1 浙江大学 遗传学第五章 1 第五章 数量性状遗传 浙江大学 遗传学第五章 2 1. 数量性状的特征及与质量性状的区别; 2. 遗传率和在育种上的应用; 3. 数量性状的基因定位; 4. 近亲繁殖和回交的遗传效应; 5. 纯系学说和意义; 6. 杂种优势。 本章重点 浙江大学 遗传学第五章 3 前述的遗传现象是基于一个共同的遗传本质,即生物体 的遗传表现直接由其基因型所决定Î可根据遗传群体的表现 变异推测群体的基因型变异或基因的差异。 质量性状(qualitative trait)的特点:表现型和基因型 的变异不连续(discontinuous)。 在杂种后代的分离群体中 Î 可以采用经典遗传学分析方法, 研究其遗传动态。 浙江大学 遗传学第五章 4 生物界中还存在另一类遗传性状,其表现型变异是 连续的(continuous)Î数量性状(quantitative trait)。 例如,人高、动物体重、植株生育期、果实大小, 产量高低等。 表现型变异分析 Î 推断群体的 遗传变异Î借助数量统计的分析方法 Î分析数量性状的遗传规律。 ②.准连续变异(Quasi continuous variation): 如分蘖数(穗数)、 产蛋量、每穗粒数等, 但大测量值时,每个 数值均可能出现,不 出现有小数点数字。 但有的性状即有质量亦有数量性状的特点Î质量-数量 性状。 数量性状的类别: ①.严格的连续变异(Continuous variation) :如人身高; 株高、粒重、产量;棉花纤维长度、细度、强度等; 浙江大学 遗传学第五章 6 第一节 群体的变异
1 浙江大学 遗传学第五章 1 第五章 数量性状遗传 浙江大学 遗传学第五章 2 1. 数量性状的特征及与质量性状的区别; 2. 遗传率和在育种上的应用; 3. 数量性状的基因定位; 4. 近亲繁殖和回交的遗传效应; 5. 纯系学说和意义; 6. 杂种优势。 本章重点 浙江大学 遗传学第五章 3 前述的遗传现象是基于一个共同的遗传本质,即生物体 的遗传表现直接由其基因型所决定Î可根据遗传群体的表现 变异推测群体的基因型变异或基因的差异。 质量性状(qualitative trait)的特点:表现型和基因型 的变异不连续(discontinuous)。 在杂种后代的分离群体中 Î 可以采用经典遗传学分析方法, 研究其遗传动态。 浙江大学 遗传学第五章 4 生物界中还存在另一类遗传性状,其表现型变异是 连续的(continuous)Î数量性状(quantitative trait)。 例如,人高、动物体重、植株生育期、果实大小, 产量高低等。 表现型变异分析 Î 推断群体的 遗传变异Î借助数量统计的分析方法 Î分析数量性状的遗传规律。 ②.准连续变异(Quasi continuous variation): 如分蘖数(穗数)、 产蛋量、每穗粒数等, 但大测量值时,每个 数值均可能出现,不 出现有小数点数字。 但有的性状即有质量亦有数量性状的特点Î质量-数量 性状。 数量性状的类别: ①.严格的连续变异(Continuous variation) :如人身高; 株高、粒重、产量;棉花纤维长度、细度、强度等; 浙江大学 遗传学第五章 6 第一节 群体的变异
2 浙江大学 遗传学第五章 7 生物群体的变异 Î 表现型变异 ¬ 遗传变异。 数量性状的遗传变异 Î 群体内各个体间遗传组成的差异。 当基因表达不因环境变化而异:个体表现型值(phenotypic value,P)是基因型值(genotypic value,G)和随机机误 (random error,e)的总和,P=G+e。 其中:随机机误是个体生长发育 过程所处小环境中的随机效应。 浙江大学 遗传学第五章 8 常采用方差(variance)度量某个性状的变异程度。 ∴遗传群体的表现型方差(phenotypic variance,VP)Î 基因型方差(genotypic variance, VG)¬ 机误方差(error Variance,Ve)。 VP =VG + Ve。 控制数量性状的基因具有各种效应,主要包括: 加性效应(additive effect,A):基因座(locus)内 等位基因(allele)的累加效应; 显性效应(dominance effect,D):基因座内等位基因 之间的互作效应。 