板,被选为模板的单链称为模板链,亦称无义链;另一条单链称为非 模板链,即编码链,因编码链与转录生成的RNA序列T变为U外其 他序列一致,所以又称有义链。DNA上的转录区域称为转录单位。 翻译:翻译是蛋白质生物合成(基因表达中的一部分,基因表达 还包括转录)过程中的第二步(转录为第一步),翻译是根据遗传密 码的中心法则,将成熟的信使RNA分子(由DNA通过转录而生成) 中“碱基的排列顺序”(核苷酸序列)解码,并生成对应的特定氨基酸 序列的过程。但也有许多转录生成的RNA,如转运RNA(tRNA)、核 糖体RNA(rRNA)和小核RNA(snRNA)等并不被翻译为氨基酸序 列。 5、编码区、非编码区(P5) 基因在结构上,分为编码区和非编码区两分(其中非编码区对 基因的表达主要起调控作用,如启动子等位于该区)。真核生物基因 的编码区是不连续的,分为外显子和内含子(其中外显子是可以最终 实现表达(表现在蛋白质的一级结构上),内含子则最终不能表达(所 以真核生物基因表达过程中,转录产物—信使RNA不能直接进行 翻译,而是要修剪掉内含子部分后才能去指导翻译)。原核生物的基 因是连续的,所以谈不上外显子、内含子的区分。 6、神经递质、神经受体(P5) 神经递质:神经递质(英文neurotransmitter)在突触传递中是担
板,被选为模板的单链称为模板链,亦称无义链;另一条单链称为非 模板链,即编码链,因编码链与转录生成的 RNA 序列 T 变为 U 外其 他序列一致,所以又称有义链。DNA 上的转录区域称为转录单位。 翻译:翻译是蛋白质生物合成(基因表达中的一部分,基因表达 还包括转录)过程中的第二步(转录为第一步),翻译是根据遗传密 码的中心法则,将成熟的信使 RNA 分子(由 DNA 通过转录而生成) 中“碱基的排列顺序”(核苷酸序列)解码,并生成对应的特定氨基酸 序列的过程。但也有许多转录生成的 RNA,如转运 RNA(tRNA)、核 糖体 RNA(rRNA)和小核 RNA(snRNA)等并不被翻译为氨基酸序 列。 5、编码区、非编码区(P5) 基因在结构上,分为编码区和非编码区两部分(其中非编码区对 基因的表达主要起调控作用,如启动子等位于该区)。真核生物基因 的编码区是不连续的,分为外显子和内含子(其中外显子是可以最终 实现表达(表现在蛋白质的一级结构上),内含子则最终不能表达(所 以真核生物基因表达过程中,转录产物——信使 RNA 不能直接进行 翻译,而是要修剪掉内含子部分后才能去指导翻译)。原核生物的基 因是连续的,所以谈不上外显子、内含子的区分。 6、神经递质、神经受体(P5) 神经递质:神经递质(英文 neurotransmitter)在突触传递中是担
当“信使"的特定化学物质,简称递质。随着神经生物学的发展,陆续 在神经系统中发现了大量神经活性物质。 神经受体:无神经受体,有神经递质受体。 神经递质受体:在化学突触传递中担当信使的特定化学物质,简称 递质。神经递质受体都是一些跨越细胞膜的蛋白质复合体。 7、药物作用靶(P5) 无药物作用靶,有靶点。 靶点,医学上进行某些放射治疗时,放射线从不同方位照射, 汇集病变部位,这个病变部位叫做靶点。 8、分子生物学(P4)、细胞生物学(P5)、神经生物学(P5)、系统生 物学(P8)、网络生物学、进化生物学(P5)、计算生物学(P7) 分子生物学:分子生物学是生命科学发展过程中诞生的一门实验性 极强的新兴学科。美国著名分子生物学家Robert F.Weaver遵循这一 学科发展的特点,于1999年出版了Molecular Biology一书。《分子 生物学(第五版)》以原始研究论文为基础,通过对实验的设计、对 结果的分析而逐步展开对分子生物学理论的讲述,文字通俗流畅,叙 述由浅入深。随着学科的迅速发展,几经修订再版的《分子生物学》 第五版共有导论,分子生物学方法,原核生物的转录,真核生物的转 录,转录后加工,翻译,DNA复制、重组和转座,以及基因组等8个 部分共25章的内容,书后还附有术语表。每一章节都以提出科学问
