1、基因突变的诊断 (1)点突变的诊断 ①诊断已知的点突变:对于突变位点已被阐明的一些 遗传病,可以采用PCR/ASO(allele specific oligonucleotide,.ASO,等位基因特异性寡核苷酸)探 针法进行检测。在扩增DNA片段后直接与相应寡核苷酸探 针杂交,即可明确诊断是否有突变以及突变是纯合子还是 杂合子
①诊断已知的点突变:对于突变位点已被阐明的一些 遗传病 , 可 以 采 用 PCR / ASO(allele specific oligonucleotide,ASO,等位基因特异性寡核苷酸)探 针法进行检测。在扩增DNA片段后直接与相应寡核苷酸探 针杂交,即可明确诊断是否有突变以及突变是纯合子还是 杂合子。 1、基因突变的诊断 (1)点突变的诊断
例如,已知某位点正常碱基为C,突变为T(即C→T): 引物1 C→T 3 突变位点 引物2 在该位点两端设计引物1、2进行PCR扩增,得到产 物后进行斑点杂交或狭缝杂交。 针对该突变分别合成一对寡核苷酸片段作为探针; 其中一个为正常探针,与正常序列互补(中央碱基为G); 另一个是突变探针,与突变序列互补(中央碱基为A)
在该位点两端设计引物1、2进行PCR扩增,得到产 物后进行斑点杂交或狭缝杂交。 针对该突变分别合成一对寡核苷酸片段作为探针; 其中一个为正常探针,与正常序列互补(中央碱基为G); 另一个是突变探针,与突变序列互补(中央碱基为A)。 3′ 突变位点 5′ 引物2 引物1 例如,已知某位点正常碱基为C,突变为T(即C→T): C→T
突变碱基及对应的正常碱基均位于寡核苷酸片段的中央, 因为只有在这个位置时,该碱基与被探测的DNA上相应碱基 或匹配或错配,对二者结合力影响最大。严格控制杂交 及洗脱条件,使只有与靶序列完全互补的探针才能结合在 等位基因片段上,而中央碱基与靶序列不匹配的探针则不 能结合在等位基因片段上
突变碱基及对应的正常碱基均位于寡核苷酸片段的中央, 因为只有在这个位置时,该碱基与被探测的DNA上相应碱基 或匹配或错配,对二者结合力影响最大。严格控制杂交 及洗脱条件,使只有与靶序列完全互补的探针才能结合在 等位基因片段上,而中央碱基与靶序列不匹配的探针则不 能结合在等位基因片段上
结果分析:a.如果从受检者DNA扩增的PCR产物与正常 探针杂交,而不和突变探针杂交,表示受检者不存在这种 突变基因;b.如果只有突变探针可以杂交,则说明突变基 因是纯合子;c.若正常探针与突变探针都可杂交,说明突 变基因是杂合子(2倍体,等位基因);d.如果患者的 DNA与正常探针以及所有已知突变基因的寡核苷酸探针均不 能杂交,则提示患者的缺陷基因不属于先前己发现的突变 类型,而很可能是一种新的突变类型
结果分析:a. 如果从受检者DNA扩增的PCR产物与正常 探针杂交,而不和突变探针杂交,表示受检者不存在这种 突变基因;b. 如果只有突变探针可以杂交,则说明突变基 因是纯合子;c. 若正常探针与突变探针都可杂交,说明突 变基因是杂合子(2倍体,等位基因);d. 如果患者的 DNA与正常探针以及所有已知突变基因的寡核苷酸探针均不 能杂交,则提示患者的缺陷基因不属于先前已发现的突变 类型,而很可能是一种新的突变类型
进而利用DNA芯片技术,除了上述两个探针外,再 设计两个探针,其中央碱基分别为C和T。这4个探针可原 位合成或预合成后显微打印在支持物上。杂交分析同上。 如果扩增产物与中央碱基为C或T的探针杂交,则可清楚地 表明该缺陷基因的新的突变类型为C→G或C→A。 A G 芯片设计 正常 CT CT C→G C→A 探针定位 (纯合子)(杂合子) 新突变 新突变 点突变检测荧光亮点模式
进而利用DNA芯片技术,除了上述两个探针外,再 设计两个探针,其中央碱基分别为C和T。这4个探针可原 位合成或预合成后显微打印在支持物上。杂交分析同上。 如果扩增产物与中央碱基为C或T的探针杂交,则可清楚地 表明该缺陷基因的新的突变类型为C→G或C→A。 A T C G 芯片设计 探针定位 (纯合子)(杂合子) 新突变 新突变 正常 C →T C →T C →G C →A 点突变检测荧光亮点模式