浙江大学 遗传学第五章 9 基因型值是各种基因效应的总和。对于加性-显性模型 G=A+D,表现型值也可相应分解为P =G+e =A+D+e 。 群体表现型方差 Î 分解为加性效应、显性效应和机误 效应三种方差分量(VP=VA+VD+Ve)。 对于某些性状,不同基因座的非等位基因之间可能存在 相互作用,即上位性效应(epitasis effect,I)。 基因型值和表现型值 Î G=A+D+I 和P=A+D+I+e, 群体表现型变异Î VP=VA+VD+VI+Ve。 浙江大学 遗传学第五章 10 设只存在基因加性效应(G=A),F2表现型值频率: 当机误效应不存在时:如性状受少数基因(如1~5对) 控制,表现典型的质量性状;但基因数目较多时(如10对) 则有类似数量性状的表现。 当存在机误效应时,表现型 呈连续变异。当受少数基因(如 1~5对)控制时,可对分离个体 进行分组;但基因数目较多(如 10对)则呈典型数量性状表现。 浙江大学 遗传学第五章 11 亦可用杨辉三角形中双数行(即第二列中的2、4、 .、8)来表示 , 如下图: 1 1 1 2 1 ⇐ n=1 1 3 3 1 1 4 6 4 1 ⇐ n=2 1 5 10 10 5 1 1 6 15 20 15 6 1 ⇐ n=3 1 7 21 35 35 21 7 1 1 8 28 56 70 56 28 8 1 ⇐ n=4 浙江大学 遗传学第五章 12 ∴多基因(polygenes)控制的性状一般均表现数量 遗传的特征。 但一些由少数主基因(major gene)控制的性状 仍可能因为存在较强的环境机误而归属于数量性状
2 浙江大学 遗传学第五章 7 生物群体的变异 Î 表现型变异 ¬ 遗传变异。 数量性状的遗传变异 Î 群体内各个体间遗传组成的差异。 当基因表达不因环境变化而异:个体表现型值(phenotypic value,P)是基因型值(genotypic value,G)和随机机误 (random error,e)的总和,P=G+e。 其中:随机机误是个体生长发育 过程所处小环境中的随机效应。 浙江大学 遗传学第五章 8 常采用方差(variance)度量某个性状的变异程度。 ∴遗传群体的表现型方差(phenotypic variance,VP)Î 基因型方差(genotypic variance, VG)¬ 机误方差(error Variance,Ve)。 VP =VG + Ve。 控制数量性状的基因具有各种效应,主要包括: 加性效应(additive effect,A):基因座(locus)内 等位基因(allele)的累加效应; 显性效应(dominance effect,D):基因座内等位基因 之间的互作效应。 浙江大学 遗传学第五章 9 基因型值是各种基因效应的总和。对于加性-显性模型 G=A+D,表现型值也可相应分解为P =G+e =A+D+e 。 群体表现型方差 Î 分解为加性效应、显性效应和机误 效应三种方差分量(VP=VA+VD+Ve)。 对于某些性状,不同基因座的非等位基因之间可能存在 相互作用,即上位性效应(epitasis effect,I)。 基因型值和表现型值 Î G=A+D+I 和P=A+D+I+e, 群体表现型变异Î VP=VA+VD+VI+Ve。 浙江大学 遗传学第五章 10 设只存在基因加性效应(G=A),F2表现型值频率: 当机误效应不存在时:如性状受少数基因(如1~5对) 控制,表现典型的质量性状;但基因数目较多时(如10对) 则有类似数量性状的表现。 当存在机误效应时,表现型 呈连续变异。当受少数基因(如 1~5对)控制时,可对分离个体 进行分组;但基因数目较多(如 10对)则呈典型数量性状表现。 浙江大学 遗传学第五章 11 亦可用杨辉三角形中双数行(即第二列中的2、4、 .、8)来表示 , 如下图: 1 1 1 2 1 ⇐ n=1 1 3 3 1 1 4 6 4 1 ⇐ n=2 1 5 10 10 5 1 1 6 15 20 15 6 1 ⇐ n=3 1 7 21 35 35 21 7 1 1 8 28 56 70 56 28 8 1 ⇐ n=4 浙江大学 遗传学第五章 12 ∴多基因(polygenes)控制的性状一般均表现数量 遗传的特征。 但一些由少数主基因(major gene)控制的性状 仍可能因为存在较强的环境机误而归属于数量性状
