生物信息学课程二级结构组合成一些频繁出现的超二级结构BioinformaticsHelix-turn-helixmotifofproteinAminoacidsequenceformsaturnα-helixQT009GARLANDPUBLISHINGINCAmemterolTbe Taglee &Francis Greoy5
生物信息学 课程 Bioinformatics 二级结构组合成一些频繁出现的超二级结构 5
生物信息学课程超二级结构进一步组装成三级结构域Bioinformaticsna.蛋白质结构域可分为四种主要类型:α、β、α/B和α+β结构域α结构域的核心区主要由α螺旋构成。IEC5ILK2BB结构域的核心区主要由β片层构成。1dα/β和α+β结构域的核心区既含有α螺旋也含有B片层,其中α/B型主要含有平行β片层,α+β型主要含有反平行β片层。1TMLIIDPA6
生物信息学 课程 Bioinformatics 超二级结构进一步组装成三级结构域 ✓ 蛋白质结构域可分为四种主要类 型:、、α/β和α+β结构域。 ✓ 结构域的核心区主要由α螺旋构 成。 ✓ 结构域的核心区主要由β片层构 成。 ✓ α/β和α+β结构域的核心区既含有 α螺旋也含有β片层,其中α/β型 主要含有平行β片层,α+β型主要 含有反平行β片层。 6
生物信息学课程蛋白通过其三维结构行使生物学功能Bioinformatics2福啡
生物信息学 课程 Bioinformatics 蛋白通过其三维结构行使生物学功能 7
生物信息学课程蛋白质空间结构可以被实验测定Bioinformatics>蛋白质结构实验测定方法X-射线衍射法核磁共振技术(NMR)低温冷冻电镜》实验获得的蛋白质序列数目与结构数目的差距很大序列远超过2亿结构仅超过22万,而且包含很多结构被重复测定的蛋白8
8 生物信息学 课程 Bioinformatics 蛋白质空间结构可以被实验测定 ➢ 蛋白质结构实验测定方法 • X-射线衍射法 • 核磁共振技术(NMR) • 低温冷冻电镜 ➢ 实验获得的蛋白质序列数目与结构数目的差距很大 • 序列远超过2亿 • 结构仅超过22万,而且包含很多结构被重复测定的蛋白
生物信息学课程蛋白质结构数据库(PDB)介绍BioinformaticsPDBwww.rcsb.orgPROTEIN DATA BANK3DMacromolecularstructuraldata>Totalnoofexperimentalstructures222,036(2024/7/4)>Offersaccessto~1millionComputedStructureModels(CsMs)fromAlphaFoldDBandRoseTTAFold9
生物信息学 课程 Bioinformatics 蛋白质结构数据库(PDB)介绍 ➢ www.rcsb.org ➢ 3D Macromolecular structural data ➢ Total no of experimental structures 222,036 (2024/7/4) ➢ Offers access to ~1 million Computed Structure Models (CSMs) from AlphaFoldDB andRoseTTAFold RCSB PDB Protein DataBank |Home 9