两类主流的DNA芯片 (1).CDNA microarrays:将500~5,000bp的 cDNA固载到介质上(例如玻璃)。 Stanford开发设计,通常为双通道,常用于差异 表达基因的筛选。 CDNA芯片是被众多实验室生产自己的芯片所使 用的一门技术,因为采用双色标记杂交于同一 芯片的技术,因而易于标准化和鉴定DEG
(1). cDNA microarrays: 将500~5,000bp的 cDNA固载到介质上 (例如玻璃)。 Stanford开发设计,通常为双通道,常用于差异 表达基因的筛选。 cDNA芯片是被众多实验室生产自己的芯片所使 用的一门技术,因为采用双色标记杂交于同一 芯片的技术,因而易于标准化和鉴定DEG。 两类主流的DNA芯片
(1)cDNA microarrays cDNA clones 载玻片 8888888888 8888888888 8888888888
载玻片 cDNA clones (1) cDNA microarrays
差异表达基因的筛选 A Comparative Hybridization Experiment Treatment /control ※2这 6 Normal /tumor tissue Brain /liver 这3效 荧光标记的靶基因 4 5 Copyright 1998-9 by Jeremy Buhler
Treatment / control Normal / tumor tissue Brain / liver … 荧光标记的靶基因 差异表达基因的筛选
两类主流的DNA芯片 (2).DNA chips:将寡核苷酸探针(20~80-mer) 合成到芯片上。Affymetrix开发设计,通常为 单通道,一次检验一种状态。 寡聚核酸芯片是Afy公司原创的,通过原位合 成技术制作,对芯片制作工艺技术要求很高, 具有分辨率高,均一性好等优点,用于做 classification等效果非常好,也很方便于通过 统计学进行差异表达基因(DEG)筛选
(2). DNA chips: 将寡核苷酸探针 (20~80-mer) 合成到芯片上。Affymetrix开发设计,通常为 单通道,一次检验一种状态 。 寡聚核酸芯片是Affy公司原创的,通过原位合 成技术制作,对芯片制作工艺技术要求很高, 具有分辨率高,均一性好等优点,用于做 classification 等效果非常好,也很方便于通过 统计学进行差异表达基因(DEG)筛选。 两类主流的DNA芯片
(2)DNA chips A Probe Set (DNA Chip) Perfect Match- Mismatch Perfect Match AGGCTATCGCACTCCAGTGG Mismatch AGGCTATCGTACTCCAGTGG
(2) DNA chips