3 浙江大学 遗传学第五章 13 生物所处的宏观环境对群体表现具有环境效应(E); 基因在不同环境中表达也可能有所不同,会存在基因型 与环境互作效应(GE)。 ∴生物体在不同环境下的表现型值可细分为: P=E+G+GE+e, 群体表现型变异也可作相应分解: VP= VE+ VG+VGE+Ve。 浙江大学 遗传学第五章 14 ①. 加性-显性遗传体系的互作效应: 加性与环境互作效应(AE) 显性与环境互作效应(DE) ∴个体表现型值:P=E+A+D+AE+DE+e; 表现型方差:VP=VE+VA+VD+VAE+VDE+Ve。 ②. 加性-显性-上位性遗传体系的互作效应: 个体表现型值:P=E+A+D+I+AE+DE+IE+e 表现型方差:VP=VE +VA +VD +VI+VAE+VDE+VIE+Ve。 GE互作效应 浙江大学 遗传学第五章 15 第二节 数量性状的特征 浙江大学 遗传学第五章 16 数量遗传学是在孟德尔经典遗传学的基础上 发展而成的一门学科,但与孟德尔遗传学有明显 的区别。 浙江大学 遗传学第五章 17 1918年费希尔(Fisher R. A. ) 发表 “根据孟德尔遗传假设对亲子间相关性的 研究”论文 Î 统计方法与遗传分析方法 结合 Î 创立数量遗传学。 1925年著《研究工作者统计方法》一书(Statistical Methods for Research Workers),为数量遗传学的研究 提供了有效的分析方法。 首次提出方差分析(ANOVA)方法, 为数量遗传学 发展奠定了基础。 浙江大学 遗传学第五章 18 1.数量性状具有以下特点: ⑴. 数量性状的变异表现为连续性: 杂交后代难以明确分组,只能用度量单位进行测量, 并采用统计学方法加以分析; P1 U P2 Ð F1 表现介于两者之间 Ð F2 连续变异
3 浙江大学 遗传学第五章 13 生物所处的宏观环境对群体表现具有环境效应(E); 基因在不同环境中表达也可能有所不同,会存在基因型 与环境互作效应(GE)。 ∴生物体在不同环境下的表现型值可细分为: P=E+G+GE+e, 群体表现型变异也可作相应分解: VP= VE+ VG+VGE+Ve。 浙江大学 遗传学第五章 14 ①. 加性-显性遗传体系的互作效应: 加性与环境互作效应(AE) 显性与环境互作效应(DE) ∴个体表现型值:P=E+A+D+AE+DE+e; 表现型方差:VP=VE+VA+VD+VAE+VDE+Ve。 ②. 加性-显性-上位性遗传体系的互作效应: 个体表现型值:P=E+A+D+I+AE+DE+IE+e 表现型方差:VP=VE +VA +VD +VI+VAE+VDE+VIE+Ve。 GE互作效应 浙江大学 遗传学第五章 15 第二节 数量性状的特征 浙江大学 遗传学第五章 16 数量遗传学是在孟德尔经典遗传学的基础上 发展而成的一门学科,但与孟德尔遗传学有明显 的区别。 浙江大学 遗传学第五章 17 1918年费希尔(Fisher R. A. ) 发表 “根据孟德尔遗传假设对亲子间相关性的 研究”论文 Î 统计方法与遗传分析方法 结合 Î 创立数量遗传学。 1925年著《研究工作者统计方法》一书(Statistical Methods for Research Workers),为数量遗传学的研究 提供了有效的分析方法。 首次提出方差分析(ANOVA)方法, 为数量遗传学 发展奠定了基础。 浙江大学 遗传学第五章 18 1.数量性状具有以下特点: ⑴. 数量性状的变异表现为连续性: 杂交后代难以明确分组,只能用度量单位进行测量, 并采用统计学方法加以分析; P1 U P2 Ð F1 表现介于两者之间 Ð F2 连续变异
