《生物技术制药》实验指导实验五:DNA的回收与连接【实验目的】外源DNA1.掌握DNA逆2.学会DNAEECoRmEoH【实验原理】将载体pUC118kb BamHI+EcoRI片段1:hgas用T4DNA连接酶连转化大肠杆菌T4-ligase
《生物技术制药》实验指导 18 实验五 DNA 的回收与连接 【实验目的】 1.掌握 DNA 连接的的方式和影响连接反应的因素。 2.学会 DNA 回收和连接技术。 【实验原理】 将载体 pUC118 用 BamHI + EcoRI 酶切,与目的基因 1.0kb BamHI + EcoRI 片段 用 T4DNA 连接酶连接起来。 T4-ligase
《生物技术制药》实验指导图5-1目的DNA与质粒连接示意图【实验材料和试剂】(一)实验材料1.实验二提取的质粒pUC1182.质粒pSYX1,可用BamHI+EcoRI切下1.0kb目的DNA。(二)试剂1.限制性内切酶BamHI和EcoRI2.DNA/HindIII分子量标准3.双蒸馏无菌水4.上海生工SilverBeadsDNA胶回收试剂盒5.溴酚蓝指示剂点样缓冲液6.1mg/ml溴化乙锭溶液7.电泳缓冲液(TAE)8.LB培养基9.X-gal(20mg/ml):5-溴-4-氯-3-吲哚--D-半乳糖苷(配制方法:用二甲基甲酰胺溶解X-gal,配制成20mg/ml的贮存液。防止光照破坏,-20℃保存)10:IPTG(20mg/ml):异丙基硫代--D-半乳糖苷(配制方法:用蒸馏水配制成20mg/ml的贮存液,-20℃保存)(三)器材1.5mlEppendorf管、2001吸头、90mm培养血、1ml移液管、手术刀片、三角爬。19
《生物技术制药》实验指导 19 图 5-1 目的 DNA 与质粒连接示意图 【实验材料和试剂】 (一)实验材料 1.实验二提取的质粒 pUC118 2.质粒 pSYX1,可用 BamHI + EcoRI 切下 1.0kb 目的 DNA。 (二)试剂 1.限制性内切酶 BamHI 和 EcoRI 2. HindIII 分子量标准 3.双蒸馏无菌水 4.上海生工 Silver Beads DNA 胶回收试剂盒 5.溴酚蓝指示剂点样缓冲液 6.1mg/ml 溴化乙锭溶液 7.电泳缓冲液(TAE) 8.LB 培养基 9.X-gal(20mg/ml):5-溴-4-氯-3-吲哚- -D-半乳糖苷 (配制方法:用二甲基甲酰胺溶解 X-gal,配制成 20mg/ml 的贮存液。防止光照 破坏,-20℃保存) 10.IPTG(20mg/ml):异丙基硫代- -D-半乳糖苷 (配制方法:用蒸馏水配制成 20mg/ml 的贮存液,-20℃保存) (三)器材 1.5ml Eppendorf 管、200 l 吸头、90mm 培养皿、1ml 移液管、手术刀片、三角爬
《生物技术制药》实验指导(四)仪器微量移液器、离心机、恒温水浴锅、电泳仪、水平电泳槽、透射紫外观察仪【实验步骤】(一)载体的线性化和制备目的基因片段1.取一个灭菌的Eppendorf管,依此加入下列试剂:11 1双蒸馏无菌水10x缓冲液2151质粒pUC118BamHI11EcoRI1 1总体积2012.取一个灭菌的Eppendorf管,依此加入下列试剂:双蒸馏无菌水11 110x缓冲液2 151pSYX1BamHI11EcoRI11201总体积3.用手指轻弹管壁,使各种试剂混匀,快速离心,以集中溶液。4.置37℃水浴60~120分钟。5.加入51溴酚蓝指示剂点样缓冲液,按实验三方法电泳,观察酶切反应结果,鉴定酶切效果。6.用干净的手术刀从琼脂糖凝胶中分别割下含有3.2kbDNA条带(pUC118)20
《生物技术制药》实验指导 20 (四)仪器 微量移液器、离心机、恒温水浴锅、电泳仪、水平电泳槽、透射紫外观察仪。 【实验步骤】 (一)载体的线性化和制备目的基因片段 1. 取一个灭菌的 Eppendorf 管,依此加入下列试剂: 双蒸馏无菌水 10×缓冲液 质粒 pUC118 BamHI EcoRI 总体积 2. 取一个灭菌的 Eppendorf 管,依此加入下列试剂: 双蒸馏无菌水 10×缓冲液 BamHI Eco 总体积 3.用手指轻弹管壁,使各种试剂混匀,快速离心,以集中溶液。 4. 置 37℃水浴 60~120 分钟。 5. 加入 溴酚蓝指示剂点样缓冲液,按实验三方法电泳,观察酶切反应结果, 鉴定酶切效果。 6.用干净的手术刀从琼脂糖凝胶中分别割下含有 3.2 kb DNA 条带(pUC118)
