工真核基因启动子 真核生物有3类RNA聚合酶,负责转录3类不同的启动子 Erotic nuclei have three RNA polymerases Location Product Relative Activity a-Amanitin Sensitivity HA polymeraseI Nucleolus Ribosomal RNA 50-70% Not sensitive i polymerase Nucleoplasm Nuclear RNA 2040% Sensitive mae‖ Nucleoplasm tRNA 1% Species-specific
Ⅱ.真核基因启动子 真核生物有3类RNA聚合酶，负责转录3类不同的启动子
由RNA聚合酶负责转录的RNA基因,启动子(1类) 比较单一,由转录起始位点附近的两部分序列构成。第 部分是核心启动子( core promoter),由-45—+20位核 苷酸组成,单独存在时就足以起始转录。另一部分由- 170—-107位序列组成,称为上游调控元件,能有效地增 强转录效率 Pal I promoter have two sequence component CTCCGAGTCGNNNNNNTGGGCCGCCGG Startpoin Upstream control element Core promot 三1704601501413012010 605040302010 +10 mMM: AVVMMW
由RNA聚合酶I负责转录的rRNA基因，启动子（I类） 比较单一，由转录起始位点附近的两部分序列构成。第一 部分是核心启动子（core promoter），由-45—+20位核 苷酸组成，单独存在时就足以起始转录。另一部分由- 170—-107位序列组成，称为上游调控元件，能有效地增 强转录效率
由RNA聚合酶Ⅲ负责转录的是5SRNA、tRNA和某 些核内小分子RNA( SnRNA),其启动子(Ⅲ类)组成 较复杂,又可被分为三个亚类。两类5 S rRNA和tRNA基 因的启动子是内部启动子( internal promoter),位于转 录起始位点的下游,都由两部分组成。第三类启动子由三 个部分组成,位于转录起始位点上游。 Figure 29.5 moters for RNA polymerase Ill may consist bipartite sequences downstream of the starpoint, with boxA tted from either boxc box A box c cr boxB, Or they may consist of separated no upstream of the /t0MMMMMMMtNpwML sequenc PSE, TATA PSE TATA
由RNA聚合酶Ⅲ负责转录的是5SrRNA、tRNA和某 些核内小分子RNA（snRNA），其启动子（Ⅲ类）组成 较复杂，又可被分为三个亚类。两类5S rRNA和tRNA基 因的启动子是内部启动子（internal promoter），位于转 录起始位点的下游，都由两部分组成。第三类启动子由三 个部分组成，位于转录起始位点上游
由RNA聚合酶责转录的类基因包括所有蛋白质编码基因和部分 SnRNA基因,后者的启动子结构与Ⅲ类基因启动子中的第三种类型 相似,编码蛋白质的Ⅲ类基因启动子在结构上有共同的保守序列。 转录起始位点没有广泛的序列同源性,但第一个碱基为腺嘌呤,而 两侧是嘧啶碱基。这个区域被称为起始子( initiator,Inr),序列 可表示为Py2CAPy5。n元件位于3-+5。仅由n元件组成的启动 子是具有可被RNA聚合酶识别的最简单启动子形式 多数类启动子有一个被称为TATA盒的共有序列,通常处于30区, 相对于转录起始位点的位置比较固定。TATA盒存在于所有真核生物 中,TATA盒是一个保守的七碱基对,其序列为: T82A9Tg348634:50 37 33
▪ 由RNA聚合酶II负责转录的II类基因包括所有蛋白质编码基因和部分 snRNA基因，后者的启动子结构与III类基因启动子中的第三种类型 相似，编码蛋白质的II类基因启动子在结构上有共同的保守序列。 转录起始位点没有广泛的序列同源性，但第一个碱基为腺嘌呤，而 两侧是嘧啶碱基。这个区域被称为起始子（initiator，Inr），序列 可表示为Py2CAPy5。Inr元件位于-3—+5。仅由Inr元件组成的启动 子是具有可被RNA聚合酶II识别的最简单启动子形式。 ▪ 多数II类启动子有一个被称为TATA盒的共有序列，通常处于-30区， 相对于转录起始位点的位置比较固定。TATA盒存在于所有真核生物 中，TATA盒是一个保守的七碱基对，其序列为：
也有一些类启动子不含有TATA盒,这样的启动子称为 无TATA盒启动子 Promoters contain 量 different combinations of TATA boxes, CAAT boxes, GC boxes and other elements stone H28 D 140-1201008o ypes of module CAAT TATA eam transcription factors bind to sequence elements that are common to mammalian RNA polymerase ll consensus DNA bound Factor stze(daltons) Abundance (cell) Distrlbution TATA bOx TATAAAA 10 bp TBP 27000 General CAAT bOx GGCCAATCT -22bp CTF/NF1 60.000 300.000 eneral GC bax GGGCGG -20 bp SP1 105.000 60,000 Genera Octan ATTTGCAT -20bp Oct-1 76.000 General Oct-2 52000 ? Lymphold GGGACTTTCC 10 bp NFKB 44,000 Lymphoid -10 bp H2-1F1 General ATF GTGACGT -20 bp ATF
▪ 也有一些II类启动子不含有TATA盒，这样的启动子称为 无TATA盒启动子