aOpenporeInward-facingTQ264Q264OutPoreCore-panelinterfaceS199S199P?InCytoplasmicN103cavityN103bHydrophilicHydrophobicOutCore-panelinterfaceInCytoplasmicPorecavityKapil,Nature.2022;606(7916):1015-1020
Kapil, Nature. 2022; 606(7916): 1015–1020
NTCPExtracellularNterminus>panel结构域: TM1、TM5、TM6;>core结构域TM2-4AH1CterminusTM7-9构成的PanelCoreIntracellular3aPanelCoreMb91L90OutanNTCP9in
Ø panel结构 域:TM1、 TM5、TM6; Ø core结构域: TM2-4、 TM7-9构成 的
2.折叠(βstrand)折叠是指蛋白质多肽链局部肽段的主链构象呈锯齿状。>一个β折叠单位含两个氨基酸发(相当于两个肽单位);>β折叠中R基交替排布在β折叠两侧;>多数β折叠比较短,仅5~8AA,但也有长的,如构成蜘蛛丝、蚕丝的丝心蛋白,其二级结构几乎都是β折叠
2. β折叠 (β strand) β折叠是指蛋白质多肽链局部肽段的主链构象呈锯齿状。 Ø 一个β折叠单位含两个氨基酸(相当于两个肽单位); Ø β折叠中R基交替排布在β折叠两侧; Ø 多数β折叠比较短,仅5~8AA,但也有长的,如构成 蜘蛛丝、蚕丝的丝心蛋白,其二级结构几乎都是β折叠
N0.65nm0.7nm2②反向平行的β折叠①同向平行的β折叠C>同向平行相邻肽链是同向的,β折叠单位为0.65nm;反向平行相邻肽链是反向的,β折叠单位为0.7nm;侧链R基团垂直于折叠平面,交替分布在平面的上下方;>C=O和N一H形成链间氢键,,是维持折叠稳定性的主要作用力。>肽链数目:同向平行一般≥5,反向平行一般>2
Ø 同向平行相邻肽链是同向的,β折叠单位为0.65nm;反向平行 相邻肽链是反向的,β折叠单位为0.7nm;侧链R基团垂直于折 叠平面,交替分布在平面的上下方; ØC=O和N—H形成链间氢键,是维持β折叠稳定性的主要作用 力。 Ø肽链数目:同向平行一般≥5,反向平行一般≥2
平行β-折叠片氢键≥5顶面观多肽链伸展不及反平行式6.5A重复中=-119=+1137A重复反向平行侧面观6.5A重复同向平行