《生物技术制药》实验指导和1.0kbDNA条带(目的DNA)的琼脂块,各自放入灭菌的Eppendorf管中7按每100mg琼脂糖凝胶中加入4001SolubizationSolution和101SilverBeads(使用前充分混匀),50~60℃水浴中10分钟,使胶彻底融化,溶胶过程每两分钟混匀一次。8.10,000r/min高速离心1分钟,小心吸掉上清。9.用5001WashSolution将SilverBeads悬浮起来,10,000r/min高速离心1分钟。10小心吸掉上清,用5001WashSolution将SilverBeads悬浮起来,10,000r/min高速离心1分钟。11.小心吸掉上清,Eppendorf管倒置,室温干燥10分钟,不要使Beads完全干燥。12.用201ElutionBuffer或水(pH>7.0)将SilverBeads悬浮起来,室温或37℃放置5~10分钟。中途混匀若干次。13.10,000r/min高速离心1分钟,小心将洗脱液移到灭菌的Eppendorf管中,注意不要吸取Beads。14,10,000r/min高速离心1分钟,除去洗脱被中可能存在的微量的Beads。(二)连接反应1.取一个灭菌的Eppendorf管,依此加入下列试剂:81双蒸馏无菌水2110×连接酶缓冲液31pUC118/BamHI6 1目的DNA21
《生物技术制药》实验指导 21 和 1.0kb DNA 条带(目的 DNA)的琼脂块,各自放入灭菌的 Eppendorf 管中。 7.按每l00mg琼脂糖凝胶中加入 和 (使用前充分混匀),50~60℃水浴中 10 分钟,使胶彻底融化,溶胶过程每两分钟混 匀一次。 8.10,000r/min 高速离心 l 分钟,小心吸掉上清。 9.用 将 Silver Beads 悬浮起来,10,000r/min 高速离心 l 分 钟。 10.小心吸掉上清,用 将 Silver Beads 悬浮起来,10,000r/min 高速离心 1 分钟。 11.小心吸掉上清,Eppendorf 管倒置,室温干燥 10 分钟,不要使 Beads 完全干 燥。 12.用 或水(pH﹥7.0)将 Silver Beads 悬浮起来,室温或 37℃放置 5~10 分钟。中途混匀若干次。 13.10,000r/min 高速离心 1 分钟,小心将洗脱液移到灭菌的 Eppendorf 管中,注 意不要吸取 Beads。 14.10,000r/min 高速离心 1 分钟,除去洗脱被中可能存在的微量的 Beads。 (二)连接反应 1.取一个灭菌的 Eppendorf 管,依此加入下列试剂: 双蒸馏无菌水 10×连接酶缓冲液 pUC118/BamHI 目的 DNA
《生物技术制药》实验指导T4DNA连接酶11总体积2012.用手指轻弹管壁,使各种试剂混匀,快速离心,以集中溶液。3.置16℃水浴12~16小时。4.将连接反应液转化大肠杆菌DH-5感受态细胞(具体方法见实验一)。5.制备含氨苄青霉素的LB平板,于平板表面加401X-gal和401IPTG,并用无菌三角爬将试剂均匀涂布于整个平板表面。6,取2001转化的菌液涂布于平板表面,37℃倒置平板培养20~24小时。7.观察平板上长出的菌落,蓝色菌落为载体自连转化子,白色菌落为重组DNA转化子。8.挑取白色菌落于3ml液体LB培养基(含50g/ml氨苄青霉素)中,37℃摇床培养16~20小时,提取质粒,用BamHI+EcoRI酶切分析进一步鉴定。。22
《生物技术制药》实验指导 22 T4DNA 连接酶 总体积 2.用手指轻弹管壁,使各种试剂混匀,快速离心,以集中溶液。 3. 置 16℃水浴 12~16 小时。 4. 将连接反应液转化大肠杆菌 DH- 感受态细胞(具体方法见实验一)。 5.制备含氨苄青霉素的 LB 平板,于平板表面加 -gal 和 ,并 用无菌三角爬将试剂均匀涂布于整个平板表面。 6.取 转化的菌液涂布于平板表面, 37℃倒置平板培养 20~24 小时。 7.观察平板上长出的菌落,蓝色菌落为载体自连转化子,白色菌落为重组 DNA 转化子。 8.挑取白色菌落于 3ml 液体 LB 培养基(含 氨苄青霉素)中,37℃摇 床培养 16~20 小时,提取质粒,用 BamHI + EcoRI 酶切分析进一步鉴定