集合m 序列4 序列4 dm 序列5 dns d45 集合l 序列3 序列3 dns 集合m di d3m
2、实例 设有4段序列,分别为A:TAGG:B:TACG:C:AAGC:D:AGCC。利用UPGMA方法构建 系统发育树。 A B C B 1 C 2 3 D 4 3 2 AB C C 2.5 D 3.5 2
2、实例
A B C D 1.5 1.0 0.5 0.0 图9-3 利用UPGMA发方法构建的系统发育树
(二)最小二乘法 70 Rs (dii-eij)2 =min i=1j≠i 70 Rs Wi (di-e)2 i=1j≠i
(二)最小二乘法
2、实例 表9-1 Brown等所测线粒体DNA序列的成对距离 人 黑猩猩 大猩猩 黑猩猩 0.0965 大猩猩 0.1140 0.1180 猩猩 0.1849 0.2009 0.1947 人 大猩猩 h 13 to t X 黑猩猩 4 猩猩
2、实例