第八章酶的别构效应 本章中将讨论一些不符合米氏方程的酶动力学,即非双曲线动力学。有些影响酶活性的效应 剂(包括激活剂和抑制剂)作用于酶活性部位以外的部位,通过酶分子构象的改变来调节酶的活 性。这种效应叫做别构效应( allosteric effects),这种效应剂叫做别构效应剂,受别构效应剂影响 的酶叫别构酶( (allosteric enzyme) 81别构酶与代谢调节 81.1别构效应在代谢调节中的意义 生物体内的物质代谢都是在酶的直接作用下进行的,要使物质代谢协调有序地进行,酶活性 必须根据情况适时地改变。利用别构效应调节酶活性是各种酶活性调节方式中最迅速的一种,大 多数代谢物的反馈抑制就属于别构调节,也有一些代谢物可对代谢途径中的酶起别构激活作用。 81.1.1别构抑制作用 反馈抑制可分为五种类型 A.线性通路中的反馈抑制 条途径的最终产物抑制途径中最初的酶活性 B A B 十>>)—>D 线性通路中的反馈抑制 趋同通路中的反馈抑伟 B.趋同通路中的反馈抑制 为了有效地合成D,要求B和C的浓度大致相等。当C浓度大时,对产生B的途径的最初 的酶有激活作用;当B浓度大时,对产生B的途径的最初的酶有抑制作用 C.趋散通路中的反馈抑制 Ec和ED为两种同工酶,分别A=—)—→B A—B -c 受C和D的反馈抑制。当C太多 顺序反馈抑制 时,不仅抑制从B到C的第一个 趋散通路中的反馈抑制 酶,而且抑制从A到B的第一个反应两种同工酶中的一种,使得B合成的速率下降。B的合成 不能完全停止,因为合成D还需要B。当D太多时情况相似
1 第八章 酶的别构效应 本章中将讨论一些不符合米氏方程的酶动力学,即非双曲线动力学。有些影响酶活性的效应 剂(包括激活剂和抑制剂)作用于酶活性部位以外的部位,通过酶分子构象的改变来调节酶的活 性。这种效应叫做别构效应(allosteric effects),这种效应剂叫做别构效应剂,受别构效应剂影响 的酶叫别构酶(allosteric enzyme)。 8.1 别构酶与代谢调节 8.1.1 别构效应在代谢调节中的意义 生物体内的物质代谢都是在酶的直接作用下进行的,要使物质代谢协调有序地进行,酶活性 必须根据情况适时地改变。利用别构效应调节酶活性是各种酶活性调节方式中最迅速的一种,大 多数代谢物的反馈抑制就属于别构调节,也有一些代谢物可对代谢途径中的酶起别构激活作用。 8.1.1.1 别构抑制作用 反馈抑制可分为五种类型: A. 线性通路中的反馈抑制 一条途径的最终产物抑制途径中最初的酶活性。 B. 趋同通路中的反馈抑制 为了有效地合成 D,要求 B 和 C 的浓度大致相等。当 C 浓度大时,对产生 B 的途径的最初 的酶有激活作用;当 B 浓度大时,对产生 B 的途径的最初的酶有抑制作用。 C.趋散通路中的反馈抑制 EC和 ED 为两种同工酶,分别 受 C 和 D 的反馈抑制。当 C 太多 时,不仅抑制从 B 到 C 的第一个 酶,而且抑制从 A 到 B 的第一个反应两种同工酶中的一种,使得 B 合成的速率下降。B 的合成 不能完全停止,因为合成 D 还需要 B。当 D 太多时情况相似
D.顺序反馈抑制 条途径中有多个反馈抑制步骤 E.协调反馈抑制 需要多种代谢物共同作用才能发挥反馈抑制作用 81.1.2别构激活作用 当一种代谢物积累后,激活某些酶,从而加强别的代谢途径。如有氧呼吸旺盛时,AIP大量 合成,AMP和ADP减少,由于AMP和ADP是异柠檬酸脱氢酶的激活剂,因此异柠檬酸和柠 檬酸浓度増髙,柠檬酸能激活乙酰CoAλ羧化酶和己糖激酶,同时抑制PFK(磷酸果糖激酶)。激 活乙酰CoA羧化酶可增强脂肪酸的合成,激活己糖激酶且抑制PFK,可使G-6-P更多地进入磷 酸戊糖途径,合成更多的 NADPH,供脂肪酸合成使用 82别构酶的基本概念 821一个典型的别构酶—天冬氨酸转氨甲酰酶 天冬氨酸转氨甲酰酶( aspartate transcarbamoylase,AC)是嘧啶核苷酸生物合成途径的第一 个酶(→ UTP→CTP)。ATC的活性受到CTP的强烈抑制,又受到ATP的高效激活(见 下表)。