常用化合物数据库 FCD (Fine Chemicals Directory) MDL维护。收 载约90000个化合物和20000种化合物数据,包括化学 系统名、俗称、分子式、分子量、供应商、价格 CAS登录号、纯度等。可通过结构式或其它任何数据 检索 ACD(Available chemicals Directory MDL维护。 FCD数据库加上可大批量供货的化学品信息。目前有 25万个化合物 CSD( Cambridge structure database)20多万个 结晶的3D结构实验数据及相关数据
26 • FCD (Fine Chemicals Directory) —— MDL 维护。 收 载约90 000个化合物和20 000种化合物数据,包括化学 系统名、俗称、分子式、分子量、供应商、价格、 CAS登录号、纯度等。可通过结构式或其它任何数据 检索 • ACD (Available Chemicals Directory) ——MDL维护。 FCD数据库加上可大批量供货的化学品信息。目前有 25万个化合物 • CSD(Cambridge Structure Database) —— 20多万个 结晶的3D结构实验数据及相关数据 常用化合物数据库
商品可供化合物数据库
27 商品可供化合物数据库
第三节生物信息处理 生物信息学( bioinformatics) 基于数学、生命科学、化学和计算机科学的交叉 学科 利用计算机信息处理技术对大量生物大分子作信 息获取、加工、储存、分类、检索与统计分析,揭 示生物大分子的分子结构、功能、同源性和进化关 系 推动生命科学的发展,为创新药物的研究和开发 奠定基础
28 第三节 生物信息处理 生物信息学(bioinformatics) • 基于数学、生命科学、化学和计算机科学的交叉 学科 • 利用计算机信息处理技术对大量生物大分子作信 息获取、加工、储存、分类、检索与统计分析,揭 示生物大分子的分子结构、功能、同源性和进化关 系 • 推动生命科学的发展,为创新药物的研究和开发 奠定基础
生物信息学的内容 建立可贮存和管理大量生物信息学数据 集的数据库 处理大量数据的算法和统计方法 分析和解释不同类型的生物数据,如 RNA、DNA和蛋白质序列、蛋白质结构、 基因表达以及生化途径
29 生物信息学的内容 • 建立可贮存和管理大量生物信息学数据 集的数据库 • 处理大量数据的算法 和统计方法 • 分析和解释不同类型的生物数据,如 RNA 、DNA和蛋白质序列、蛋白质结构、 基因表达以及生化途径
生物信息学的应用 Channel 3 分子动力学模拟 分子相互作用 可视化,数据处理 Genomes TCGCGCGTTTCGGIGATGAC GGIGAAAACCICIGACACAT. MSMINISDICSSRRRS QLVCKRMPGADKPVRARORV 蛋白质作用网络 序列分析 结构预测(同源模建〕
30 序列分析 结构预测(同源模建) PowerEdge 6400 分子相互作用 可视化,数据处理 Genomes TCGCGCGTTTCGGTGATGAC GGTGAAAACCTCTGACACAT... Proteins SRVSVMTVKTSDTCSSRRRS QLVCKRMPGADKPVRARQRV... 蛋白质作用网络 分子动力学模拟 生物信息学的应用