第六章基因分析的基本策略 从上世纪70年代以来,与DNA、RNA操作相关的各 种分子生物学技术不断发展,到目前已经形成了一个 庞大而复杂的技术体系。基因操作已成为医学研究的 重要手段。简单地说,基因操作就是所有涉及到DNA、 RNA操作的技术。 本章主要讨论如何对基因进行定性、定量分析;在随 后的2章里分别介绍基因功能研究的技术和基因工程的 有关内容
从上世纪70年代以来,与DNA、RNA操作相关的各 种分子生物学技术不断发展,到目前已经形成了一个 庞大而复杂的技术体系。基因操作已成为医学研究的 重要手段。简单地说,基因操作就是所有涉及到DNA、 RNA操作的技术。 本章主要讨论如何对基因进行定性、定量分析;在随 后的2章里分别介绍基因功能研究的技术和基因工程的 有关内容。 第六章 基因分析的基本策略
对一个已知或未知基因的内容进行研究步骤: 1、需要进行基因的DNA序列分析:序列测定 2、基因的染色体上定位:原位杂交技术 3、研究基因在基因组中的拷贝数:Southern Blot 4、研究基因表达水平:Northern Blot、.逆转录 实时PCR技术 5、研究基因表达产物的水平:Vestern Blot、 流式细胞仪(FACS)
1、需要进行基因的DNA序列分析:序列测定 2、基因的染色体上定位:原位杂交技术 3、研究基因在基因组中的拷贝数:Southern Blot 4、研究基因表达水平:Northern Blot、逆转录 实时PCR技术 5、研究基因表达产物的水平:Western Blot、 流式细胞仪( FACS ) 对一个已知或未知基因的内容进行研究步骤:
第一节利用DNA定性、定量分析可从不同角度 对基因和基因组进行研究 DNA序列测定可以揭示基因和基因组一级结构变化 DNA测序技术: 1、双脱氧链终止法(Sanger法) 2、化学裂解法 3、PCR测序技术 4、全自动DNA测序仪 这些技术的发明,都依赖于高分辨率的聚丙烯酰胺凝胶电泳技术
第一节 利用DNA定性、定量分析可从不同角度 对基因和基因组进行研究 一、DNA序列测定可以揭示基因和基因组一级结构变化 DNA测序技术: 1、双脱氧链终止法(Sanger法) 2、化学裂解法 3、PCR测序技术 4、全自动DNA测序仪 这些技术的发明,都依赖于高分辨率的聚丙烯酰胺凝胶电泳技术
双脱氧测序方法原理 Sanger双脱氧链终止法引入了双脱氧核苷三磷酸 (2·,3-ddNTP)作为链终止剂。2·,3·-ddNTP脱氧 核糖的3·位缺少羟基,它可以与多核苷酸链的3·羟基 形成磷酸二酯键,但却不能与下一个核苷酸缩合,导致 多核苷酸链的延伸终止。 如果在DNA的合成反应中,加入一种少量的ddNTP,则多 核苷酸链的延伸将在随机的位点终止,生成一系列长短 不一的核苷酸链。在4组独立的DNA合成反应中,分别加 入4种不同的ddNTP,结果生成的4组核苷酸链将分别终止 于各个A,G,C,T的位置上。对这4组核苷酸链进行高分 辨变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,就可读出序列
Sanger双脱氧链终止法引入了双脱氧核苷三磷酸 (2ˊ,3ˊ-ddNTP)作为链终止剂。2ˊ,3ˊ-ddNTP脱氧 核糖的3ˊ位缺少羟基,它可以与多核苷酸链的3ˊ羟基 形成磷酸二酯键,但却不能与下一个核苷酸缩合,导致 多核苷酸链的延伸终止。 如果在DNA的合成反应中,加入一种少量的ddNTP,则多 核苷酸链的延伸将在随机的位点终止,生成一系列长短 不一的核苷酸链。在4组独立的DNA合成反应中,分别加 入4种不同的ddNTP,结果生成的4组核苷酸链将分别终止 于各个A,G,C,T的位置上。对这4组核苷酸链进行高分 辨变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,就可读出序列。 双脱氧测序方法原理
p dATP dGTP 5 OH OHOH 引物链 000 A T G C G 0-P-0-P-0-p-0-CH40 碱基 0 0 0 3 A C GG C TACT H H H H 模板链 HH oo0eoOeOo 双脱氧核苷三磷酸类似物 (a) (b) 引物 5 OH 3 CTAAGCTCGACT 模板