在对照、加AIP、加CTP三种情况的[S对V图中可以看出,对照呈S形曲线而不是双 曲线:加ATP减小了反应的表观Kn值,使曲线向双曲线靠近;加CTP增大了反应的表观Km值, 使曲线的S形更加明显。加AP和CTP并不影响Vm。 表效应剂对天冬氨酸转氨甲酰酶活性的作用 效应剂 抑制% 胞嘧啶 胞嘧啶核苷 胞苷一磷酸(CMP) 天冬氨酸浓度nno1/L 嘧啶族 曲I对照;曲线Ⅱ加2mnol/LATP 胞苷二磷酸(CDP) 886 曲线I!加0.2mno/LcTP 胞苷三磷酸(CTP) COoH 尿苷三磷酸(UTP) H2N-C-0- P)+H2N-CI 鸟苷三磷酸(GTP) 氨甲酰磷酸 氪甲酰天冬氨酸 嘌呤族 腺苷三磷酸(AIP 180(激活)
2 D.顺序反馈抑制 一条途径中有多个反馈抑制步骤。 E.协调反馈抑制 需要多种代谢物共同作用才能发挥反馈抑制作用。 8.1.1.2 别构激活作用 当一种代谢物积累后,激活某些酶,从而加强别的代谢途径。如有氧呼吸旺盛时,ATP 大量 合成,AMP 和 ADP 减少,由于 AMP 和 ADP 是异柠檬酸脱氢酶的激活剂,因此异柠檬酸和柠 檬酸浓度增高,柠檬酸能激活乙酰 CoA 羧化酶和己糖激酶,同时抑制 PFK(磷酸果糖激酶)。激 活乙酰 CoA 羧化酶可增强脂肪酸的合成,激活己糖激酶且抑制 PFK,可使 G-6-P 更多地进入磷 酸戊糖途径,合成更多的 NADPH,供脂肪酸合成使用。 8.2 别构酶的基本概念 8.2.1 一个典型的别构酶——天冬氨酸转氨甲酰酶 天冬氨酸转氨甲酰酶(aspartate transcarbamoylase, ATC)是嘧啶核苷酸生物合成途径的第一 个酶(→ → → UTP → CTP)。ATC 的活性受到 CTP 的强烈抑制,又受到 ATP 的高效激活(见 下表)。在对照、加 ATP、加 CTP 三种情况的[S]对 V 图中可以看出,对照呈 S 形曲线而不是双 曲线;加 ATP 减小了反应的表观 Km值,使曲线向双曲线靠近;加 CTP 增大了反应的表观 Km值, 使曲线的 S 形更加明显。加 ATP 和 CTP 并不影响 Vm。 表 效应剂对天冬氨酸转氨甲酰酶活性的作用 效应剂 抑制% 嘧啶族 胞嘧啶 0 胞嘧啶核苷 24 胞苷一磷酸(CMP) 38 胞苷二磷酸(CDP) 68 胞苷三磷酸(CTP) 86 尿苷三磷酸(UTP) 8 嘌呤族 鸟苷三磷酸(GTP) 35 腺苷三磷酸(ATP) -180(激活)
为了解释这种现象,研究者设想在酶分子中有两个分开的部位,一个部位与底物结合并催化 反应,另一个部位是ATP或CTP等效应剂的结合位点。利用选择性修饰法修饰后一个部位后, AI℃C的活性并不丧失,但对CIP抑制的敏感性下降,这种现象称为脱敏作用。选择性修饰实验 证实了两个部位的设想。现在我们知道,ATC由12条多肽链组成,2个a3亚基,3个B2亚基 根据对ATC的研究,得出了5点结论 1.酶分子上有两个结合部位,结合底物并催化反应的部位叫活性部位,结合效应剂的部位叫别 构部位或调节部位 2.这两个部位能同时分别被底物和效应剂占据 3.调节部位可与多种效应剂结合,并产生不同的效应。 4.效应剂的结合影响酶分子的构象,从而影响酶的着底物的结合能力和催化能力 5.调节部位的效应是构成别构抑制或别构激活的基础,而后两者又是代谢调节的有效方式之 822别构酶的协同效应 协同效应( cooperative effects)也是多亚基别构酶的一个特征。我们把能与酶结合的底物、 激活剂和抑制剂统称为配体,所谓协同效应是指当一个配体与酶结合以后,可以促进或抑制另 个配体与酶的结合 8221协同效应的分类 A.同种效应和异种效应 同种效应( homotropic effects)指的是一分子配体与酶结合后影响另一分子同种配体与酶的 结合:异种效应( heterotropic effects)指的是一分子配体与酶结合后影响另一分子异种配体与酶 的结合。 B.正协同和负协同 分子配体与酶结合后促进另一分子配体与酶结合叫正协同( positive cooperation),抑制另 一分子配体与酶结合叫负协同( negative cooperation)。 同种效应一般是正协同:异种效应有正协同,也有负协同。 8222协同效应的鉴别方法 通过动力学作图,可以鉴别正协同、负协同和无协同。 8223协同指数和协同系数
