(二)质粒DNA的制备 有多种分离质粒的方法,如碱裂解 法、煮沸裂解法、层析柱过滤法等。 目前一般使用碱变性法制备质粒 DNA。这个方法主要包括培养收集细菌 菌体,裂解细胞,将质粒DNA与染色体 DNA分开及除去蛋白质和RNA。 1山
11 (二)质粒DNA的制备 有多种分离质粒的方法,如碱裂解 法、煮沸裂解法、层析柱过滤法等。 目前一般使用碱变性法制备质粒 DNA。这个方法主要包括培养收集细菌 菌体,裂解细胞,将质粒DNA与染色体 DNA分开及除去蛋白质和RNA
碱变性法质粒提取的原理: 根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体 DNA片断之间,在拓扑学上的差异而发展出 的。 在pH值12.0~12.5范圆内时,线性的DNA会 被变性而共价闭合环状质粒DNA却不会被变性。 通过冷却或恢复中性H值使之复性,线性染 色体形成网状结构,而CCCDNA可以准确迅速 复性,通过离心去除线性染色体,获得含有 CCCDNA的上清液,景后用乙醇沉淀,获得质 粒DNA。 12
12 碱变性法质粒提取的原理: 根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体 DNA片断之间,在拓扑学上的差异而发展出来 的。 在pH值12.0~12.5范围内时,线性的DNA会 被变性而共价闭合环状质粒DNA却不会被变性。 通过冷却或恢复中性pH值使之复性,线性染 色体形成网状结构,而cccDNA可以准确迅速 复性,通过离心去除线性染色体,获得含有 cccDNA的上清液,最后用乙醇沉淀,获得质 粒DNA
碱变性法提取质粒的步骤: 1、取1.5毫升含质粒的火肠杆菌过夜培养物,如在 微量离心管中,离心收集细胞沉淀; 2、加入100微升冰冷的溶液I,(50mM葡萄糖, 25 nM Tris-HCI PH=8.0,10 mM EDTA)涡旋爱 荡悬浮菌液。 3、加入200微升新配制的溶液Il,(0.2 NaOH, 1.06SDS)缓缓混匀置室温5分钟。 4、加入150毫升冰冷的溶液1IIl,(醋酸钾29.4克, 冰乙酸11.5毫升,加蒸馏水至100毫升)颇倒离心 管10次后,冰浴5分钟。 5、离心的上清液用苯酚抽提数次,用乙醇沉淀收 集质粒DNA。 13
13 碱变性法提取质粒的步骤: 1、取1.5毫升含质粒的大肠杆菌过夜培养物,加在 微量离心管中,离心收集细胞沉淀; 2、加入100微升冰冷的溶液I,(50mM葡萄糖, 25mM Tris-HCl PH=8.0, 10mM EDTA)涡旋震 荡悬浮菌液。 3、加入200微升新配制的溶液II,(0.2M NaOH, 1.0%SDS)缓缓混匀置室温5分钟。 4、加入150毫升冰冷的溶液III,(醋酸钾29.4克, 冰乙酸11.5毫升,加蒸馏水至100毫升)颠倒离心 管10次后,冰浴5分钟。 5、离心的上清液用苯酚抽提数次,用乙醇沉淀收 集质粒DNA
问题: ·1)有些工作者首次进行小量制 备时,有时会发现质粒DNA不 能被限制酶所切割,这几乎总是 由于从细菌沉淀或从核酸沉淀中 去除所有上清液时注意得不够。 14
14 问题: • 1)有些工作者首次进行小量制 备时,有时会发现质粒DNA不 能被限制酶所切割,这几乎总是 由于从细菌沉淀或从核酸沉淀中 去除所有上清液时注意得不够
·大多数情况下,用酚:氯仿对溶 液进行抽提可以去除小量制备物 中的杂质。如果依然存在,可用 离心柱层析法纯化DNA。 15
15 • 大多数情况下,用酚:氯仿对溶 液进行抽提可以去除小量制备物 中的杂质。如果依然存在,可用 离心柱层析法纯化DNA