cDNA-microarrays high-density oligonucleotide arrays mRNA reference sequence uoneredaId cDNA collection HHH田 perfect match mismatch probe set insert amplification by PCR vector specific prmers gene specfic primers in situ synthesis aqoId by photolithography printing coupling denaturing ratio Cy5/Cy3 ratio array 1/array 2 staining fragmented hybridization hybridization mixing biotin labeled uoneredaId 1o3me cRNA Cy3 Cy5 (generated using T7 promoter) Cy3 or Cy5 in vitro transcription labeled cDNA double-stranded cDNA modified oligodT cDNA synthesis CDNA synthesis (generated using T7 primer) total RNA total RNA cells/tissue cells/tissue
两种类型芯片 寡核苷酸芯片 cDNA芯片 通道数 单通道 双通道 探针类型 25nt CDNA长度 片段长度(全局) 基本都是25nt 基本上是每个基因cDNA的长度 基因重复 很普遍 一般没有 集成度 高 低 探针制作 原位合成 纯化探针,喷墨打印 精确度 高 低 非特异性杂交 可控制 难控制 结果输出 荧光强度 表达变化率 芯片制作 商业,自行合成昂贵 可自行制造
两种类型芯片 寡核苷酸芯片 cDNA芯片 通道数 单通道 双通道 探针类型 25nt cDNA长度 片段长度(全局) 基本都是25nt 基本上是每个基因cDNA的长度 基因重复 很普遍 一般没有 集成度 高 低 探针制作 原位合成 纯化探针,喷墨打印 精确度 高 低 非特异性杂交 可控制 难控制 结果输出 荧光强度 表达变化率 芯片制作 商业,自行合成昂贵 可自行制造
1.基因芯片简介 。组织芯片技术是近年来基因芯片(DNA芯片)技术 的发展和延伸,与细胞芯片、蛋白芯片、抗体芯 片一样,属于一种特殊生物芯片技术。 。组织芯片技术可以将数十个甚至上千个不同个体 的临床组织标本按预先设计的顺序排列在一张玻 片进行分析研究,是一种高通量、多样本的分析 工具。 ·芯片技术是近年来发展势头非常强劲的一门实验 技术,无论在genome水平,还是transcriptome 和proteome水平,芯片技术都得到应用
1. 基因芯片简介 组织芯片技术是近年来基因芯片(DNA芯片)技术 的发展和延伸,与细胞芯片、蛋白芯片、抗体芯 片一样,属于一种特殊生物芯片技术。 组织芯片技术可以将数十个甚至上千个不同个体 的临床组织标本按预先设计的顺序排列在一张玻 片进行分析研究,是一种高通量、多样本的分析 工具。 芯片技术是近年来发展势头非常强劲的一门实验 技术,无论在genome水平,还是transcriptome 和proteome水平,芯片技术都得到应用
荧光标记的样品 共聚焦显微镜 基因芯片 获取荧光图象 杂交 探针设计 杂交结果分析
基因芯片 荧光标记的样品 共聚焦显微镜 获取荧光图象 杂交结果分析 探 针 设 计 杂交
基因芯片原理 DNA clones test reference excitation 笑入 laser 1 laser 2 reverse transcription label with emission fluor dyes PCR amplification purification 效蛇 robotic printing computer hybridize target analysis to microarray
基因芯片原理