第一节:蛋白质结构组织层次 0八一、蛋白质的结构特征 (二)二级结构 3.B转角 β转角 (B-turn)常发生于多肽链180°回折时 的转角上,通常由4个氨基酸残基构成,借1、4 残基之间形成氢键(图4-4),可以形成一个紧密 的环,使β转角成为比较稳定的结构。 4.无规卷曲 图441、4残基之间的氢键 Mathews et al.,2000)
一、蛋白质的结构特征 第一节:蛋白质结构组织层次 7 (二)二级结构 3.β 转角 β 转角(β-turn)常发生于多肽链 180° 回折时 的转角上,通常由 4 个氨基 酸残基构成,借 1、4 残基之间形成氢键(图 4-4),可以形成一个紧密 的环,使 β 转角成为比 较稳定的结构。 4.无规卷曲
第一节:蛋白质结构组织层次 0八一、蛋白质的结构特征 (三)超二级结构、结构域 超二级结构是指相邻的二级结构单元组合在一起 彼此相互作用,排列形成规则的、在空间结构上 能够辨认的二级结构组合体,同时充当三级结构 的构件(building block) ,其基本形式有aa、BB 和BaB等(图4-5) 图45蛋白质的超二级结构 (a)aa:(b)3:(c)Ba3:(d)3曲折:(e)回形拓扑结构 8
一、蛋白质的结构特征 第一节:蛋白质结构组织层次 8 (三)超二级结构、结构域 超二级结构是指相邻的二级结构单元组合在一起, 彼此相互作用,排列形成规则的、在空间结构上 能够辨认的二级结构组合体,同时充当三级 结构 的构件(building block),其基本形式有 αα、ββ 和 βαβ 等(图 4-5)
第一节:蛋白质结构组织层次 00M0八 一、蛋白质的结构特征 (三)超二级结构、结构域 结构域是在超二级结构的基础上形成的三级结构 的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实 通常由50~300个氨基酸残基组成,其特点 三维空间可以明显区芬和相对独立: 并且 定的生物功能。模体(motif)是结构域的 有单常 苌度可以从几个氨基酸到几千个氨基酸通 1~3个二级结构单位组成,一般为α螺旋、 在一位由折2 叠和环(loop)。玄 酸大的蛋白质分子一搬般含 个以上的结构域,其间以柔性的铰链 (hinge)相 连,以便相对运动 9
一、蛋白质的结构特征 第一节:蛋白质结构组织层次 9 (三)超二级结构、结构域 结构域是在超二级结构的基础上形成的三级结构 的局部折叠区,它是相对独立的紧密球 状实体, 通常由 50~300 个氨基酸残基组成,其特点是在 三维空间可以明显区分和相对独立, 并且具有一 定的生物功能。模体(motif)是结构域的亚单位, 长度可以从几个氨基酸到几十 个氨基酸,通常由 1~3 个二级结构单位组成,一般为 α 螺旋、β 折 叠和环(loop)。较大的蛋 白质分子一般含有 2 个以上的结构域,其间以柔性的铰链(hinge)相 连,以便相对运动
第一节:蛋白质结构组织层次 000八 一、蛋白质的结构特征 四)三级结构 三级结构(tertiary structure) 是指整条多肽链的 三维结构,包括骨架和侧链在内的所有原子的空 间排列。三级结构是在二级结构的基础上进一步 盘绕、折叠,通过氨基酸侧链之间的疏水相互作 用、氢键、范德瓦耳斯力和静电作用形成并维持 的。如果蛋白质分子仅由一条多肽链组成,三级 结构就是它的最高结构层次。 0
一、蛋白质的结构特征 第一节:蛋白质结构组织层次 1 0 (四)三级结构 三级结构(tertiary structure)是指整条多肽链的 三维结构,包括骨架和侧链在内的所有原 子的空 间排列。三级结构是在二级结构的基础上进一步 盘绕、折叠,通过氨基酸侧链之间的 疏水相互作 用、氢键、范德瓦耳斯力和静电作用形成并维持 的。如果蛋白质分子仅由一条多 肽链组成,三级 结构就是它的最高结构层次
第一节:蛋白质结构组织层次 000以- 一、蛋白质的结构特征 (五)四级结构 四级结构(quaternary structure)是指在亚基和亚 基之间通过疏水作用等次级键结合成为有序排列 的特定的空间结构。亚基通常由一条多肽链组成, 虽然具有二级、三级结构,但是在单独存在时并 没有生物学功能,只有完整的四级结构才具有生 物学功能。例如,血红蛋白的四级结构(图4-6 是由4个亚基(多肽链)构成,每个亚基单独存 在时一般没有生物活性 1 1
一、蛋白质的结构特征 第一节:蛋白质结构组织层次 1 1 (五)四级结构 四级结构(quaternary structure)是指在亚基和亚 基之间通过疏水作用等次级键结合成为 有序排列 的特定的空间结构。亚基通常由一条多肽链组成, 虽然具有二级、三级结构,但是在单独存在时并 没有生物学功能,只有完整的四级结构才具有生 物学功能。例如,血红蛋 白的四级结构(图 4-6) 是由 4 个亚基(多肽链)构成,每个亚基单独存 在时一般没有生物 活性