第九讲基因组与比较基因组学 研究
第九讲 基因组与比较基因组学 研究
一、人工染色体构建 二、新的测序策略-全基因组鸟枪法测序 n三、全基因组序列分析-基因组学的新内容 四、比较基因组学( Comparative genomics)
▪ 一、人工染色体构建 ▪ 二、新的测序策略--全基因组鸟枪法测序 ▪ 三、全基因组序列分析--基因组学的新内容 ▪ 四、比较基因组学(Comparative genomics)
人工染色体构建 1983年,美国的Dana- Farber癌症研究所和 哈佛大学医学院的教授首次在 Nature上发表文章, 报道了构建YAC( Yeast artificial chromosome) 库的过程。1987年, Burke等人发现,仅仅带有 ARS序列的载体虽然能够被复制,但极易在有丝 分裂时丢失。即使在选择培养基上,也只有5% 20%的子代细胞带有ARS载体。加入 Centromeres(CEN)能显著提高ARS质粒在有 丝分裂时的稳定性,90%以上子代细胞带有该载 体。CEN还能显著降低拷贝数,从20-50/细胞降 为1-2/细胞。( Science,236:806-812)
一、人工染色体构建 1983年，美国的Dana-Farber癌症研究所和 哈佛大学医学院的教授首次在Nature上发表文章， 报道了构建YAC（Yeast Artificial Chromosome） 库的过程。1987年，Burke等人发现，仅仅带有 ARS序列的载体虽然能够被复制，但极易在有丝 分裂时丢失。即使在选择培养基上，也只有5%- 20%的子代细胞带有ARS载体。加入 Centromeres （CEN）能显著提高ARS质粒在有 丝分裂时的稳定性，90%以上子代细胞带有该载 体。CEN还能显著降低拷贝数，从20-50/细胞降 为1-2/细胞。（Science, 236:806-812）
人工染色体含有三种必需成分:着丝粒、端粒和复 制起点。 着丝粒(CEN)位于染色体中央,呈纽扣状结构, 在有丝分裂时结合微管并调控染色体的运动,也 是姐妹染色单体配对时的最后位点,接收细胞信 号而使姐妹染色体分开 端粒(TEL):主要功能是防止染色体融合、降 解、确保其完整复制。端粒酶以其自身RNA为模 板,在染色体端部添加上端粒重复序列,并参与 端粒长度和细胞增殖的调控。 复制起点:DNA复制通常由起始蛋白与特定的 DNA序列相互作用开始。DNA合成的起始位点和 DNA复制起点(遗传位点所需的cis靶区常位于同 一段长约100bp的DNA上
人工染色体含有三种必需成分：着丝粒、端粒和复 制起点。 ▪ 着丝粒(CEN)位于染色体中央，呈纽扣状结构， 在有丝分裂时结合微管并调控染色体的运动，也 是姐妹染色单体配对时的最后位点，接收细胞信 号而使姐妹染色体分开。 ▪ 端粒（TEL）：主要功能是防止染色体融合、降 解、确保其完整复制。端粒酶以其自身RNA为模 板，在染色体端部添加上端粒重复序列，并参与 端粒长度和细胞增殖的调控。 ▪ 复制起点： DNA复制通常由起始蛋白与特定的 DNA序列相互作用开始。DNA合成的起始位点和 DNA复制起点(遗传位点)所需的Cis靶区常位于同 一段长约100bp的DNA上
AGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAG TCCCAATCCCAATCCCAATCCCAATCO Figure 6.5 Telomeric DNA