物RNA多聚酶全酶可与启动子直接结合,只要更换全酶中的西格玛因子(。)即可识别不同的启动子。真核生物的情况要复杂得多,真核生物3种RNA多聚酶都不能直接接触启动子,必须依赖转录因子在启动子区构筑“平台”后,才可进入启动子区参与转录起始复合物的组装。真核生物基因的转录要求:RNA聚合酶十一系列转录因子通常将转录因子分成两类:(1)普遍性转录因子(generaltranscriptionfactor)(2)特异性转录因子(specifictranscriptionfactor)
二、转录因子 原核生物RNA多聚酶全酶可与启动子直接结合,只要更换全酶 中的西格玛因子(σ)即可识别不同的启动子。真核生物的情况要 复杂得多,真核生物3种RNA多聚酶都不能直接接触启动子,必须依 赖转录因子在启动子区构筑“平台”后,才可进入启动子区参与转 录起始复合物的组装。 真核生物基因的转录要求: RNA聚合酶 + 一系列转录因子 通常将转录因子分成两类: (1)普遍性转录因子(general transcription factor) (2)特异性转录因子(specific transcription factor)
普遍性转录因子(generaltranscriptionfactor)也称基础转录因子(basaltranscriptionfactor):它们是转录起始复合物的组成成员,主要任务是将RNA聚合酶定位在核心启动子上,帮助RNA聚合酶正确识别起始位点并开始转录。特异性转录因子(specific/specialtranscriptionfactor)或序列特异性转录因子:使聚合酶特异地应答各种外界的刺激,更加高效而且协调地进行转录。因为,这类转录因子对转录起始复合物的组装及转录速率施加影响,并决定某一基因是否表达,所以又可称其为转录激活因子
普遍性转录因子(general transcription factor)也称 基础转录因子(basal transcription factor):它们是转 录起始复合物的组成成员,主要任务是将RNA聚合酶定位 在核心启动子上,帮助RNA聚合酶正确识别起始位点并开 始转录。 特异性转录因子(specific /special transcription factor)或序列特异性转录因子 :使聚合酶特异地应答各种 外界的刺激,更加高效而且协调地进行转录。因为,这类转 录因子对转录起始复合物的组装及转录速率施加影响,并决 定某一基因是否表达,所以又可称其为转录激活因子
转录激活因子在真核生物基因的表达调控中占有十分重要的地位,绝大多数转录激活因子都可与基因的调控序列结合,属于DNA结合蛋白。转录因子多种多样:可识别上游启动子元件,或与更远的增强子结合,通过直接或借助其他蛋白质的接触来激活前体起始复合物的形成;有些转录因子,如p300/CBP可以修饰组蛋白,部分影响核小体的定位,而非影响前体起始复合物的组装;还有一些转录因子的作用是使DNA弯曲成一定的形状,使其它转录因子相互接触...;还有一些转录因子并无DNA结合活性,只是通过与蛋白质之间接触的方式与前起始复合物作用激活转录
转录激活因子在真核生物基因的表达调控中占有十分重 要的地位, 绝大多数转录激活因子都可与基因的调控序列结 合,属于DNA结合蛋白。 转录因子多种多样:可识别上游启动子元件,或与更远 的增强子结合,通过直接或借助其他蛋白质的接触来激活前 体起始复合物的形成;有些转录因子,如p300/CBP可以修饰 组蛋白,部分影响核小体的定位,而非影响前体起始复合物 的组装;还有一些转录因子的作用是使DNA弯曲成一定的形状, 使其它转录因子相互接触.;还有一些转录因子并无DNA结合 活性,只是通过与蛋白质之间接触的方式与前起始复合物作 用激活转录
DNA-binding siteNameFactorConsensus sequenceCommentsConstitutive'transcription factorsCAATboxCTF/NFI5-GCCAATCT-3UbiquitousCAATbox5-GCCAATCT3CPfamilyUbiquitousCAATboxC/EBP5-GCCAATCT-3UbiquitousEnhancer core5-TGTGGWWWG-3SplGCbox5-GGGCGG-3UbiquitousOctamerOct-l5-ATGCAAAT-3UbiquitousOct-2Octamer5'-ATGCAAAT-3Found in B lymphocytesResponsefactorsHSEHeatshockfactor5'-CNNGAANNTCCNNG-3'Responds toheat shockSRESerum responsefactor5-CCATATTAGG-3Responds to growth factorsin serumSTATIIGRE5-TTNCNNNAA-3See Section 11.1.2Cell-specific factorsGATA-I5-GATA-3Erythroid cell-specificPit-15'-ATATTCAT-3Pituitary-specificMyoDIE-box5'-CANNG-3Myoblast-specificNF-KBKBsite5'GGGACTTTCC-3Lymphoid cell-specificDevelopmental regulatorsBicoid5-TCCTAATCCC-3See Section11.3.3Antennapedia5'-TAATAATAATAATAA-3See Section11.3.3Fushi tarazuSee Section 11.3.35-TCAATTAAATGA-3BasedonTwymanRM(1998)TrancriptionfacorBPCAAT/ehancbindingreinCPCAATbindingpoeinCF/NFICAATrancriptionfacor/nuleafacoATgtradtivracitonNAbiningtatckmmemnmNucleotide sequences:N=anynucleotide:W=Aor T
(A)DirectcontactwiththeRNApolymerasepreinitiationcomplex转录因子通过三种RNA polymeraseII方式激活由RNApolymerase II进行的转录起始Transcription factor(A)一些转录因子与靠近核心启动子的(B)Contactvia a mediatorprotein靶序列结合,然后直接与RNA聚合酶前起始复合物接触。(B)一些转录因子通过与共激活因子或Mediatorprotein者介质蛋白质在转录因子与前起始复合物间形成蛋白质桥(C)Contact via DNAbending(C)通过DNA弯曲而接触
(A)一些转录因子 与靠近核心启动子的 靶序列结合,然后直 接与RNA聚合酶前起 始复合物接触。 (B)一些转录因子 通过与共激活因子或 者介质蛋白质在转录 因子与前起始复合物 间形成蛋白质桥 (C)通过DNA弯曲 而接触 转录因子通过三种 方式激活由RNA polymerase II进行 的转录起始