(a) (e) 3to helix a helix helix 典型的a-螺旋3.613和非典型的a-螺旋3.010,4.416(π螺旋)
一些侧链基团虽然不参与螺旋,但他们可影响α-螺旋的稳定性 ● 在多肽链中连续的出现带同种电荷的极性氨基酸,α-螺旋就不稳定。 在多肽链中只要出现pro,α-螺旋就被中断,产生一个弯曲 (bend)或结节(kink)。 ● Gly的R基太小,难以形成α-螺旋所需的两面角,所以和Pro一样 也是螺旋的最大破坏者。 ● 肽链中连续出现带庞大侧链的氨基酸如Ile,由于空间位阻,也难 以形成α-螺旋。 ●
一些侧链基团虽然不参与螺旋,但他们可影响α-螺旋的稳定性 ● 在多肽链中连续的出现带同种电荷的极性氨基酸,α-螺旋就不稳定。 在多肽链中只要出现pro,α-螺旋就被中断,产生一个弯曲 (bend)或结节(kink)。 ● Gly的R基太小,难以形成α-螺旋所需的两面角,所以和Pro一样 也是螺旋的最大破坏者。 ● 肽链中连续出现带庞大侧链的氨基酸如Ile,由于空间位阻,也难 以形成α-螺旋。 ●
(2) β-折叠 也是pauling等人提出来的,它是 与α-螺旋完全不同的一种结构。 ① β-折叠主链骨架以一定的折叠形式 形成一个折叠的片层。 ② 在两条相邻的肽链之间形成氢链
(2) β-折叠 也是pauling等人提出来的,它是 与α-螺旋完全不同的一种结构。 ① β-折叠主链骨架以一定的折叠形式 形成一个折叠的片层。 ② 在两条相邻的肽链之间形成氢链
③ β-折叠有平行和反平行的两种形式: ④ 每一个氨基酸在主轴上所占的距离,平行的是0.325nm,反平 行的是0.35nm
③ β-折叠有平行和反平行的两种形式: ④ 每一个氨基酸在主轴上所占的距离,平行的是0.325nm,反平 行的是0.35nm
(3) β-转角 (β-turn) β-转角是指蛋白质的分子的多肽链经常出现180º的回折,在回折角 上的结构就称β-转角,也称发夹结构,或称U形转折。由第一个氨基 酸残基的C=O与第四个氨基酸残基的N—H之间形成氢键
(3) β-转角 (β-turn) β-转角是指蛋白质的分子的多肽链经常出现180º的回折,在回折角 上的结构就称β-转角,也称发夹结构,或称U形转折。由第一个氨基 酸残基的C=O与第四个氨基酸残基的N—H之间形成氢键