当“信使”的特定化学物质,简称递质。随着神经生物学的发展,陆续 在神经系统中发现了大量神经活性物质。 神经受体:无神经受体,有神经递质受体。 神经递质受体:在化学突触传递中担当信使的特定化学物质,简称 递质。神经递质受体都是一些跨越细胞膜的蛋白质复合体。 7、药物作用靶(P5) 无药物作用靶,有靶点。 靶点, 医学上进行某些放射治疗时,放射线从不同方位照射, 汇集病变部位,这个病变部位叫做靶点。 8、分子生物学(P4)、细胞生物学(P5)、神经生物学(P5)、系统生 物学(P8)、网络生物学、进化生物学(P5)、计算生物学(P7) 分子生物学:分子生物学是生命科学发展过程中诞生的一门实验性 极强的新兴学科。美国著名分子生物学家 Robert F.Weaver 遵循这一 学科发展的特点,于 1999 年出版了 Molecular Biology 一书。《分子 生物学(第五版)》以原始研究论文为基础,通过对实验的设计、对 结果的分析而逐步展开对分子生物学理论的讲述,文字通俗流畅,叙 述由浅入深。随着学科的迅速发展,几经修订再版的《分子生物学》 第五版共有导论,分子生物学方法,原核生物的转录,真核生物的转 录,转录后加工,翻译,DNA 复制、重组和转座,以及基因组等 8 个 部分共 25 章的内容,书后还附有术语表。每一章节都以提出科学问
题、展开研究过程开始,以提供思考习题、推荐阅读文献结束。 细胞生物学:细胞生物学(Cel‖Biology)是在显微、亚显微和分子水 平三个层次上,研究细胞的结构、功能和各种生命规律的一门科学。 细胞生物学由Cytology发展而来,Cytology是关于细胞结构与功能 (特别是染色体)的研究。现代细胞生物学从显微水平、超微水平和分 子水平等不同层次研究细胞的结构、功能及生命活动。在我国基础学 科发展规划中,细胞生物学与分子生物学、神经生物学和生态学并列 为生命科学的四大基础学科 神经生物学:神经生物学,21世纪的明星学科。神经生物学是生物 学中研究神经系统的解剖,生理,神经生物学病理方面内容的一个 分支。从上个世纪90年代以来,世界科研强国加快了对神经生物学 研究的投入。神经科学是专门研究神经系统的结构、功能、发育、遗 传学、生物化学、生理学、药理学及病理学的一门科学。对行为及学 习的研究都是神经科学的分支。 系统生物学:研究生物系统组成成分的构成与相互关系的结构、动 态与发生,以系统论和实验、计算方法整合研究为特征的生物学。系 统生物学不同于以往仅仅关心个别的基因和蛋白质的分子生物学,在 于研究细胞信号传导和基因调控网路、生物系统组成之间相互关系的 结构和系统功能的涌现。 进化生物学:进化生物学(evolutionary biology)进化生物学是生 物学最基本的理论之一,由查尔斯达尔文提出的进化论。他第一次提 出自然选择是进化的一个机制。研究生物进化过程和生物群落特征
题、展开研究过程开始,以提供思考习题、推荐阅读文献结束。 细胞生物学:细胞生物学(Cell Biology)是在显微、亚显微和分子水 平三个层次上,研究细胞的结构、功能和各种生命规律的一门科学。 细胞生物学由 Cytology 发展而来,Cytology 是关于细胞结构与功能 (特别是染色体)的研究。现代细胞生物学从显微水平、超微水平和分 子水平等不同层次研究细胞的结构、功能及生命活动。在我国基础学 科发展规划中,细胞生物学与分子生物学、神经生物学和生态学并列 为生命科学的四大基础学科 神经生物学:神经生物学,21 世纪的明星学科。神经生物学是生物 学中研究神经系统的解剖,生理, 神经生物学病理方面内容的一个 分支。从上个世纪 90 年代以来,世界科研强国加快了对神经生物学 研究的投入。神经科学是专门研究神经系统的结构、功能、发育、遗 传学、生物化学、生理学、药理学及病理学的一门科学。对行为及学 习的研究都是神经科学的分支。 系统生物学:研究生物系统组成成分的构成与相互关系的结构、动 态与发生,以系统论和实验、计算方法整合研究为特征的生物学。系 统生物学不同于以往仅仅关心个别的基因和蛋白质的分子生物学,在 于研究细胞信号传导和基因调控网路、生物系统组成之间相互关系的 结构和系统功能的涌现。 进化生物学:进化生物学(evolutionary biology)进化生物学是生 物学最基本的理论之一,由查尔斯·达尔文提出的进化论。他第一次提 出自然选择是进化的一个机制。 研究生物进化过程和生物群落特征
的综合学科,包括生态学、行为学和分类学等。进化生物学,包括进 化遗传学、进化基因组学(evolutional genomics),进化论是实验生 物学的理论依据,基于系统论的生物系统泛进化论建立系统生物学的 理论基础,遗传学与基因组研究是进化生物学的方法体系,尤其是系 统遗传学开创了对基因组自组织进化与生物体发育自组织化及其相 互关系的细胞发生系统动力学研究,为进化生物学的发展开拓了新的 途径。 计算生物学:指开发和应用数据分析及理论的方法、数学建模、 计算机仿真技术等。计算生物学的最终目的不仅仅局限于测序,而是 运用计算机的思维解决生物问题,用计算机的语言和数学的逻辑构建 和描述并模拟出生物世界。相对于生物信息学,计算生物学的层次更 高。虽然两者之间界限模糊,但生物信息学略微偏向于生物而计算生 物学略微偏向计算机。生物信息学侧重于数据的提取、挖掘,而计算 生物学侧重对数据的处理、运用。计算生物学的最终目的不只局限于 测序,而是运用计算机的思维解决生物问题,用计算机的语言和数学 的逻辑构建和描述并模拟出生物世界。 第三节生物信息学的主要应用 1、EMBL(P6) EMBL,欧洲分子生物学实验室EMBL(European Molecular Biology Laboratory)1974年由欧洲14个国家加上亚洲的以色列共同发起建 立,现在由欧洲30个成员国政府支持组成,目的在于促进欧洲国家
