(二)基因诊断的基本方法 人类疾病的原因包括内因和外因两大类,内因主要是指 遗传因素,即基因结构、表达状况的改变。其中基因结构 的改变包括点突变、插入、缺失,重排、易位、基因扩增、 基因结构多态性变异、前病毒插入等;外因是指外在的环 境因素,如病原体的侵入等。 因此,针对这些病因可采取相应的基因诊断方法,主要 的可从以下几个方面着手:
(二)基因诊断的基本方法 人类疾病的原因包括内因和外因两大类,内因主要是指 遗传因素,即基因结构、表达状况的改变。其中基因结构 的改变包括点突变、插入、缺失,重排、易位、基因扩增、 基因结构多态性变异、前病毒插入等;外因是指外在的环 境因素,如病原体的侵入等。 因此,针对这些病因可采取相应的基因诊断方法,主要 的可从以下几个方面着手:
1、基因突变的诊断 (1)点突变的诊断 ①诊断已知的点突变:对于突变位点已被阐明的一些遗 传病,可以采用PCR/ASO(allele specific oligonucleotide, ASO,等位基因特异性寡核苷酸)探针法进行检测。在扩 增DNA片段后直接与相应寡核苷酸探针杂交,即可明确诊 断是否有突变以及突变是纯合子还是杂合子。 例如,已知某位点正常碱基为C,突变为T(即C→T):
①诊断已知的点突变:对于突变位点已被阐明的一些遗 传病,可以采用PCR/ASO(allele specific oligonucleotide, ASO,等位基因特异性寡核苷酸)探针法进行检测。在扩 增DNA片段后直接与相应寡核苷酸探针杂交,即可明确诊 断是否有突变以及突变是纯合子还是杂合子。 例如,已知某位点正常碱基为C,突变为T(即C→T): 1、基因突变的诊断 (1)点突变的诊断
引物1 突变位点 引物2 在该位点两端设计引物1、2进行PCR扩增,得到产物 后进行斑点杂交或狭缝杂交(P177)。针对该突变分别 合成一对寡核苷酸片段作为探针;其中一个为正常探针, 与正常序列互补(中央碱基为G);另一个是突变探针, 与突变序列互补(中央碱基为A)。突变碱基及对应
在该位点两端设计引物1、2进行PCR扩增,得到产物 后进行斑点杂交或狭缝杂交 (P177)。针对该突变分别 合成一对寡核苷酸片段作为探针;其中一个为正常探针, 与正常序列互补(中央碱基为G);另一个是突变探针, 与突变序列互补(中央碱基为A)。突变碱基及对应 3′ 突变位点 5′ 引物2 引物1
的正常碱基均位于寡核苷酸片段的中央,因为只有在这个 位置时,该碱基与被探测的DA上相应碱基或匹配或错配, 对二者结合力影响最大。严格控制杂交及洗脱条件,使只 有与靶序列完全互补的探针才能结合在等位基因片段上, 而中央碱基与靶序列不匹配的探针则不能结合在等位基因 片段上
的正常碱基均位于寡核苷酸片段的中央,因为只有在这个 位置时,该碱基与被探测的DNA上相应碱基或匹配或错配, 对二者结合力影响最大。严格控制杂交及洗脱条件,使只 有与靶序列完全互补的探针才能结合在等位基因片段上, 而中央碱基与靶序列不匹配的探针则不能结合在等位基因 片段上
结果分析:a.如果从受检者DNA扩增的PCR产物与正常 探针杂交,而不和突变探针杂交,表示受检者不存在这种 突变基因;b.如果只有突变探针可以杂交,则说明突变基 因是纯合子;c.若正常探针与突变探针都可杂交,说明突 变基因是杂合子;d.如果患者的DNA与正常探针以及所有 已知突变基因的寡核苷酸探针均不能杂交,则提示患者的 缺陷基因不属于先前已发现的突变类型,而很可能是一种 新的突变类型
结果分析:a. 如果从受检者DNA扩增的PCR产物与正常 探针杂交,而不和突变探针杂交,表示受检者不存在这种 突变基因;b. 如果只有突变探针可以杂交,则说明突变基 因是纯合子;c. 若正常探针与突变探针都可杂交,说明突 变基因是杂合子;d. 如果患者的DNA与正常探针以及所有 已知突变基因的寡核苷酸探针均不能杂交,则提示患者的 缺陷基因不属于先前已发现的突变类型,而很可能是一种 新的突变类型