4、质量评估凝胶电泳12光密度值测定3)限制酶切分析细胞裂解二、1.酶法:利用某些细胞壁裂解酶使细胞变为原生质体,然后加去垢剂使原生质体裂解。1)细菌:溶菌酶2)酵母:蜗牛酶、Novozyme234、glusulase、zymolase等3)丝状真菌:Novozyme234、溶壁酶、纤维素酶4)植物细胞:纤维素酶、半纤维素酶、果胶酶酶法裂解时要注意细胞的生长条件和生长时间,反应时尽可能满足酶的最佳反应条件
4、质量评估 1) 凝胶电泳 2)光密度值测定 3)限制酶切分析 二、细胞裂解 1. 酶法: 利用某些细胞壁裂解酶使细胞变为原生质体,然后加去垢剂 使原生质体裂解。 1) 细菌:溶菌酶 2) 酵母:蜗牛酶、Novozyme234、glusulase、zymolase 等 3) 丝状真菌:Novozyme234、溶壁酶、纤维素酶 4) 植物细胞:纤维素酶、半纤维素酶、果胶酶 酶法裂解时要注意细胞的生长条件和生长时间,反应时尽可能满 足酶的最佳反应条件
2.机械法(芽孢细菌1)压力剪切法:French压力机,酵母细胞,和G+球菌除外)搅切器(blender),混合2)射击破碎法:Braun破碎机,器(mixer),0.1-0.45mm玻璃球3)固体研磨法:将待破碎细胞与玻璃球(0.1~0.45mm同时致冷,在未融熔前用研杆磨成粉未4)反复冻融法三、DNA的分离与纯化1、供体DNA的分离与纯化要求:尽可能地保持其高分子量,无其它污染物。基因组大小:1
2. 机械法 1) 压力剪切法:French压力机,酵母细胞,细菌(芽孢 和G+球菌除外) 2)射击破碎法:Braun破碎机,搅切器(blender),混合 器(mixer),0.1-0.45mm玻璃球 3)固体研磨法:将待破碎细胞与玻璃球(0.1~0.45mm) 同时致冷,在未融熔前用研杵磨成粉末 4)反复冻融法 三、DNA的分离与纯化 1、供体DNA的分离与纯化 要求:尽可能地保持其高分子量,无其它污染物。 1) 基因组大小:
染色体线粒体细菌线状藻类3300~4200kb15kb酵母酵母环状15.000kb19~78kb果蝇植物环状1.28x105kb100~150kb人3x106kb动物(扁虫到人)环状15~18kb植物锥虫网状2x105~1x108kb6000kb(幼体)天花病毒288kb网状短膜虫30.000kb(幼体)痘病毒196 kb(Kinetoplast)质体几~100以上kb叶绿体双子叶植物121(菠菜)-~154kb(豌豆)单子叶植物151(玉米)182kb(浮萍)藻类132(裸藻)~191kb(衣藻)
染色体 细菌 3300~4200kb 酵母 15,000 kb 果蝇 1.28x105 kb 人 3x106 kb 植物 2x105~1x108 kb 天花病毒 288 kb 痘病毒 196 kb 质体 几~100以上kb 线粒体 藻类 线状 15kb 酵母 环状 19~78 kb 植物 环状 100~150 kb 动物(扁虫到人)环状 15~18 kb 锥虫 网状 6000 kb(幼体) 短膜虫 网状 30,000 kb(幼体) (Kinetoplast) 叶绿体 双子叶植物 121(菠菜)~154kb(豌豆) 单子叶植物 151(玉米)~182kb(浮萍) 藻类 132(裸藻)~191kb(衣藻)
DNA分离纯化过程破碎细胞+DNA抽提液(EDTA、去污剂、还原剂)一65℃温育冰浴冷却一离心去细胞碎片20'苯酚抽提法①CsCI密度梯度离心21)苯酚抽提法上清液缓冲液用水饱和苯酚抽提2~3次一上层液相用氯仿抽至界面无蛋白变性物→上层液相用两倍体积冷乙醇沉淀沉淀物用70%冷乙醇洗涤,干燥溶于缓冲液一加入RNAase处理除去RNA一苯酚氯仿抽提沉淀干燥
1) DNA分离纯化过程 破碎细胞 + DNA抽提液(EDTA、去污剂、还原剂) 65℃温育 20’ 冰浴冷却 离心去细胞碎片 苯酚抽提法① CsCl密度梯度离心② 1) 苯酚抽提法 上清液 缓冲液用水饱和苯酚抽提2~3次 上层液相用氯仿抽 至界面无蛋白变性物 上层液相用两倍体积冷乙醇沉淀 沉 淀物用70%冷乙醇洗涤,干燥 溶于缓冲液 加入RNAase处理 除去RNA 苯酚氯仿抽提 沉淀干燥
2)CsCI密度梯度离心上清液一加入固体CsCI与EtBr溶液一室温下超速离心一(45,000rpm)16小时一穿孔取出DNA(320nm)一异丙醇抽提溴乙锭一一缓冲液透析除去残余CsCI两倍体积冷乙醇沉淀DNA一一→离心、洗涤、干燥*两种方法比较:CsCI法操作步骤少,分离DNA分子量大,耗财多,且需超速离心机。苯酚法耗时少,不需昂贵仪器,但操作步骤多,易使DNA分子断裂。若小心操作,所获DNA亦符合要求。**上述两种分离方法都包含了下述四个分离步骤i.可溶与不可溶物分离:高速离心除去细胞碎片,保留上清液i.使蛋白质分离:苯酚抽提或超速离心i.使RNA分离:RNase处理或超速离心iv.使DNA与其它可溶物分离
2) CsCl密度梯度离心 上清液 加入固体CsCl与EtBr溶液 室温下超速离心 (45,000rpm)16小时 穿孔取出DNA(320nm) 异丙醇抽提 溴乙锭 缓冲液透析除去残余CsCl 两倍体积冷乙醇沉淀 DNA 离心、洗涤、干燥 *两种方法比较: CsCl法操作步骤少,分离DNA分子量大,耗财多,且需超速 离心机。 苯酚法耗时少,不需昂贵仪器,但操作步骤多,易使DNA分 子断裂。 若 小心操作,所获DNA亦符合要求。 ** 上述两种分离方法都包含了下述四个分离步骤 ⅰ.可溶与不可溶物分离:高速离心除去细胞碎片,保留上清液。 ⅱ. 使蛋白质分离:苯酚抽提或超速离心 ⅲ. 使RNA分离:RNase处理或超速离心 ⅳ. 使DNA与其它可溶物分离