苏州大学医学部药学院 教 案 课程名称： 药物学总论实验 授课对象： 2018级整合药学 授课学时： 54 《药物化学》尤启冬主编，化学工业出版社，第三版 教材版本： 《生物药剂学与药代动力学》刘建平主编，人民卫生出版社，第五版
苏州大学医学部药学院 教 案 课程名称： 药物学总论实验 授课对象： 2018 级整合药学 授课学时： 54 教材版本： 《药物化学》尤启冬主编，化学工业出版社，第三版 《生物药剂学与药代动力学》刘建平主编，人民卫生出版社，第五版
《病理生理学》王建枝主编，人民卫生出版社，第九版 《药理学》朱依谆主编，人民卫生出版社，第八版 《药剂学》方亮主编，人民卫生出版社，第八版 《药物分析》杭太俊主编，人民卫生出版社，第八版 主讲教师： 林芳、田盛、薛洁、程亮、张经硕 苏州大学医学部药学院制 2020年8月26日 苏州大学医学部药学院授课教案 授课教师：田盛授课日期：2020.9.14 课程名称 药物学总论实验 所属学科 药学 教材名称 整合药学实验讲义 授课年级 2018级整合药学班 授课章节 计算机铺助药物设计 授课时间 200分钟
《病理生理学》王建枝主编，人民卫生出版社，第九版 《药理学》朱依谆主编，人民卫生出版社，第八版 《药剂学》方亮主编，人民卫生出版社，第八版 《药物分析》杭太俊主编，人民卫生出版社，第八版 主讲教师： 林芳、田盛、薛洁、程亮、张经硕 苏州大学医学部药学院制 2020 年 8 月 26 日 苏州大学医学部药学院授课教案 授课教师：田盛授课日期：2020.9.14 课程名称 药物学总论实验 所属学科 药学 教材名称 整合药学实验讲义 授课年级 2018 级整合药学班 授课章节 计算机辅助药物设计 授课时间 200 分钟
1. 教学目标：含知识目标、技能（能力）目标 1. 知识目标： 1.熟悉分子模拟和药物设计的基本原理，掌握计算机辅助药物分子设计中的一些新方法、新手段。 2.熟悉主流药物设计平台如Linux系统和掌握若干主流药物设计软件如NAMD、PyMol、.Discovery Studio、MOE等的一些常规操作和使用 方法。 3.掌握受体学说的基础知识，了解针对特定蛋白靶点的同源建模和分子对接等。 2. 技能（能力）目标： 通过对计算机辅助药物分子设计经典理论的讲解和常用药物设计软件工具的演示，使学生感受分子模拟和计算机辅助药物分子设计的新方 法、新手段，培养学生们进行AI+创新药物研发的能力。 2. 授课内容（依据教学大纲）及时间分配 1.实验内容的讲解(80分钟) 2.实验操作的示范（20分钟) 3.实验操作指导和视频演示(90分钟) 4.实验总结(10分钟) 0 教学重点与难点 1. 教学重点
1. 教学目标：含知识目标、技能（能力）目标 1. 知识目标： 1. 熟悉分子模拟和药物设计的基本原理，掌握计算机辅助药物分子设计中的一些新方法、新手段。 2. 熟悉主流药物设计平台如 Linux 系统和掌握若干主流药物设计软件如 NAMD、PyMol、Discovery Studio、MOE 等的一些常规操作和使用 方法。 3. 掌握受体学说的基础知识，了解针对特定蛋白靶点的同源建模和分子对接等。 2. 技能（能力）目标： 通过对计算机辅助药物分子设计经典理论的讲解和常用药物设计软件工具的演示，使学生感受分子模拟和计算机辅助药物分子设计的新方 法、新手段，培养学生们进行 AI+创新药物研发的能力。 2. 授课内容（依据教学大纲）及时间分配 1. 实验内容的讲解（80 分钟） 2. 实验操作的示范（20 分钟） 3. 实验操作指导和视频演示（90 分钟） 4. 实验总结（10 分钟） 3. 教学重点与难点 1. 教学重点
