第二章生物信息学数据库简
第二章 生物信息学数据库简介
数据库( Database) 用于收集、整理、储存、加工、发布 和检索数据的系统。 ◆生物类的数据库种类很多 ◆投稿文章首先要将核苷酸序列或蛋白 质序列提交到相应的数据库中
数据库（Database） 用于收集、整理、储存、加工、发布 和检索数据的系统。 生物类的数据库种类很多 投稿文章首先要将核苷酸序列或蛋白 质序列提交到相应的数据库中
◆数据库记录通常包括两部分 ◇原始数据 对这些数据进行的生物学意义的注释 ◆一个数据库通常链接了多个相关数据库 令核苷酸数据库一水稻抗病基因X26 AY364476 Taxonomy数据库 Pubmed数据库 NCBI- Protein数据库
数据库记录通常包括两部分 原始数据 对这些数据进行的生物学意义的注释 一个数据库通常链接了多个相关数据库 核苷酸数据库－水稻抗病基因Xa26 AY364476 Taxonomy 数据库 Pubmed 数据库 NCBI-Protein 数据库
(一)数据库工具 ◆建立纯文本数据库 令 Gen bank数据库、EMBL核苷酸数据库 MySQL数据库工具 令SQL(结构化查询语言)是世界上流行的和 标准化的数据库语言 令能够快速灵活存储记录文件和图像 ☆下载网址 http://download.sourceforge.net/pub/mirrors/mys ql/Downloads/MysQL-323/mysql-323 38 win.zp
（一）数据库工具 建立纯文本数据库 GenBank 数据库、EMBL 核苷酸数据库 MySQL 数据库工具 SQL（结构化查询语言）是世界上流行的和 标准化的数据库语言 能够快速灵活存储记录文件和图像 下载网址 http://download.sourceforge.net/pub/mirrors/mys ql/Downloads/MySQL-3.23/mysql-3.23.38- win.zp
◆ AceDB数据库工具 令 AceD:AC. elegans Data Base(线虫数据库) 令被广泛应用的管理和提供基因组数据的工具 令数据形式丰富 √遗传图谱 √物理图谱 √新陈代谢途径 序列等
AceDB 数据库工具 AceDB：A C. elegans DataBase（线虫数据库） 被广泛应用的管理和提供基因组数据的工具 数据形式丰富 9 遗传图谱 9 物理图谱 9 新陈代谢途径 9 序列等