的综合学科,包括生态学、行为学和分类学等。进化生物学,包括进 化遗传学、进化基因组学(evolutional genomics),进化论是实验生 物学的理论依据,基于系统论的生物系统泛进化论建立系统生物学的 理论基础,遗传学与基因组研究是进化生物学的方法体系,尤其是系 统遗传学开创了对基因组自组织进化与生物体发育自组织化及其相 互关系的细胞发生系统动力学研究,为进化生物学的发展开拓了新的 途径。 计算生物学:指开发和应用数据分析及理论的方法、数学建模、 计算机仿真技术等。计算生物学的最终目的不仅仅局限于测序,而是 运用计算机的思维解决生物问题,用计算机的语言和数学的逻辑构建 和描述并模拟出生物世界。相对于生物信息学,计算生物学的层次更 高。虽然两者之间界限模糊,但生物信息学略微偏向于生物而计算生 物学略微偏向计算机。生物信息学侧重于数据的提取、挖掘,而计算 生物学侧重对数据的处理、运用。计算生物学的最终目的不只局限于 测序,而是运用计算机的思维解决生物问题,用计算机的语言和数学 的逻辑构建和描述并模拟出生物世界。 第三节 生物信息学的主要应用 1、EMBL(P6) EMBL,欧洲分子生物学实验室 EMBL(European Molecular Biology Laboratory)1974 年由欧洲 14 个国家加上亚洲的以色列共同发起建 立,现在由欧洲 30 个成员国政府支持组成,目的在于促进欧洲国家
之间的合作来发展分子生物学的基础研究和改进仪器设备、教育工作 等。EMBL分为7个部分:结构、分化、物理仪器、生化仪器、生物 仪器、计算机和应用数学。它的宗旨是:从事结构分子生物学及分子 医学方面的基础研究;为科学家、学生及访问学者提供高层次的培训; 为成员国的科学家提供必需的科研服务;在生命科学领域开发新型的 科研仪器及研究方法;积极参与生物技术的转化及应用。 2、KEGG(P6) KEGG,京都基因与基因组百科全书,英文全称为Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes。.KEGG由日本京都大学生物信 息学中心的Kanehisa实验室于1995年建立,是国际最常用的生物信 息数据库之一,以“理解生物系统的高级功能和实用程序资源库"著称。 3、联合数据库系统(P6】 联合数据库系统:许多组织的计算资源,包括在部门或分部作为独 立系统存在的局域网(LAN)、小型计算机和大型计算机,这些系统有 各自的数据库,当建造一个企业计算平台来互连一个组织时,组织内 分散的异构数据库系统就应结合成联合系统以供多个用户访问数据。 4、Ontology(P6) ontology 英[on'tplad3到 美[an'talad3 n.本体论;存在论;实体论
之间的合作来发展分子生物学的基础研究和改进仪器设备、教育工作 等。EMBL 分为 7 个部分:结构、分化、物理仪器、生化仪器、生物 仪器、计算机和应用数学。它的宗旨是:从事结构分子生物学及分子 医学方面的基础研究;为科学家、学生及访问学者提供高层次的培训; 为成员国的科学家提供必需的科研服务;在生命科学领域开发新型的 科研仪器及研究方法;积极参与生物技术的转化及应用。 2、KEGG(P6) KEGG ,京都基因与基因组百科全书,英文全称为 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes。KEGG 由日本京都大学生物信 息学中心的 Kanehisa 实验室于 1995 年建立,是国际最常用的生物信 息数据库之一,以“理解生物系统的高级功能和实用程序资源库”著称。 3、联合数据库系统(P6) 联合数据库系统:许多组织的计算资源,包括在部门或分部作为独 立系统存在的局域网(LAN)、小型计算机和大型计算机,这些系统有 各自的数据库,当建造一个企业计算平台来互连一个组织时,组织内 分散的异构数据库系统就应结合成联合系统以供多个用户访问数据。 4、Ontology(P6)