4 浙江大学 遗传学第五章 19 表5-1 玉米穗长的频率、平均数、方差和标准差 世代 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 N X S V 短穗亲本 (No.60) 4 21 24 8 57 6.632 0.816 0.665 长穗亲本 (No.54) 3 11 12 15 26 15 10 7 2 101 16.802 1.887 3.560 F1 1 12 12 14 17 9 4 69 12.116 1.519 2.310 F2 1 10 19 26 47 73 68 68 39 25 15 9 1 401 12.888 2.252 5.075 浙江大学 遗传学第五章 20 ⑵. 对环境条件比较敏感: 由于环境条件的影响,亲本与F1中的数量性状也会 出现连续变异的现象。 如玉米P1、P2和F1的穗长呈连续分布,而不是只有 一个长度。但这种变异是不遗传的。 浙江大学 遗传学第五章 21 ⑶. 数量性状普遍存在着基因型与环境互作: 控制数量性状的基因较多、且容易出现在特定 的时空条件下表达,在不同环境下基因表达的程度 可能不同。 浙江大学 遗传学第五章 22 质量性状和数量性状的区别 质量性状 数量性状 ①.变异类型 种类上的变化 (如红、白花) 数量上的变化 (如高度) ②.表现型分布 不连续 连续 ③.基因数目 一个或少数几个 微效多基因 ④.对环境的敏感性 不敏感 敏感 ⑤.研究方法 系谱和概率分析 统计分析 浙江大学 遗传学第五章 23 2. 数量性状遗传的多基因假说: 瑞典遗传学家Nilsson-Ehle(尼尔逊x埃尔)于 1909年研究小麦籽粒颜色的遗传后提出多基因假说, 经后人试验论证而得到公认。 浙江大学 遗传学第五章 24 多基因假说要点: 1.决定数量性状的基因数目很多; 2.各基因的效应相等; 3.各个等位基因的表现为不完全显性或无显性或有 增效和减效作用; 4.各基因的作用是累加性的。 发展:数量性状的深入研究进一步丰富了 多基因假说。如主效基因与微效基因、基因效应 大小可以不同、基因间存在上位性效应等
4 浙江大学 遗传学第五章 19 表5-1 玉米穗长的频率、平均数、方差和标准差 世代 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 N X S V 短穗亲本 (No.60) 4 21 24 8 57 6.632 0.816 0.665 长穗亲本 (No.54) 3 11 12 15 26 15 10 7 2 101 16.802 1.887 3.560 F1 1 12 12 14 17 9 4 69 12.116 1.519 2.310 F2 1 10 19 26 47 73 68 68 39 25 15 9 1 401 12.888 2.252 5.075 浙江大学 遗传学第五章 20 ⑵. 对环境条件比较敏感: 由于环境条件的影响,亲本与F1中的数量性状也会 出现连续变异的现象。 如玉米P1、P2和F1的穗长呈连续分布,而不是只有 一个长度。但这种变异是不遗传的。 浙江大学 遗传学第五章 21 ⑶. 数量性状普遍存在着基因型与环境互作: 控制数量性状的基因较多、且容易出现在特定 的时空条件下表达,在不同环境下基因表达的程度 可能不同。 浙江大学 遗传学第五章 22 质量性状和数量性状的区别 质量性状 数量性状 ①.变异类型 种类上的变化 (如红、白花) 数量上的变化 (如高度) ②.表现型分布 不连续 连续 ③.基因数目 一个或少数几个 微效多基因 ④.对环境的敏感性 不敏感 敏感 ⑤.研究方法 系谱和概率分析 统计分析 浙江大学 遗传学第五章 23 2. 数量性状遗传的多基因假说: 瑞典遗传学家Nilsson-Ehle(尼尔逊x埃尔)于 1909年研究小麦籽粒颜色的遗传后提出多基因假说, 经后人试验论证而得到公认。 浙江大学 遗传学第五章 24 多基因假说要点: 1.决定数量性状的基因数目很多; 2.各基因的效应相等; 3.各个等位基因的表现为不完全显性或无显性或有 增效和减效作用; 4.各基因的作用是累加性的。 发展:数量性状的深入研究进一步丰富了 多基因假说。如主效基因与微效基因、基因效应 大小可以不同、基因间存在上位性效应等
