生物医学工程导论 第十八章生物信息学导论
第十八章 生物信息学导论 生物医学工程导论
背景 ·人类基因组计划(Human Genome Project,HGP): 1990年正式启动，旨在完成人类基因组约30亿个 碱基的全序列测定 海量生物数据的迅速膨胀：DNA、RNA和蛋白质 序列，蛋白质二级结构和三维结构数据，蛋白质相 互作用数据等 ● 对大量生物数据的管理、分析和信息化需求促进 了生物信息学的迅速发展
背景 人类基因组计划(Human Genome Project, HGP)： 1990年正式启动，旨在完成人类基因组约30亿个 碱基的全序列测定。 海量生物数据的迅速膨胀：DNA、RNA和蛋白质 序列，蛋白质二级结构和三维结构数据，蛋白质相 互作用数据等。 对大量生物数据的管理、分析和信息化需求促进 了生物信息学的迅速发展
人类基因组计HGP(Human Genome Project) 由美国NIH和能源部提出和带头，美、英、德、 法、日、中共同参与的国际合作项日。 重大国际研究项目：测定人类基因组全部DNA序 列，构建人类基因组遗传图谱和物理图谱。 1990年：正式启动，30亿美元. ·2001年：人类基因组草图公开发表。 ·2003年：美国宣布该项目完成
人类基因组计划HGP (Human Genome Project) 由美国NIH和能源部提出和带头，美、英、德、 法、日、中共同参与的国际合作项目。 重大国际研究项目：测定人类基因组全部DNA序 列，构建人类基因组遗传图谱和物理图谱。 1990年： 正式启动，30亿美元。 2001年：人类基因组草图公开发表。 2003年：美国宣布该项目完成
人类基因组计划 基因组图谱：遗传图谱，物理图谱 遗传图谱(genetic map):连锁图谱，显示所知的 基因和/或遗传标记的相对距离位置与次序。 物理图谱(physical map):表示某些基因和/或遗传 标记之间在基因组上的精确位置和距离（如间隔的 bp数目)的图谱
人类基因组计划 基因组图谱：遗传图谱，物理图谱 遗传图谱(genetic map)：连锁图谱，显示所知的 基因和/或遗传标记的相对距离位置与次序。 物理图谱(physical map):表示某些基因和/或遗传 标记之间在基因组上的精确位置和距离（如间隔的 bp数目）的图谱
生物信息学定义的历史演变 定义一：生物信息学是一门收集、分析遗传数据以 及分发给研究机构的新学科。(Dr.HwaA.Lim, 1987) 定义二：生物信息学特指数据库类的工作，包括持 久稳固的在一个稳定的地方提供对数据的支持。(Dr. Hwa A.Lim,1994) 定义三：生物信息学是在大分子方面的概念型的生 物学，并且使用了信息学的技术，这包括了从应用 数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种 方法，并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分 子相关的信息。(Luscombe,2001)
生物信息学定义的历史演变 定义一：生物信息学是一门收集、分析遗传数据以 及分发给研究机构的新学科。(Dr. Hwa A. Lim， 1987) 定义二：生物信息学特指数据库类的工作，包括持 久稳固的在一个稳定的地方提供对数据的支持。(Dr. Hwa A. Lim，1994) 定义三：生物信息学是在大分子方面的概念型的生 物学，并且使用了信息学的技术，这包括了从应用 数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种 方法，并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分 子相关的信息。 (Luscombe,2001)