核酸和蛋白的直观对比 MW:340D MW:128D Amino acid 3 attachment site Hydrogen bonds between paired bases 70-90NT MW:3.9-4.5MD MW:30KD
核酸和蛋白的直观对比 MW：340D MW：128D 70-90 NT MW：30KD MW： 3.9-4.5MD
二、蛋白质组学的研究内容 结构蛋白质组学 对所有蛋白质的结构（1级、2级、3级、4级)进行测定、分析、预测 表达蛋白质组学 对所有蛋白质进行分离、识别和定位，构建全蛋白质表达谱 功能蛋白质组学 研究蛋白质的翻译后修饰、结构、定位和表达与功能间的关系，构建蛋 白质功能网络 1、蛋白质的分离与鉴定 2、蛋白质互作或蛋白质复合体研究 3、蛋白质翻译后修饰分析 4、蛋白质功能鉴定研究 5、蛋白质复合体整体结构分
二、蛋白质组学的研究内容 结构蛋白质组学 对所有蛋白质的结构（1级、2级、3级、4级）进行测定、分析、预测 表达蛋白质组学 对所有蛋白质进行分离、识别和定位，构建全蛋白质表达谱 功能蛋白质组学 研究蛋白质的翻译后修饰、结构、定位和表达与功能间的关系，构建蛋 白质功能网络 1、蛋白质的分离与鉴定 2、蛋白质互作或蛋白质复合体研究 3、蛋白质翻译后修饰分析 4、蛋白质功能鉴定研究 5、蛋白质复合体整体结构分析
三、蛋白质组学研究的技术手段 。X射线衍射 Intact cell or tissue 。冷冻电镜 Cell lysis 2-D gel Mixture of 。核磁共振 image proteins Protein LC profle 2-D gels 处 Protein LC Extract Collect 。质谱分析 spot faction Trypsin digeston Individual protein Differential Peptide 。双向电泳 LC profile label LC profile Trypsin Trypsin digeston d gestion Mixture of peptides Electrospray Electrospray or MALDI or MALDI Mass Mass spectrum Gas-phase fragmentation MS/MS Protein spectrum Quantitative Identification Compe8佬ftd%
三、蛋白质组学研究的技术手段 ⚫ X射线衍射 ⚫ 冷冻电镜 ⚫ 核磁共振 ⚫ 质谱分析 ⚫ 双向电泳
第二节蛋白质的大规模分离鉴定技术 一、蛋白质二维电泳-质谱技术 (一)蛋白质二维电泳技术2-DE First Dimension: Second Dimension: Denaturing isoelectric SDS polyacrylamide focusing in presence of urea.Nonidet NP-40 gel rod rebuffered gel electrophoresis in discontinuous gradient gel in vertical gel rod in SDS buffer sample pH 3 e PH 10 pH 10 IEF SDS-PAGE 田 Separation acc.to Separation acc.to Isoelectric Points (charge) Molecular Weight(mass)
第二节 蛋白质的大规模分离鉴定技术 一、蛋白质二维电泳-质谱技术 （一）蛋白质二维电泳技术2-DE IEF SDS-PAGE
蛋白质的结构 (a)Primary structure 蛋白质是两性电解质，在不同PH下所 Carboxyl end 带的电荷不同：等电聚焦EF 蛋白质的分子量和分子形状不同，电 (b)Secondary structure 泳迁移率不同：SDS-PAGE Amino Acid 片 0 Hydrogen bonds between o helix N -C- amino acids at different 0-H locations in polypeptide chain H-C-H Pleated sheet (c)Tertiary structure (d)Quaternary structure H Heme B R Heme group B polypeptide
蛋白质的结构 蛋白质是两性电解质，在不同PH下所 带的电荷不同：等电聚焦IEF 蛋白质的分子量和分子形状不同，电 泳迁移率不同：SDS-PAGE