成都大亭 CHENGDU UNIVERSITY 为1份自尊 插入靶位点 ATGC⊥ 转座时发生的插入作用有一个普遍 的特征,那就是受体分子中有一段很 TACGT 短的(3-12bp)、被称为靶序列的 DNA会被复制,使插入的转座子位于 ■■■■ 丙个重复的靶序列之问。不同转座子 TACGT 的靶序列长度不同,但对于一个特定 ATGCAA IS因子 的转座子来说,它所复制的靶序列长 度都是一样的,如lSl两翼总有9个碱基 TT 对的靶序列,而Tn3两端总有5bp的靶 ATGCA Is因子 TGCA 序列 TACGT TACGT 同向重复序列 CHENGDU UNⅣ ERSITY
转座时发生的插入作用有一个普遍 的特征，那就是受体分子中有一段很 短的（3-12bp）、被称为靶序列的 DNA会被复制，使插入的转座子位于 两个重复的靶序列之间。不同转座子 的靶序列长度不同，但对于一个特定 的转座子来说，它所复制的靶序列长 度都是一样的，如IS1两翼总有9个碱基 对的靶序列，而Tn3两端总有5bp的靶 序列
成都大亭 CHENGDU UNIVERSITY 为1份自尊 70m 1504 3 Attack of H2o 3 Cleavage Hairpin formation Resolution of hairpin Target caotun OE t9-bp duplication CHENGDU UNⅣ ERSITY
成都大亭 CHENGDU UNIVERSITY 为1份自尊 代谢通路清晰 代谢通路部分清晰 基因测序 确定目的基因 CHENGDU UNⅣ ERSITY
确定目的基因 代谢通路清晰 代谢通路部分清晰 基因测序
成都大亭 CHENGDU UNIVERSITY 为1份自尊 如何来定位基因? 一、 antiSMAH—寻找基因组上的次级代谢产物基因簇 Notes:on setings ate nput M时 分为细菌、真菌和植物,建议输入邮箱,输入后应该会有邮件提醒, 因为在线比对肘间比较久,网站上说需要几个小肘的肘间。 CHENGDU UNⅣ ERSITY
一、antiSMAH——寻找基因组上的次级代谢产物基因簇 分为细菌、真菌和植物，建议输入邮箱，输入后应该会有邮件提醒， 因为在线比对时间比较久，网站上说需要几个小时的时间。 如何来定位基因？
成都大亭 CHENGDU UNIVERSITY 为1份自尊 Data input Get from NCBI sequence. fasta Browse Sequence file(GenBank/ EMBL FASTA format Browse Feature annotations(optional, GFF3 format) Prodigal Metagenome Gene finder to use(if not providing a F3 file) 然后是数据输入,可以选择在NCBl上输入 accession号,也可以自己 提交数据。 Analysis options ClusterFinder Use ClusterFinder algorithm for BGC border prediction Probabilistic BGC detection Minimum cluster size in CDS Minimum number of biosynthesis-related PFAM domains Minimum ClusterFinder probabiltiy 60% CHENGDU UNⅣ ERSITY
然后是数据输入，可以选择在NCBI上输入accession号，也可以自己 提交数据