5 浙江大学 遗传学第五章 25 3.研究方法: 杂交后代中得不到明确比例 Î 需要对大量个体进行 分析研究 Î 应用数理统计方法 Î 分析平均效应、方差、 协方差等遗传参数 Î 发现数量性状遗传规律。 借助于分子标记和数量性状基因位点(quantitative trait loci, QTL)作图技术 Î 可在分子标记连锁图上标出 单个基因位点的位置、确定其基因效应。 浙江大学 遗传学第五章 26 ∴数量性状可由少数效应较大的主基因控制、也可由数目 较多、效应较小的微效多基因控制。 主基因:控制某个性状表现的效应较大的少数基因; 微效基因:数目较多,但每个基因对表现型的影响较小; 修饰基因:基因作用微小,但能增强或削弱主基因对基因型 的作用。 如小家鼠有一种引起白斑的显性基因,白斑的大小则由 一组修饰基因所控制。 浙江大学 遗传学第五章 27 超亲遗传:在植物杂交时,杂种后代出现的一种超越双亲现象。 如水稻的两个品种: P 早熟(A2A2B2B2C1C1)× 晚熟(A1A1B1B1C2C2) F1 (A1A2B1B2C1C2)熟期介于双亲之间 ⊗ F2 27种基因型 (其中A1A1B1B1C1C1的个体将比晚熟亲本更晚, 而A2A2B2B2C2C2的个体将比早熟亲本更早) 浙江大学 遗传学第五章 28 第三节 数量性状遗传研究 的基本统计方法 浙江大学 遗传学第五章 29 数量遗传学Î研究数量性状在群体内的遗传传递 规律 Î 将总表现型变异分解为遗传和非遗传部分 Î 提供相关信息。 ∴在研究数量性状的遗传变异规律时,需采用数理 统计的方法。 浙江大学 遗传学第五章 30 表示一组资料的集中性,是某一性状全部观察数 (表现型值)的平均。 1 1 2 1 1 1 1 ˆ ( . . ) n i n n k n n i ii i i xx x x x fx µ = = = + ++++ = = ∑ ∑ µˆ 表示平均数、 x 表示资料中各个观察数、n 为观察 的总个数、k 为组数、f 为频率, ∑ = n i 1 表示从1至n的累加。 统计参数(Parameter): 1.平均数(mean, ): µˆ
5 浙江大学 遗传学第五章 25 3.研究方法: 杂交后代中得不到明确比例 Î 需要对大量个体进行 分析研究 Î 应用数理统计方法 Î 分析平均效应、方差、 协方差等遗传参数 Î 发现数量性状遗传规律。 借助于分子标记和数量性状基因位点(quantitative trait loci, QTL)作图技术 Î 可在分子标记连锁图上标出 单个基因位点的位置、确定其基因效应。 浙江大学 遗传学第五章 26 ∴数量性状可由少数效应较大的主基因控制、也可由数目 较多、效应较小的微效多基因控制。 主基因:控制某个性状表现的效应较大的少数基因; 微效基因:数目较多,但每个基因对表现型的影响较小; 修饰基因:基因作用微小,但能增强或削弱主基因对基因型 的作用。 如小家鼠有一种引起白斑的显性基因,白斑的大小则由 一组修饰基因所控制。 浙江大学 遗传学第五章 27 超亲遗传:在植物杂交时,杂种后代出现的一种超越双亲现象。 如水稻的两个品种: P 早熟(A2A2B2B2C1C1)× 晚熟(A1A1B1B1C2C2) F1 (A1A2B1B2C1C2)熟期介于双亲之间 ⊗ F2 27种基因型 (其中A1A1B1B1C1C1的个体将比晚熟亲本更晚, 而A2A2B2B2C2C2的个体将比早熟亲本更早) 浙江大学 遗传学第五章 28 第三节 数量性状遗传研究 的基本统计方法 浙江大学 遗传学第五章 29 数量遗传学Î研究数量性状在群体内的遗传传递 规律 Î 将总表现型变异分解为遗传和非遗传部分 Î 提供相关信息。 ∴在研究数量性状的遗传变异规律时,需采用数理 统计的方法。 浙江大学 遗传学第五章 30 表示一组资料的集中性,是某一性状全部观察数 (表现型值)的平均。 1 1 2 1 1 1 1 ˆ ( . . ) n i n n k n n i ii i i xx x x x fx µ = = = + ++++ = = ∑ ∑ µˆ 表示平均数、 x 表示资料中各个观察数、n 为观察 的总个数、k 为组数、f 为频率, ∑ = n i 1 表示从1至n的累加。 统计参数(Parameter): 1.平均数(mean, ): µˆ