(1)生物大分子的显示方式；小分子化合物的显示方式 (2)同源模建的一般流程操作包括模板的识别、目标序列和模板的比对、目标序列三维模型的构建以及模型的评估。 (3)分子对接的一般步骤流程；刚性对接、半柔性对接和全柔性对接的介绍和区别。 2. 教学难点 1 结合口袋重要氨基酸残基的理解；生物大分子和小分子化合物相互作用示意图的导出。 2. 如何理解靶点蛋白三维结构的保守性和多样性；同源模建得到的蛋白质三维结构的的评价指标和原理。 3. 在具体靶点体系中如何选择合适的分子对接方法；分子对接在药物设计中具体应用；基于分子对接的虚拟筛选简介和操作。 4. 教学方法选择 (1)讲授法 (2)实际操作视频演示+研讨法 更新或补充内容提要 无 o 复习思考题 1.蛋白质和小分子化合物几种常见的图形显示方法有哪些？ 2.如何定量评价同源模建蛋白模型的优劣？ 3.在药物研发中，如何灵活应用分子对接方法来提高药物发现的效率？
（1）生物大分子的显示方式；小分子化合物的显示方式 （2）同源模建的一般流程操作包括模板的识别、目标序列和模板的比对、目标序列三维模型的构建以及模型的评估。 （3）分子对接的一般步骤流程；刚性对接、半柔性对接和全柔性对接的介绍和区别。 2. 教学难点 1. 结合口袋重要氨基酸残基的理解；生物大分子和小分子化合物相互作用示意图的导出。 2. 如何理解靶点蛋白三维结构的保守性和多样性；同源模建得到的蛋白质三维结构的的评价指标和原理。 3. 在具体靶点体系中如何选择合适的分子对接方法；分子对接在药物设计中具体应用；基于分子对接的虚拟筛选简介和操作。 4. 教学方法选择 （1）讲授法 （2）实际操作视频演示+研讨法 5. 更新或补充内容提要 无 6. 复习思考题 1. 蛋白质和小分子化合物几种常见的图形显示方法有哪些？ 2. 如何定量评价同源模建蛋白模型的优劣？ 3. 在药物研发中，如何灵活应用分子对接方法来提高药物发现的效率？
7. 学习资源、课外自主学习参考 1.学校图书馆资料库平台：中国知网、重庆维普、万方数据库、ACS、Elsevier.. 2.《药物设计学》，叶德泳主编，高等教育出版社，第三版； 3.《常用计算机辅助药物设计软件教程》，张亮仁主编，中国医药科技出版社，第一版。 4.Google学术搜索等。 苏州大学医学部药学院授课教案 授课教师：林芳授课日期：2020年9月16日 课程名称 药物学总论实验 所属学科 药学 教材名称 《整合药学实验教程》 授课年级 2018级整合药学班 授课章节 药理学实验基本知识和技能 授课时间 200分钟 1. 教学目标：含知识目标、技能（能力）目标
7. 学习资源、课外自主学习参考 1. 学校图书馆资料库平台：中国知网、重庆维普、万方数据库、ACS、Elsevie r…… 2.《药物设计学》，叶德泳主编，高等教育出版社，第三版； 3.《常用计算机辅助药物设计软件教程》，张亮仁主编，中国医药科技出版社，第一版。 4. Google 学术搜索等。 苏州大学医学部药学院授课教案 授课教师： 林芳授课日期： 2020 年 9 月 16 日 课程名称 药物学总论实验 所属学科 药学 教材名称 《整合药学实验教程》 授课年级 2018 级整合药学班 授课章节 药理学实验基本知识和技能 授课时间 200 分钟 1. 教学目标：含知识目标、技能（能力）目标