2018/12/16 想一想 想一想 ·真核生物的RNA聚合酶的特点? ,古生白动子的站均 ·要整告物染色件因的转录发生在细照的什 ·真核生物转录是怎样起始的? ·高撕酷种交鲁练基因的转录主要发生在细脂 原核生物转录产物的后加工 Pre-RNA processing in Prokaryotes NA:不加工,转录翻译偶联。 (基因表达调控 tRNA、rRNA:需要加工,比较稳定半表期几小时 常见RNA中的修饰核苷酸 2)去尾,形成.OI末填。缺CCA的RNA要用RNA核酸转 幕魔加CCA。 ③修饰:速过甲基化麻,硫略降,假果嗜定核背化麻等进行 如氨盖酸背的4硫果背(4m),D臂的2甲基乌背(2mG) TyC臂的根尿苷(w)和反壶码子环上的2异戊膝苷(2ipA) 1
2018/12/16 1 • 真核生物的RNA聚合酶的特点? • 真核生物启动子的结构? • 真核生物转录是怎样起始的? 想一想 想一想 真核生物染色体基因的转录发生在细胞的什 么部位? 真核生物染色体基因的转录主要发生在细胞 周期的什么时期? 原核生物转录产物的后加工 Pre-RNA processing in Prokaryotes mRNA:不加工,转录翻译偶联。 原核细胞的mRNA半衰期只有几分钟(基因表达调控 的一种手段) tRNA、rRNA:需要加工,比较稳定 半衰期几小时 tRNA的加工分成3个阶段 (1) 斩头,形成5′末端; (2) 去尾,形成3′-OH末端。缺-CCA的tRNA要用tRNA核酸转 移酶加-CCA。 (3)修饰:通过甲基化酶,硫醇酶,假尿嘧啶核苷化酶等进行 修饰 如氨基酸臂的4-硫尿苷(4tu),D臂的2甲基鸟苷(2mG), TψC臂的假尿苷(ψ)和反密码子环上的2异戊腺苷(2ipA) 常见tRNA中的修饰核苷酸 Cmnm5U (5-羧甲基氨甲基尿苷) mCm5U (5-甲氧基羰甲基尿苷) Xm5s2U (5-甲基-2硫代尿苷) K2C (2-赖氨酸胞苷) Com5U (5(2)-羟羧甲基尿苷) I (Inosine次黄嘌呤) m7G (7-甲基尿苷) m5C (5-甲基胞苷) m6A (6-甲基腺苷) s2C (2-硫代胞苷) ψ (假尿苷) Um (2’-O-甲基尿苷) Q (Queuosine) Xo5U (5-羟基尿苷) OH OH NH CH2 H2N R
2018/12/16 一、RNA的转录后加工 1、前体的切制 第四节真核生物转录后加工 主体rRNA基因(5.8S、18S、28 SrDNA)组成一个转录单元 45S前体 Pre-RNA processing in Eukaryote 47S前体 2、饰 新德专定(enoRNA)渗与RMA的化学修特和切 3、内含子切除 二、tRNA的转录后加工 ·1、切制 ·2、修饰,3加CCA,核苷酸修饰,如 甲基化等 ·3、内含子切除 三、mRNA的转录后加工 1.5加相 2、3了加尾,加尾识别倍号 3、内含子切除 Ho -0-P-0 -O-Ch OHOHOH 2
2018/12/16 2 第四节 真核生物转录后加工 Pre-RNA processing in Eukaryotes 一、rRNA的转录后加工 1、前体的切割 主体rRNA基因(5.8S、18S、28SrDNA)组成一个转录单元 47S前体 45S前体 2、修饰: 核仁RNA(snoRNA)参与RNA的化学修饰和切 割位点确定 3、内含子切除 二、tRNA的转录后加工 • 1、切割 • 2、修饰,3’加CCA,核苷酸修饰,如 甲基化等 • 3、内含子切除 三、mRNA的转录后加工 1、5’加帽,mRNA一出生就进行带帽反 应 2、3’加尾,加尾识别信号 3、内含子切除 1. 5’加帽
2018/12/16 一《共有初 mGN-甲苷 子1(cap-1) m'GpppXmpYp- 第一个核職的2-0位上产生甲盖 化(A样位甲盖化) W子2(Cap2) m7GpppXmpYmp 第二个核的20位上产生甲 化 图1的A销生有=N写有三带不州g后千行将 其中 女单细真被生物只有Cap0 ☆ 女Cp-一1悬其余真横生物的主要帽子形式 ★C即一2存在于某些真核生物中 甲基供体和璃: 女甲基供体:S一肆苷甲硫酸(SAM) 女甲基转移确 女鸟苷酸装移-一帽(capping onzymo) 2、加多聚(A)尾巴 W-约长20Obp(大多Euk的mRNA))poly(A) 加多聚(A)尾巴 多核糖核酸+nATP 意多菜技精服An+nPP 识别位点(有其它因子参与): 切点上游13一20bp处的AAUAAA 切点下游的GUGUGUG(单细胞Euk除外) 近研究发现,原生物的RNA也有3漆加POA的 3