3 为了解释这种现象,研究者设想在酶分子中有两个分开的部位,一个部位与底物结合并催化 反应,另一个部位是 ATP 或 CTP 等效应剂的结合位点。利用选择性修饰法修饰后一个部位后, ATC 的活性并不丧失,但对 CTP 抑制的敏感性下降,这种现象称为脱敏作用。选择性修饰实验 证实了两个部位的设想。现在我们知道,ATC 由 12 条多肽链组成,2 个α3 亚基,3 个β2 亚基。 根据对 ATC 的研究,得出了 5 点结论: 1.酶分子上有两个结合部位,结合底物并催化反应的部位叫活性部位,结合效应剂的部位叫别 构部位或调节部位。 2.这两个部位能同时分别被底物和效应剂占据。 3.调节部位可与多种效应剂结合,并产生不同的效应。 4.效应剂的结合影响酶分子的构象,从而影响酶的着底物的结合能力和催化能力。 5.调节部位的效应是构成别构抑制或别构激活的基础,而后两者又是代谢调节的有效方式之一。 8.2.2 别构酶的协同效应 协同效应(cooperative effects)也是多亚基别构酶的一个特征。我们把能与酶结合的底物、 激活剂和抑制剂统称为配体,所谓协同效应是指当一个配体与酶结合以后,可以促进或抑制另一 个配体与酶的结合。 8.2.2.1 协同效应的分类 A.同种效应和异种效应 同种效应(homotropic effects)指的是一分子配体与酶结合后影响另一分子同种配体与酶的 结合;异种效应(heterotropic effects)指的是一分子配体与酶结合后影响另一分子异种配体与酶 的结合。 B.正协同和负协同 一分子配体与酶结合后促进另一分子配体与酶结合叫正协同(positive cooperation),抑制另 一分子配体与酶结合叫负协同(negative cooperation)。 同种效应一般是正协同;异种效应有正协同,也有负协同。 8.2.2.2 协同效应的鉴别方法 通过动力学作图,可以鉴别正协同、负协同和无协同。 8.2.2.3 协同指数和协同系数
协同指数( cooperative index,C)是指酶的底物结合位点被底物饱和90%和饱和10% 作图法 正协同效应 负协同效应 无协同效应 Menten作图 [S] [S Burk作图 0 0 Hane作图 Vn-V Hi1l作图 lg[S] lg [S] lg[S] 动力学作图法鉴别协同效应 (即V=09Vm和Ⅴ=0.IVm)时的底物浓度之比,故协同指数又称饱和比值( Ratio saturation, Rs)。 对于一个可结合n个底物分子的酶,其反应式可用下式表示: E+ns ESn->E+nP 按米氏方程的推导过程可得V=mS……④.,式中k=ES!。这里假设 个底物是同时结合上去的 当V=09Vm时,S19=(9K3);当V=0.IVm时,[S11=(=Ks)”。 B 因此,当n=1时,C=81,和以前讲过的单底物单产物反应的米氏方程相同,无协同效应
4 协同指数(cooperative index,CI)是指酶的底物结合位点被底物饱和 90%和饱和 10% (即 V = 0.9Vm和 V = 0.1Vm)时的底物浓度之比,故协同指数又称饱和比值(Ratio saturation, Rs)。 对于一个可结合 n 个底物分子的酶,其反应式可用下式表示: 按米氏方程的推导过程可得 n S n m K S V S V [ ] [ ] + = …………①,式中 [ ] [ ][ ] n n S ES E S K = 。这里假设 n 个底物是同时结合上去的。 当 V = 0.9Vm时,[S]0.9 = n KS 1 (9 ) ;当 V = 0.1Vm时,[S]0.1 = n KS 1 ) 9 1 ( 。 CI = Rs = 0.1 0.9 [ ] [ ] S S = n 1 81 因此,当 n=1 时,CI=81,和以前讲过的单底物单产物反应的米氏方程相同,无协同效应
