第一节:生物信息学的发展历史 00X 生物信息学大事记(六) 计算机科学 年份 生命科学 2012 体细胞重编程技术; “垃圾”DNA得到正名 我国“天河二号”超越美图“Titan号”,再次 2013 CRISPR基因编辑技术将成为基因编辑的常用 成为全球运算速度最快的超级计算机 工具 2014 癌症的CAR-T疗法和HIV的T细胞疗法 2015 Roadmap Epigenomics Program发布表观基因 组图谱 基于强化学习的AlphaGO程序击败围棋世界冠 2016 中国国家基因库CNGB正式运营 军:采用国产核心处理器的“神威·太湖之光” 超过“天河二号”成为世界上运算速度最快的 超级计算机,理论最佳性能约提升一倍。 eChes Group of Bioinformatics 12
生物信息学大事记(六) 第一节:生物信息学的发展历史 12 计算机科学 年份 生命科学 2012 体细胞重编程技术; “垃圾”DNA得到正名 我国“天河二号”超越美图“Titan号”,再次 成为全球运算速度最快的超级计算机 2013 CRISPR基因编辑技术将成为基因编辑的常用 工具 2014 癌症的CAR-T疗法和HIV的T细胞疗法 2015 Roadmap Epigenomics Program发布表观基因 组图谱 基于强化学习的AlphaGO程序击败围棋世界冠 军;采用国产核心处理器的“神威·太湖之光” 超过“天河二号”成为世界上运算速度最快的 超级计算机,理论最佳性能约提升一倍。 2016 中国国家基因库CNGB正式运营
第一节:生物信息学的发展历史 0似生物信息学大事记(七) 计算机科学 年份 生命科学 光量子计算机诞生 2017 人类细胞图谱计划启动: 首次合成包含两种人工碱基的生命体 我国新一代“E级超算”“天河三号”原 2018 单细胞水平细胞谱系追踪技术;世界首例单条染色 型机首次亮相 体真核细胞出现;历经13年小麦基因组图谱绘制完 成 基因编辑婴儿 新型类脑计算芯片一“天机芯”芯片的 2019 Prime编辑技术(先导编辑);DNA显微镜研制成功; 研发成功:中国正式进入5G商用元年 新型人造DNA结构信息密度可加倍 基于深度学习的AlphaFold解决蛋白质折叠 2020 首张人类细胞图谱公布;CRISPR基因编辑技术首次 难题 用于临床治疗:mRNA疫苗首次投入使用 eChe's Group of Bioinformatics 13
生物信息学大事记(七) 第一节:生物信息学的发展历史 13 计算机科学 年份 生命科学 光量子计算机诞生 2017 人类细胞图谱计划启动; 首次合成包含两种人工碱基的生命体 我国新一代“E级超算”“天河三号”原 型机首次亮相 2018 单细胞水平细胞谱系追踪技术;世界首例单条染色 体真核细胞出现;历经13年小麦基因组图谱绘制完 成 基因编辑婴儿 新型类脑计算芯片——“天机芯”芯片的 研发成功;中国正式进入5G商用元年 2019 Prime编辑技术(先导编辑);DNA显微镜研制成功; 新型人造DNA结构信息密度可加倍 基于深度学习的AlphaFold解决蛋白质折叠 难题 2020 首张人类细胞图谱公布;CRISPR基因编辑技术首次 用于临床治疗;mRNA疫苗首次投入使用
第一节:生物信息学的发展历史 阶似一些重要历史:生物信息学→整合生物信息学 罗辽复提出密 码-序列-构象 中国牛胰岛素 动力学”路线 Daghoff:蛋白序列 microRNA Perl Proteome 电子管计算机 FASTA GCB会议 DNA的X衍射 NCBI成立 ISMB会议 Crispr scRNA-seq AlphaFold 1943195319651975/61987/81990/11993/41996720022005/62009201420192022 DNA双螺旋 Sanger测序 HGP Affymetrix NGS NGDC circRNA BLAST 香山会议 RNA-seq 微软公司 Linux 深度学习 苹果公司 Python Integrative 实验科学严重依赖于新技术的不断开发与应用 Bioinformatics 新事物的出现到“流行”研究一般需要1o年时间 Tins Chek's Grot
scRNA-seq microRNA Proteome GCB会议 ISMB会议 Sanger测序 circRNA 微软公司 苹果公司 电子管计算机 DNA的X衍射 DNA双螺旋 中国牛胰岛素 Daghoff蛋白序列 Perl FASTA NCBI成立 HGP BLAST Linux Python Affymetrix 香山会议 Crispr NGS NGDC RNA-seq 深度学习 AlphaFold • 实验科学严重依赖于新技术的不断开发与应用 • 新事物的出现到“流行”研究一般需要10年时间 罗辽复提出“密 码-序列-构象 -动力学”路线 一些重要历史:生物信息学→整合生物信息学 第一节:生物信息学的发展历史
第一节:生物信息学的发展历史 00 、现状 ▣美国 ▣ International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) ▣欧盟 ▣ European Conference on Computational 口德国 Biology (ECCB) ▣ International Conference on Research in 口英国 Computational Molecular Biology (RECOMB) ▣其他 ▣ Workshop on Algorithms in Bioinformatics ▣日本 (WABI) ▣ Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 口中国 ▣ International Conference on Systems ▣俄罗斯等 Biology (ICSB) ▣ Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB) ▣ 全国生物信息学与系统生物学学术大会 Ches Group of Bioinformatic 15
现状 第一节:生物信息学的发展历史 15 美国 欧盟 德国 英国 其他 日本 中国 俄罗斯等 International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) European Conference on Computational Biology (ECCB) International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI) Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) International Conference on Systems Biology (ICSB) Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB) … 全国生物信息学与系统生物学学术大会
第二节:生物信息学的研究领域 00 研究领域 ▣Molecular&Cellular Biology.分子 Human 与细胞生物学 Genome ▣BioPhysics.生物物理学 Project ▣Brain&NeuroScil脑和神经科学 ▣Medicine&Pharmaceutics医药学 3 billion basepairs ▣Agriculture农林牧渔学 Molecular&Ecological Evolution 分子和生态进化 202422 陈铭,后基因组时代的生物信息学,《生物信息学》,2004 16
研究领域 第二节:生物信息学的研究领域 16 Molecular & Cellular Biology分子 与细胞生物学 BioPhysics生物物理学 Brain&NeuroSci脑和神经科学 Medicine&Pharmaceutics医药学 Agriculture农林牧渔学 Molecular&Ecological Evolution 分子和生态进化 … 陈铭,后基因组时代的生物信息学,《生物信息学》,2004