第二节：生物信息学的研究领域 000 、研究领域 Experiment Computation Information Technology Hardware instrumentation Mathematical Physical Models DNA Sequence 基因组测序 Gene genome organization 基因组数据分析 Genome sequencmng 统计遗传学 Molecular evolution Genomic data analysis 转录组学 Statistical Protein structure,folding, 蛋白质组学 Transcriptomics genetics function interaction Proteomics 功能基因/蛋白组学 蛋白质结构预测、互作、设计 Metabolic pathways (生物芯片等) regulation Functional genomics Protein structure prediction,protein dynamics,protein folding and design Signaling 代谢组学 (microarrays,2D-PAGE etc.) metabolomics Networks Physiology cell biology 数据格式、标准化及分析复杂生物数据工具 动态系统建模 表型组学 Data standards,data representations,and Dynamical Interspecies interaction Phenomics analytical tools for complex biological data system modelling Ecology environment 高科技野外生态学 High-tech field 计算生态学 ecology Computational ecology 文本挖掘 Text mining 陈铭：整合生物信息学(2006) 17
研究领域 第二节：生物信息学的研究领域 陈铭：整合生物信息学（2006） 17 Experiment Information Technology Computation Hardware & instrumentation Mathematical & Physical Models DNA Sequence Gene & genome organization Molecular evolution Protein structure, folding, function & interaction Metabolic pathways regulation Signaling Networks Physiology & cell biology Interspecies interaction Ecology & environment 基因组测序 Genome sequencing 基因组数据分析 Genomic data analysis 统计遗传学 Statistical genetics 蛋白质结构预测、互作、设计 Protein structure prediction, protein dynamics, protein folding and design 蛋白质组学 Proteomics 功能基因/蛋白组学 （生物芯片等） Functional genomics (microarrays, 2D-PAGE, etc.) 高科技野外生态学 High-tech field ecology 数据格式、标准化及分析复杂生物数据工具 Data standards, data representations, and analytical tools for complex biological data 动态系统建模 Dynamical system modelling 计算生态学 Computational ecology 代谢组学 metabolomics 转录组学 Transcriptomics 文本挖掘 Text mining 表型组学 Phenomics
第二节：生物信息学的研究领域 00以 研究内容 Ideogran.☒ Contig凶 HsUniG+凶 里T_86925, Genes-.seq凶Symbol ▣Database数据库建设 e22.33- NT078115 NT028413, ：8 Xe22.32 NT086929, ASB11 10H3 T086931 口Data Mining&Integration数据库整合和 Xe22.31 T086933 Hs.75968 PHKA2 XP22.2 NT025302. Hs.406078 数据挖掘 e22.13 NT-011757. MAGEB1 Hs.28491 郑经： Xe21.3 30H FTHL17 ▣Sequence Analysis序列分析 3F21.2 XP21,1 PHF8 中 Hs.380774 Xp11.4 Structural Analysis Functional Prediction NT_079573. Hs,40695 Hs.171501 e11.3 Hs.445641 L0C169981+ e11.23 s.301404 结构分析与功能预测 501 Hs.77422 Xe11.22 Hs.5258 NLGN3 NT011630. Hs.407756 *1121 Hs.376719 60H3 SLC16A2 ▣ Large Scale Expressional Profile Analysis X11.2 Hs.170328 X912 ZNF6 大规模功能表达谱的分析 NT-011669. Hs.355861 8313.1 70M Hs.445628 X313.2 Hs.83623 %q13.3 Hs.78771 CAPZA1P 80子 Modeling and Simulation of BioPathways X921,1 NXF2 8321.2 代谢网络建模分析 Xq21.31 X21.32 ZBTB33 X921.33 NT-911651, ■Reconstruction预测调控网络 Xa22.1 100H3 .454495 MCTS1 X922.2 1s,4113 %922.3 Hs.1787 ELF4 ■Network Analysis网络普遍性分析 8923 110州 X324 NT028405. L0C340581+ ■Modeling模型分析 Hs,79172 120m Hs.300141 ×425 Hs.232432 LOC266694+ ×26.1 口Program Development程序开发 NT-011786 X926.2 SPANXC X926.3 MTMR1 ▣Commercialization商业化 X427.3 s.821 NT-011681. H.381232 CETN2 Hs.400220 X428 150州月 NT-011726. T_●25965. Hs.182018 NT_025307. Hs.401929 ATP2B3 Hs.,195464 陈铭，后基因组时代的生物信息学，《生物信息学》，2004 18
研究内容 第二节：生物信息学的研究领域 陈铭，后基因组时代的生物信息学，《生物信息学》，2004 18 Database数据库建设 Data Mining & Integration数据库整合和 数据挖掘 Sequence Analysis序列分析 Structural Analysis & Functional Prediction 结构分析与功能预测 Large Scale Expressional Profile Analysis 大规模功能表达谱的分析 Modeling and Simulation of BioPathways 代谢网络建模分析 ◼ Reconstruction预测调控网络 ◼ Network Analysis网络普遍性分析 ◼ Modeling模型分析 Program Development程序开发 Commercialization商业化