2018/12/16 3 HN—CH3 m7G 帽子0 帽子0(Cap-0) m7GpppXpYp-(共有) m7G N7—甲基鸟苷 帽子1 (Cap-1) m7GpppXmpYp- 第一个核苷酸的 2’-O 位上产生甲基 化 (A N6 位甲基化) 帽子2(Cap-2) m7GpppXmpYmp 第二个核苷酸的 2’-O 位上产生甲基 化 其中: ☆ 单细胞真核生物只有 Cap—0 ☆ Cap—1 是其余真核生物的主要帽子形式 ☆ Cap—2 存在于某些真核生物中 甲基供体和酶: ☆ 甲基供体: S—腺苷甲硫氨酸(SAM) ☆ 甲基转移酶 ☆ 鸟苷酸转移酶-戴帽酶(capping enzyme) 2、加多聚(A)尾巴 3’端-约长200bp (大多数Euk.的mRNA) poly(A)+ 最近研究发现,原核生物的RNA也有3’添加poly(A) 的现象 RNA末端腺苷酸转移酶或poly(A) 聚合酶 多聚核糖核酸 + nATP 多聚核糖核酸(A)n + nPPi Mg++ 或 Mn++ 加多聚(A)尾巴 切点上游 13-20bp处的 AAUAAA 切点下游的 GUGUGUG (单细胞Euk.除外) 识别位点(有其它因子参与):
2018/12/16 加位点 第六节真核生物转录产物中内含子的去除 Intron removing in Eukaryote 一、概述 RNA剪接(RNA splicing),切除内含子连接外显子,形成 N暴基因(split gene): 成感RNA的过程 内含子(Kintron): 外显子(excon): 剪接点:5拼接点或左剪接点(内含子上游) 拼接点或右接点(下菌 2.内含子的类别 在郁 3、剪接方式 方式一!由剪接体完成(核mRNA) nRNA前体 I类内含子 细胞核 A体、细孢春RA、 方式二1自我剪接(两类内含子1、Ⅱ) 立类内子 细胞质 体叶绿体RNA部分 方式三:需要蛋白质离参与的剪接接(酵母RNA) 发密料环上 各种内含子的边界各有一定的保守序列特征
2018/12/16 4 添加位点 第六节 真核生物转录产物中内含子的去除 Intron removing in Eukaryote 一、概述 1、 概念 割裂基因(split gene): 内含子(intron): 外显子(excon): RNA剪接(RNA splicing):切除内含子连接外显子,形成 成熟RNA的过程 剪接点: 5’ 拼接点或左剪接点(内含子上游) 3’ 拼接点或右剪接点(.下游) 内含子类型 存在部位 所在分子 GU-AG(chambon 法则) 细胞核 mRNA前体 AU-AC 细胞核 mRNA前体 Ⅰ类内含子 细胞核 rRNA前体、细胞器RNA、 少数细菌RNA Ⅱ类内含子 细胞质 线粒体和叶绿体RNA,部分 细菌RNA III类内含子 细胞质 线粒体和叶绿体RNA tRNA内含子 细胞核 tRNA前体(均位于 tRNA 的 反密码环上) 2.内含子的类别 各种内含子的边界各有一定的保守序列特征 3、剪接方式 方式一:由剪接体完成(核mRNA) 方式二:自我剪接(两类内含子Ⅰ 、Ⅱ ) 方式三:需要蛋白质酶参与的剪接接(酵母tRNA)
2018/12/16 二、核基因mRNA的前接机制(Splicing mochanism】 剪接与其他加工同时进行 L.核mRNA内含子的结构特点 1)Chamboa rule(GU一AG规则) .接mRNA内含子的结构特点 2.剪接体组装 玉.两步转酯反应 2)7碱基分支点 处新高整配有小的整变成另一 3剪接点的上游1850b处保守序列(富含吨定) Pu,任藏票吟 2.剪接体(spliceosome)的形戒:60s 5种核小分子RNA和约150种蛋白 疾12山参与成NA背体有淡的nRNP 里 8g 3.通过两步转酯完成剪接 ●第一次转酯:分支点A2”OH攻击内含子的5拼按点 ●第二次转:上谢外显子3-0H攻击内含子3剪换点 2一2 类内含子的剪接机村 5
2018/12/16 5 1. 核mRNA内含子的结构特点 2. 剪接体组装 3. 两步转酯反应 转酯反应 将一处已有的磷酸二酯键转变成另一 处新的磷酸二酯键,不需要额外的能量 二、核基因mRNA的剪接机制(Splicing mechanism ) 剪接与其他加工同时进行 1)Chambon rule (GU-AG规则) 5’-exon- GU-intron-AG -exon-3’ 供点 100% 94% 受点 2) 7碱基分支点 3’剪接点的上游 18~50bp处保守序列(富含嘧啶): Py 80N Py87 U Pu75 A Py95 Py:任意嘧啶 Pu:任意嘌呤 1. 核mRNA内含子的结构特点 2.剪接体(spliceosome)的形成:60s 5种核小分子RNA和约150种蛋白 lariat ● 第一次转酯:分支点A 2’-OH攻击内含子的 5’拼接点 ● 第二次转酯:上游外显子3’-OH攻击内含子3’剪接点 3.通过两步转酯完成剪接 Ⅰ类内含子的剪接机制 p 3’ HO-G p 3’ p P-G OH p P-G 3‘ HO Mg 2+或Mn 2+ GMP,GDP,GTP 外显子 内含子 5‘