基因组文库
基因组文库
具有代表性的基因大库 ◆基因文库一是来自于某种生物的不同 DNA序列的集合 ■基因组文库一用于构建文库的DNA来源于基 因组DNA CDNA一用于构建文库的DNA是mRNA群体的 拷贝(CDNA),则该文库称之为CDNA文库 ◆具有代表性的基因文库应该在最大限度 上覆盖所有的原始序列
具有代表性的基因文库 基因文库—是来自于某种生物的不同 DNA序列的集合 n 基因组文库—用于构建文库的DNA来源于基 因组DNA n cDNA—用于构建文库的DNA是mRNA群体的 拷贝(cDNA),则该文库称之为cDNA文库 具有代表性的基因文库应该在最大限度 上覆盖所有的原始序列
文库大小 ◆以最大可能可获得某一特定序列的基因文库 所必须包含的重组体数的计算方式如下 N=In(1-p/In(l-f) P一给定的概率,f插入片段大小占总基因组大小的 比例 如果给定概率为0.99,插入片段为20kb的情况下, 对人类基因组(3X109bp)来说,所需重组体的 数目为69X105;而对于大肠杆菌而言,仅需要 1100个重组体
文库大小 以最大可能可获得某一特定序列的基因文库 所必须包含的重组体数的计算方式如下 N=ln(1-p)/ln(1-f) P—给定的概率,f—插入片段大小占总基因组大小的 比例 如果给定概率为0.99,插入片段为20kb的情况下, 对人类基因组(3Χ109bp)来说,所需重组体的 数目为6.9 Χ 105;而对于大肠杆菌而言,仅需要 1100个重组体
◆因此,插入大小仅有5-10kp的质粒就可 以很妤地构建原核生物的基因组文库, 因为只需要几千个重组体就够了 ◆而对于较大的基因组,较大的插入片段 可以使所需的重组体数量减少,这也正 是开发黏粒以及YAC载体的原因
因此,插入大小仅有5-10kp的质粒就可 以很好地构建原核生物的基因组文库, 因为只需要几千个重组体就够了 而对于较大的基因组,较大的插入片段 可以使所需的重组体数量减少,这也正 是开发黏粒以及YAC载体的原因
基因组DNA ◆为了构建具有代表性的基因文库,必须将纯化 后的基因组DNA进行随机切割,产生适合克隆 进所有载体的大小合适的片段 ◆真核生物基因组DNA的提取 提取细胞核一为了防止器官(叶绿体、线粒体) DNA的污染 蛋白酶降解及分相抽提一去除蛋白质、脂类以及其 他的大分子条质 ◆原核细胞基因组DNA的提取 直接抽提DNA
基因组DNA 为了构建具有代表性的基因文库,必须将纯化 后的基因组DNA进行随机切割,产生适合克隆 进所有载体的大小合适的片段 真核生物基因组DNA的提取 n 提取细胞核—为了防止器官(叶绿体、线粒体) DNA的污染 n 蛋白酶降解及分相抽提—去除蛋白质、脂类以及其 他的大分子杂质 原核细胞基因组DNA的提取 n 直接抽提DNA