当n斗l时,CI<81,为正协同,表示V对S]改变的灵敏度增加,且n越大正协同效应越大:当 n<1时,CI>81,为负协同,表示Ⅴ对S]改变的灵敏度减小,且n越小负协同效应越大。n值 即为协同系数 从理论上推导上式时,n是与酶结合的底物分子数,但实际上测出的n值(测定方法见后) 有小于1的情况。上面说的n>1、n=1、n<l指的是实际测定值,这是因为推导上式时的前提 就不正确,n个底物并不是同时结合上去和同时解离下来的。 别构激活剂常可减少正协同效应(底物和底物之间的正协同)的n值,使正协同效应减弱 在Ⅴ对[S]作图中,可使S形曲线趋向双曲线。相反,别构抑制剂常可增加正协同效应的n值, 使正协同效应增强,使S形曲线弯曲更加明显。 8224半位反应性 兔肌和细菌的3-磷酸甘油醛脱氢酶由4个同种亚基组成,每个亚基上有1个NAD结合位点, 但实验结果发现该酶往往只能结合2个NAD分子,这就是半位反应性。半位反应性实际上是一 种极端的负协同效应,当第一、二个NAD与酶结合后,第三个结合位点与NAD的亲和力已降 得很低,实际上已不能与NAD结合 8225协同效应的生理意义 异种协同效应分为别构激活(异种正协同)和别构抑制(异种负协同)效应。它们的意义已 在7.1.1中讨论过 底物引起的同种协同效应的生理意义已有一些推测。正协同效应提供了一个V对[S]的敏感 区域,即S形曲线中的“陡段”,当细胞内底物浓度处于这个“陡段”时,[S]的轻微变化可使Ⅴ 发生很大的变化,有稳定[S]的作用。当细胞内底物浓度处于低S]的平缓段时,[S的变化不会使 Ⅴ有太大的变化,有稳定V的作用。别构激活剂和别构抑制剂可使“陡段”左移和右移。 底物引起的负协同效应在更大的S]范围里使Ⅴ稳定,如3-磷酸甘油醛脱氢酶在低浓度时 能顺利地进行糖酵解,而当其他反应影响使NAυ浓度增加时,即使大幅度地增加NADˉ(100 倍以内),都可因其半位反应性而不增加酶反应速度 823别构酶的其他动力学术语 A. So.5
5 当 n >1 时,CI < 81,为正协同,表示 V 对[S]改变的灵敏度增加,且 n 越大正协同效应越大;当 n <1 时,CI > 81,为负协同,表示 V 对[S]改变的灵敏度减小,且 n 越小负协同效应越大。n 值 即为协同系数。 从理论上推导上式时,n 是与酶结合的底物分子数,但实际上测出的 n 值(测定方法见后) 有小于 1 的情况。上面说的 n >1、n=1、n <1 指的是实际测定值,这是因为推导上式时的前提 就不正确,n 个底物并不是同时结合上去和同时解离下来的。 别构激活剂常可减少正协同效应(底物和底物之间的正协同)的 n 值,使正协同效应减弱, 在 V 对[S]作图中,可使 S 形曲线趋向双曲线。相反,别构抑制剂常可增加正协同效应的 n 值, 使正协同效应增强,使 S 形曲线弯曲更加明显。 8.2.2.4 半位反应性 兔肌和细菌的 3-磷酸甘油醛脱氢酶由 4 个同种亚基组成,每个亚基上有 1 个 NAD+结合位点, 但实验结果发现该酶往往只能结合 2 个 NAD+分子,这就是半位反应性。半位反应性实际上是一 种极端的负协同效应,当第一、二个 NAD+与酶结合后,第三个结合位点与 NAD+的亲和力已降 得很低,实际上已不能与 NAD+结合。 8.2.2.5 协同效应的生理意义 异种协同效应分为别构激活(异种正协同)和别构抑制(异种负协同)效应。它们的意义已 在 7.1.1 中讨论过。 底物引起的同种协同效应的生理意义已有一些推测。正协同效应提供了一个 V 对[S]的敏感 区域,即 S 形曲线中的“陡段”,当细胞内底物浓度处于这个“陡段”时,[S]的轻微变化可使 V 发生很大的变化,有稳定[S]的作用。当细胞内底物浓度处于低[S]的平缓段时,[S]的变化不会使 V 有太大的变化,有稳定 V 的作用。别构激活剂和别构抑制剂可使“陡段”左移和右移。 底物引起的负协同效应在更大的[S]范围里使 V 稳定,如 3-磷酸甘油醛脱氢酶在低浓度时, 能顺利地进行糖酵解,而当其他反应影响使 NAD+浓度增加时,即使大幅度地增加 NAD+(100 倍以内),都可因其半位反应性而不增加酶反应速度。 8.2.3 别构酶的其他动力学术语 A.S 0。5