第二节：非编码RNA的分类一nicroRNA 000 miRNA RNA基因 mRNA基因 →RNA紫合的知 b. NA案合格I山 转录 转 (1)内源性21-25nt小RNA 面iNA初始转柔物 mRNA初始转录 se蛋白 Drosha蛋白 m70 AAAAAA (2)前体具有发夹结构 AAAAAA D工蛋白 DGCRR蛋白 切级加工 初级加工 果单中Pdha蛋白 i配NA前体 DCL1蛋白 (3)通过与Ago蛋白结合，特异 RNA能体 L1重白 性调控基因的表达。 Exportin 5-RanGTP 二次加工 玉白 细病棱 HENT蛋白 (4)动物(a) 和植物(b) 细斯 miRNA的生物合成路径 甲基化 AG014折自 Dr蛋白 果1中(：01蛋自 HASY蛋白 (5)植物中，miRNA与靶基因 果到中Dcr1蛋间 TRB即or PACT黄自 果韩中0C5蛋百 互补性高，指导AGO蛋白切割靶 细胞核 基因mRNA;动物中互补性低， miRNA miRNA·二案体 细狐质 AGO1-4蛋白 主要引起靶基因mRNA翻译抑制。 Dicr蛋自 果解中AGO1蛋白 miRNA:miRNA·二素体 果绳中Deer1置自 ·TRBP or PACT蛋自 解旋降 解能酶了 果中L0g蛋百 AGO蛋自 (6)一个miRNA可以调控多个 靶基因，一个基因也可以被多个 -AG01-4蛋白 AGO蛋自 miRNA- 果绳中1.00S蛋白 mtNA一 miRNA调控。 复合物中成熟的mNA 复合物中成箱的mNA
miRNA 第二节：非编码RNA的分类—microRNA 7 （1）内源性21-25 nt 小RNA （2）前体具有发夹结构 （3）通过与Ago蛋白结合，特异 性调控基因的表达。 （4）动物（a）和植物（b） miRNA的生物合成路径 （5）植物中， miRNA与靶基因 互补性高，指导AGO蛋白切割靶 基因mRNA；动物中互补性低， 主要引起靶基因mRNA翻译抑制。 （6）一个miRNA可以调控多个 靶基因，一个基因也可以被多个 miRNA调控
第二节：非编码RNA的分类 microRNA 000 mRNA的生物信息学分析方法 mOm miRBase miRBase MANCHESER Home Search Browse Help Download illog Submit Latest miRBase blog posts miRNA count:28645 entries High confidence miRNA set available for miRBase 21 B/s20uy3.2014 Release 21:June 2014 As mentioned prevously,we brlefly held off from releasing the set of"high confidence"miRNAs for miRBase 21,because of a last-gasp bug.Those data are now avallable,tapoed with the label "high confidence"on the entry pages,and for download on the FTP site.The total number of miRNAs labelled "high confidence"has increased [... Search by miRNA name or keyword miRBase 21 finally arrives By sam Oune 26.2014) Go Example Apologies for the longer-than-usual wat.miRBase 21 is now avallable on the website,and all data available for download on he FTP site.As usual,the release notes describe the major changes.of particular note this time,the Genome Reference Download published miRNA data Consortlum have released a new human genome assembly,GRCh38.We have therefore remapped the human [.. Download page I ETP site miRBase:the microRNA database Tweets by mirbase miRBase provides the following services: The miRBase database is a searchable database of published miRNA sequences and annotation.Each entry in the miRBase Sequence database represents a predicted hairpin portion of a miRNA transcript(termed mir in the database),with information on the location and sequence of the mature miRNA sequence(termed miR).Both hairpin and mature sequences are available for searching and browsing,and entries can also be retrieved by name,keyword,references and annotation.All sequence and annotation data are also available for download. The miRBase Registry provides miRNA gene hunters with unique names for novel miRNA genes prior to publication of results.Visit the help (1)获取miRNA的序列信息： miRNA权威数据库：miRBase(http:lwww.mirbase.org) 21.0版，涵盖223物种，包含28645条miRNA发夹前体，35828 条成熟miRNA。 8
miRNA的生物信息学分析方法 第二节：非编码RNA的分类—microRNA 8 （1）获取miRNA 的序列信息： miRNA 权威数据库：miRBase (http://www.mirbase.org/） 21.0版，涵盖223物种，包含28645条miRNA发夹前体，35828 条成熟miRNA
第二节：非编码RNA的分类一nicroRNA 00八 miRNA的生物信息学分析方法 (2)miRNA新基因的预测和鉴定 前体具有典型的发夹结构 能找到miRNA/miRNA*二聚中间体 在AGO蛋白中富集 Dicer或DCL1酶加工依赖性 9
miRNA的生物信息学分析方法 第二节：非编码RNA的分类—microRNA 9 (2) miRNA 新基因的预测和鉴定 前体具有典型的发夹结构 能找到miRNA/miRNA*二聚中间体 在AGO蛋白中富集 Dicer 或DCL1酶加工依赖性
第二节：非编码RNA的分类一microRNA 000 、miRNA的生物信息学分析方法 (3)miRNA靶基因的预测和鉴定 种子序列的互补性 序列保守性 热动力学因素 位点的可结合性 UTR碱基分布 miRNA.与靶基因组织分布的相关性 10
miRNA的生物信息学分析方法 第二节：非编码RNA的分类—microRNA 10 (3) miRNA 靶基因的预测和鉴定 种子序列的互补性 序列保守性 热动力学因素 位点的可结合性 UTR碱基分布 miRNA与靶基因组织分布的相关性